RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000444916.5

SH3BP4-205, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 570 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-205ENST00000444916 ZMYM3Q14202 1370 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 IQSEC2Q5JU85 1478 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 MROH2AA6NES4 1674 aa22■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 NPATQ14207 1427 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.99■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SH3BP4-205ENST00000444916 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 GGT6Q6P531 493 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC5O15440 1437 aa21.95■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.94■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 DAPK1P53355 1430 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 MYO3AQ8NEV4 1616 aa21.93■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 UBAP1LF5GYI3 381 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF3BO15066 747 aa21.92■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM135AQ9P2D6 1515 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 PTPRKQ15262 1439 aa21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.1
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM5DQ9BY66 1539 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 PLA2R1Q13018 1463 aa21.87■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 KIF15Q9NS87 1388 aa21.86■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 PKD2Q13563 968 aa21.85■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
SH3BP4-205ENST00000444916 ERBINQ96RT1 1412 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.81■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa21.8■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRL2O95490 1459 aa21.79■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.78■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 PZPP20742 1482 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 ABCC3O15438 1527 aa21.77■■□□□ 1.08
SH3BP4-205ENST00000444916 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.77■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 HSPA1LP34931 641 aa21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 DEPDC5O75140 1603 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 PIP4K2BP78356 416 aa21.74■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 CEP152O94986 1710 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.73■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.72■■□□□ 1.07
SH3BP4-205ENST00000444916 TNRQ92752 1358 aa21.7■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 ROCK1Q13464 1354 aa21.66■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 CPS1P31327 1500 aa21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 KANK1Q14678 1352 aa21.64■■□□□ 1.06
SH3BP4-205ENST00000444916 TOM1O60784 492 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.64■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ERVK-7P63135 1459 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.63■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 NLRP1Q9C000 1473 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ALKQ9UM73 1620 aa21.62■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.6■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 ITGAEP38570 1179 aa21.59■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
SH3BP4-205ENST00000444916 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 UNC13BO14795 1591 aa21.57■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.56■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.55■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 MED14O60244 1454 aa21.54■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.53■■□□□ 1.04
SH3BP4-205ENST00000444916 TET3O43151 1660 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 IQGAP1P46940 1657 aa21.51■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.49■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.47■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 SYNMO15061 1565 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 NOS1P29475 1434 aa21.46■■□□□ 1.03
SH3BP4-205ENST00000444916 PIK3C2BO00750 1634 aa21.44■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 NUP155O75694 1391 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 NAIPQ13075 1403 aa21.42■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 E9PCH4 1651 aa21.41■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 HFM1A2PYH4 1435 aa21.39■■□□□ 1.02
SH3BP4-205ENST00000444916 SLIT1O75093 1534 aa21.39■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 IDI1Q13907 227 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.38■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 LTKP29376 864 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 ADGRB3O60242 1522 aa21.37■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.36■■□□□ 1.01
SH3BP4-205ENST00000444916 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.5 ms