RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC37Q6PGP7 1564 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MRS2Q9HD23 443 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 IQGAP3Q86VI3 1631 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PTPRTO14522 1441 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 KIF15Q9NS87 1388 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDCQ9Y266 331 aa5.02□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MROH1Q8NDA8 1641 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC6L2Q5T890 1561 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NEURL4Q96JN8 1562 aa5.01□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DISP3Q9P2K9 1392 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 JPH4Q96JJ6 628 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC2Q92887 1545 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DUOX2Q9NRD8 1548 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa5□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NBPF1Q3BBV0 1214 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NUP155O75694 1391 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOM1P52179 1685 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MADDQ8WXG6 1647 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CLASP1Q7Z460 1538 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 KDM2BQ8NHM5 1336 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 IQGAP1P46940 1657 aa4.99□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NRXN1Q9ULB1 1477 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SYCP2Q9BX26 1530 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ARAP3Q8WWN8 1544 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 DEPDC5O75140 1603 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAPERQ9BY12 1400 aa4.98□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ARID3CA6NKF2 412 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM9BQ8IZU0 186 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ERCC6Q03468 1493 aa4.97□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCC1P33527 1531 aa4.96□□□□□ -1.61
PGGT1B-203ENST00000419445 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP13Q86W25 1043 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NLRP1Q9C000 1473 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPM2O94759 1503 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa4.96□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 BACH2Q9BYV9 841 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ADGRB1O14514 1584 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 USP19O94966 1318 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 NEFLP07196 543 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ERBINQ96RT1 1412 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PIK3C2GO75747 1445 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ERVK-7P63135 1459 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RRP1P56182 461 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PLCH2O75038 1416 aa4.95□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RALBP1Q15311 655 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOC6Q8TAG9 804 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DMRT2Q9Y5R5 561 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC144AA2RUR9 1427 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE3BQ13370 1112 aa4.94□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SKAP1Q86WV1 359 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 C20orf194Q5TEA3 1177 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP27Q5VZP5 1158 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CLTCL1P53675 1640 aa4.93□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 RSPH4AQ5TD94 716 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD11Q9BXL7 1154 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SYNMO15061 1565 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYOM2P54296 1465 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 LMTK2Q8IWU2 1503 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO3AQ8NEV4 1616 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MS4A1P11836 297 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa4.92□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 DCAF11Q8TEB1 546 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 IFT172Q9UG01 1749 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 SHPRHQ149N8 1683 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 PLEKHD1A6NEE1 506 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 C8orf34Q49A92 452 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO5CQ9NQX4 1742 aa4.91□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 ABCA9Q8IUA7 1624 aa4.9□□□□□ -1.62
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD14Q9BXL6 1004 aa4.9□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.4 ms