RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378270.5

EBPL-203, Transcript of EBP like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EBPL, Length 579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBPL-203ENST00000378270 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.31■■■■■ 4.52
EBPL-203ENST00000378270 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.3■■■■■ 4.52
EBPL-203ENST00000378270 C3P01024 1663 aa43.28■■■■■ 4.52
EBPL-203ENST00000378270 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP43.25■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 ROCK1Q13464 1354 aa43.24■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 ZMYM3Q14202 1370 aa43.24■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 PTPRKQ15262 1439 aa43.23■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 KDM5DQ9BY66 1539 aa43.22■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
EBPL-203ENST00000378270 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP43.18■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 PLPPR3Q6T4P5 718 aa43.17■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 NPATQ14207 1427 aa43.16■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa43.15■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 MROH1Q8NDA8 1641 aa43.15■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP43.14■■■■■ 4.5
EBPL-203ENST00000378270 LMTK3Q96Q04 1460 aa43.12■■■■■ 4.49
EBPL-203ENST00000378270 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.12■■■■■ 4.49
EBPL-203ENST00000378270 DEPDC5O75140 1603 aa43.11■■■■■ 4.49
EBPL-203ENST00000378270 PREX1Q8TCU6 1659 aa43.1■■■■■ 4.49
EBPL-203ENST00000378270 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.09■■■■■ 4.49
EBPL-203ENST00000378270 ABCC3O15438 1527 aa43.07■■■■■ 4.48
EBPL-203ENST00000378270 PZPP20742 1482 aa43.03■■■■■ 4.48
EBPL-203ENST00000378270 ITGAEP38570 1179 aa43.02■■■■■ 4.48
EBPL-203ENST00000378270 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa43.01■■■■■ 4.48
EBPL-203ENST00000378270 KANK1Q14678 1352 aa42.99■■■■■ 4.47
EBPL-203ENST00000378270 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.95■■■■■ 4.47
EBPL-203ENST00000378270 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.92■■■■■ 4.46
EBPL-203ENST00000378270 CEP152O94986 1710 aa42.91■■■■■ 4.46
EBPL-203ENST00000378270 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.89■■■■■ 4.46
EBPL-203ENST00000378270 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.89■■■■■ 4.46
EBPL-203ENST00000378270 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.88■■■■■ 4.45
EBPL-203ENST00000378270 UNC13BO14795 1591 aa42.85■■■■■ 4.45
EBPL-203ENST00000378270 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.83■■■■■ 4.45
EBPL-203ENST00000378270 TNRQ92752 1358 aa42.81■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.81■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.8■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.8■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 NAIPQ13075 1403 aa42.78■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 HSPA2P54652 639 aa42.77■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.76■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 HFM1A2PYH4 1435 aa42.76■■■■■ 4.44
EBPL-203ENST00000378270 ERVK-7P63135 1459 aa42.75■■■■■ 4.43
EBPL-203ENST00000378270 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.73■■■■■ 4.43
EBPL-203ENST00000378270 NLRP1Q9C000 1473 aa42.73■■■■■ 4.43
EBPL-203ENST00000378270 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.72■■■■■ 4.43
EBPL-203ENST00000378270 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.72■■■■■ 4.43
EBPL-203ENST00000378270 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.68■■■■■ 4.42
EBPL-203ENST00000378270 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.68■■■■■ 4.42
EBPL-203ENST00000378270 TET3O43151 1660 aa42.67■■■■■ 4.42
EBPL-203ENST00000378270 NUP155O75694 1391 aa42.62■■■■■ 4.41
EBPL-203ENST00000378270 PLA2R1Q13018 1463 aa42.59■■■■■ 4.41
EBPL-203ENST00000378270 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.58■■■■■ 4.41
EBPL-203ENST00000378270 NOS1P29475 1434 aa42.55■■■■■ 4.4
EBPL-203ENST00000378270 STRCQ7RTU9 1775 aa42.55■■■■■ 4.4
EBPL-203ENST00000378270 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.52■■■■■ 4.4
EBPL-203ENST00000378270 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.52■■■■■ 4.4
EBPL-203ENST00000378270 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.48■■■■■ 4.39
EBPL-203ENST00000378270 E9PCH4 1651 aa42.46■■■■■ 4.39
EBPL-203ENST00000378270 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP42.46■■■■■ 4.39
EBPL-203ENST00000378270 PKD2Q13563 968 aa42.45■■■■■ 4.39
EBPL-203ENST00000378270 SYNMO15061 1565 aa42.44■■■■■ 4.39
EBPL-203ENST00000378270 SLC52A1Q9NWF4 448 aa42.43■■■■■ 4.38
EBPL-203ENST00000378270 PTPRTO14522 1441 aa42.43■■■■■ 4.38
EBPL-203ENST00000378270 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP42.41■■■■■ 4.38
EBPL-203ENST00000378270 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.39■■■■■ 4.38
EBPL-203ENST00000378270 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.35■■■■■ 4.37
EBPL-203ENST00000378270 PIK3C2BO00750 1634 aa42.35■■■■■ 4.37
EBPL-203ENST00000378270 IDI1Q13907 227 aa42.34■■■■■ 4.37
EBPL-203ENST00000378270 TRIM52Q96A61 297 aa42.31■■■■■ 4.36
EBPL-203ENST00000378270 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.3■■■■■ 4.36
EBPL-203ENST00000378270 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.29■■■■■ 4.36
EBPL-203ENST00000378270 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
EBPL-203ENST00000378270 SLIT1O75093 1534 aa42.26■■■■■ 4.36
EBPL-203ENST00000378270 ADGRB3O60242 1522 aa42.25■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 ARHGAP23Q9P227 1491 aa42.25■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 STAG3Q9UJ98 1225 aa42.23■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 MED14O60244 1454 aa42.22■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa42.21■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.21■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP42.2■■■■■ 4.35
EBPL-203ENST00000378270 TMEM2Q9UHN6 1383 aa42.18■■■■■ 4.34
EBPL-203ENST00000378270 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.15■■■■■ 4.34
EBPL-203ENST00000378270 HRCP23327 699 aa42.14■■■■■ 4.34
EBPL-203ENST00000378270 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP42.14■■■■■ 4.34
EBPL-203ENST00000378270 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa42.13■■■■■ 4.34
EBPL-203ENST00000378270 TRPM2O94759 1503 aa42.13■■■■■ 4.33
EBPL-203ENST00000378270 EID1Q9Y6B2 187 aa42.11■■■■■ 4.33
EBPL-203ENST00000378270 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.1■■■■■ 4.33
EBPL-203ENST00000378270 TXNDC2Q86VQ3 553 aa42.07■■■■■ 4.33
EBPL-203ENST00000378270 MPHOSPH9Q99550 1183 aa42.07■■■■■ 4.33
EBPL-203ENST00000378270 IQGAP1P46940 1657 aa42.06■■■■■ 4.32
EBPL-203ENST00000378270 LTKP29376 864 aa42.04■■■■■ 4.32
EBPL-203ENST00000378270 MYO5BQ9ULV0 1848 aa42.01■■■■■ 4.32
EBPL-203ENST00000378270 HDGFP51858 240 aaKnown RBP42■■■■■ 4.31
EBPL-203ENST00000378270 ZFYVE9O95405 1425 aa41.99■■■■■ 4.31
EBPL-203ENST00000378270 CLTCL1P53675 1640 aa41.98■■■■■ 4.31
EBPL-203ENST00000378270 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.95■■■■■ 4.31
EBPL-203ENST00000378270 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.94■■■■■ 4.3
EBPL-203ENST00000378270 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.94■■■■■ 4.3
EBPL-203ENST00000378270 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.93■■■■■ 4.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.5 ms