RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335356.7

GIT1-202, Transcript of GIT ArfGAP 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIT1, Length 660 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIT1-202ENST00000335356 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP44.51■■■■■ 4.72
GIT1-202ENST00000335356 IQSEC2Q5JU85 1478 aa44.51■■■■■ 4.72
GIT1-202ENST00000335356 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa44.5■■■■■ 4.72
GIT1-202ENST00000335356 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP44.5■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 A2ML1A8K2U0 1454 aa44.49■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP44.48■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP44.47■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 FAM135AQ9P2D6 1515 aa44.46■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 KDM5DQ9BY66 1539 aa44.45■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 TNRQ92752 1358 aa44.44■■■■■ 4.71
GIT1-202ENST00000335356 MAP3K1Q13233 1512 aa44.43■■■■■ 4.7
GIT1-202ENST00000335356 PZPP20742 1482 aa44.42■■■■■ 4.7
GIT1-202ENST00000335356 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP44.4■■■■■ 4.7
GIT1-202ENST00000335356 MIA2Q96PC5 1412 aa44.33■■■■■ 4.69
GIT1-202ENST00000335356 MYOM3Q5VTT5 1437 aa44.31■■■■■ 4.68
GIT1-202ENST00000335356 MAST1Q9Y2H9 1570 aa44.3■■■■■ 4.68
GIT1-202ENST00000335356 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP44.25■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 DISP3Q9P2K9 1392 aa44.23■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 NLRP1Q9C000 1473 aa44.22■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 UBAP1LF5GYI3 381 aa44.22■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 ANKLE2Q86XL3 938 aa44.22■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP44.2■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP44.19■■■■■ 4.67
GIT1-202ENST00000335356 ABCC3O15438 1527 aa44.15■■■■■ 4.66
GIT1-202ENST00000335356 APLP2Q06481 763 aa44.14■■■■■ 4.66
GIT1-202ENST00000335356 NEURL4Q96JN8 1562 aa44.14■■■■■ 4.66
GIT1-202ENST00000335356 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP44.13■■■■■ 4.66
GIT1-202ENST00000335356 UGGT1Q9NYU2 1555 aa44.13■■■■■ 4.65
GIT1-202ENST00000335356 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP44.13■■■■■ 4.65
GIT1-202ENST00000335356 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP44.08■■■■■ 4.65
GIT1-202ENST00000335356 DUOX2Q9NRD8 1548 aa44.08■■■■■ 4.65
GIT1-202ENST00000335356 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa44.05■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 ILDR2Q71H61 639 aa44.05■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 MROH1Q8NDA8 1641 aa44.05■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 SHANK2Q9UPX8 1470 aa44.04■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 ABCC5O15440 1437 aa44.04■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 KIF15Q9NS87 1388 aa44.02■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 MED14O60244 1454 aa44.02■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 ERVK-7P63135 1459 aa44.02■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 CPS1P31327 1500 aa44.01■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa44.01■■■■■ 4.64
GIT1-202ENST00000335356 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP44■■■■■ 4.63
GIT1-202ENST00000335356 DEPDC5O75140 1603 aa43.99■■■■■ 4.63
GIT1-202ENST00000335356 PTPN23Q9H3S7 1636 aa43.96■■■■■ 4.63
GIT1-202ENST00000335356 ERBINQ96RT1 1412 aa43.93■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 TOM1O60784 492 aa43.92■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 CEP152O94986 1710 aa43.92■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 VWDEQ8N2E2 1590 aa43.92■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP43.91■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 DAPK1P53355 1430 aa43.9■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 FGD6Q6ZV73 1430 aa43.9■■■■■ 4.62
GIT1-202ENST00000335356 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa43.88■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.88■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP43.86■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP43.85■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 PIP4K2BP78356 416 aa43.84■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 IQGAP1P46940 1657 aa43.84■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP43.83■■■■■ 4.61
GIT1-202ENST00000335356 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.81■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 SOCS7O14512 581 aa43.8■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa43.8■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 KANK1Q14678 1352 aa43.78■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 UBR1Q8IWV7 1749 aa43.77■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 HSPA1LP34931 641 aa43.76■■■■■ 4.6
GIT1-202ENST00000335356 LTKP29376 864 aa43.74■■■■■ 4.59
GIT1-202ENST00000335356 TXNDC2Q86VQ3 553 aa43.74■■■■■ 4.59
GIT1-202ENST00000335356 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP43.72■■■■■ 4.59
GIT1-202ENST00000335356 ARHGAP23Q9P227 1491 aa43.7■■■■■ 4.59
GIT1-202ENST00000335356 SLIT1O75093 1534 aa43.68■■■■■ 4.58
GIT1-202ENST00000335356 EID1Q9Y6B2 187 aa43.66■■■■■ 4.58
GIT1-202ENST00000335356 LRRC7Q96NW7 1537 aa43.64■■■■■ 4.58
GIT1-202ENST00000335356 STRCP1A6NGW2 1772 aa43.64■■■■■ 4.58
GIT1-202ENST00000335356 STAG3Q9UJ98 1225 aa43.63■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 LMTK2Q8IWU2 1503 aa43.63■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 IDI1Q13907 227 aa43.6■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 ALKQ9UM73 1620 aa43.59■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 TMEM2Q9UHN6 1383 aa43.59■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.59■■■■■ 4.57
GIT1-202ENST00000335356 ADGRL2O95490 1459 aa43.57■■■■■ 4.56
GIT1-202ENST00000335356 PIK3C2BO00750 1634 aa43.56■■■■■ 4.56
GIT1-202ENST00000335356 SYNMO15061 1565 aa43.53■■■■■ 4.56
GIT1-202ENST00000335356 NOS1P29475 1434 aa43.48■■■■■ 4.55
GIT1-202ENST00000335356 EFCAB6Q5THR3 1501 aa43.47■■■■■ 4.55
GIT1-202ENST00000335356 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa43.46■■■■■ 4.55
GIT1-202ENST00000335356 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP43.45■■■■■ 4.55
GIT1-202ENST00000335356 SLC52A1Q9NWF4 448 aa43.44■■■■■ 4.54
GIT1-202ENST00000335356 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP43.41■■■■■ 4.54
GIT1-202ENST00000335356 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP43.34■■■■■ 4.53
GIT1-202ENST00000335356 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP43.33■■■■■ 4.53
GIT1-202ENST00000335356 KCNA6P17658 529 aa43.33■■■■■ 4.53
GIT1-202ENST00000335356 SLC26A8Q96RN1 970 aa43.33■■■■■ 4.53
GIT1-202ENST00000335356 ADGRB3O60242 1522 aa43.31■■■■■ 4.52
GIT1-202ENST00000335356 TET3O43151 1660 aa43.3■■■■■ 4.52
GIT1-202ENST00000335356 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP43.27■■■■■ 4.52
GIT1-202ENST00000335356 TMEM94Q12767 1356 aa43.24■■■■■ 4.51
GIT1-202ENST00000335356 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP43.22■■■■■ 4.51
GIT1-202ENST00000335356 BCANQ96GW7 911 aa43.22■■■■■ 4.51
GIT1-202ENST00000335356 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP43.21■■■■■ 4.51
GIT1-202ENST00000335356 ROCK1Q13464 1354 aa43.19■■■■■ 4.5
GIT1-202ENST00000335356 HDGFP51858 240 aaKnown RBP43.19■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms