RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317555.6

PGAM5-201, Transcript of PGAM family member 5, mitochondrial serine/threonine protein phosphatase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGAM5, Length 1,182 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM5-201ENST00000317555 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 DAPK1P53355 1430 aa41.54■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 STRCQ7RTU9 1775 aa41.53■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.53■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.53■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.52■■■■■ 4.24
PGAM5-201ENST00000317555 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.51■■■■■ 4.23
PGAM5-201ENST00000317555 KIF15Q9NS87 1388 aa41.47■■■■■ 4.23
PGAM5-201ENST00000317555 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.46■■■■■ 4.23
PGAM5-201ENST00000317555 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.45■■■■■ 4.23
PGAM5-201ENST00000317555 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.44■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 PZPP20742 1482 aa41.43■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.41■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.41■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 ERBINQ96RT1 1412 aa41.38■■■■■ 4.22
PGAM5-201ENST00000317555 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.38■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.37■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 NCOA1Q15788 1441 aa41.37■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 ABCC3O15438 1527 aa41.37■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.36■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.35■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.35■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 TNRQ92752 1358 aa41.33■■■■■ 4.21
PGAM5-201ENST00000317555 PTPRTO14522 1441 aa41.3■■■■■ 4.2
PGAM5-201ENST00000317555 CEP152O94986 1710 aa41.3■■■■■ 4.2
PGAM5-201ENST00000317555 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.29■■■■■ 4.2
PGAM5-201ENST00000317555 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.28■■■■■ 4.2
PGAM5-201ENST00000317555 ADGRL2O95490 1459 aa41.26■■■■■ 4.2
PGAM5-201ENST00000317555 PLA2R1Q13018 1463 aa41.25■■■■■ 4.19
PGAM5-201ENST00000317555 DEPDC5O75140 1603 aa41.23■■■■■ 4.19
PGAM5-201ENST00000317555 FBXO41Q8TF61 875 aa41.2■■■■■ 4.19
PGAM5-201ENST00000317555 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.19■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 NLRP1Q9C000 1473 aa41.18■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.17■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.16■■■■■ 4.183e-6■■■■□ 20.1
PGAM5-201ENST00000317555 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.16■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.16■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 PKD2Q13563 968 aa41.15■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 CERKQ8TCT0 537 aa41.15■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 KANK1Q14678 1352 aa41.14■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 ERVK-7P63135 1459 aa41.14■■■■■ 4.18
PGAM5-201ENST00000317555 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.09■■■■■ 4.17
PGAM5-201ENST00000317555 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.07■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.06■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.04■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.03■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.03■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.02■■■■■ 4.16
PGAM5-201ENST00000317555 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41■■■■■ 4.151e-11■■■■■ 121.5
PGAM5-201ENST00000317555 ROCK1Q13464 1354 aa40.98■■■■■ 4.15
PGAM5-201ENST00000317555 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.96■■■■■ 4.15
PGAM5-201ENST00000317555 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.93■■■■■ 4.14
PGAM5-201ENST00000317555 ITGAEP38570 1179 aa40.92■■■■■ 4.14
PGAM5-201ENST00000317555 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.92■■■■■ 4.14
PGAM5-201ENST00000317555 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.9■■■■■ 4.14
PGAM5-201ENST00000317555 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.9■■■■■ 4.14
PGAM5-201ENST00000317555 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.86■■■■■ 4.13
PGAM5-201ENST00000317555 UNC13BO14795 1591 aa40.85■■■■■ 4.13
PGAM5-201ENST00000317555 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
PGAM5-201ENST00000317555 TET3O43151 1660 aa40.8■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 MED14O60244 1454 aa40.8■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 PIK3C2BO00750 1634 aa40.79■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.77■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 SYNMO15061 1565 aa40.77■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
PGAM5-201ENST00000317555 NOS1P29475 1434 aa40.76■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.75■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 IQGAP1P46940 1657 aa40.75■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 SLIT1O75093 1534 aa40.71■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.7■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.7■■■■■ 4.11
PGAM5-201ENST00000317555 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.69■■■■■ 4.1
PGAM5-201ENST00000317555 IDI1Q13907 227 aa40.68■■■■■ 4.1
PGAM5-201ENST00000317555 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
PGAM5-201ENST00000317555 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.64■■■■■ 4.1
PGAM5-201ENST00000317555 E9PCH4 1651 aa40.62■■■■■ 4.09
PGAM5-201ENST00000317555 NUP155O75694 1391 aa40.61■■■■■ 4.09
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PGAM5-201ENST00000317555 EID1Q9Y6B2 187 aa40.61■■■■■ 4.09
PGAM5-201ENST00000317555 CPS1P31327 1500 aa40.61■■■■■ 4.09
PGAM5-201ENST00000317555 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.61■■■■■ 4.09
PGAM5-201ENST00000317555 LTKP29376 864 aa40.6■■■■■ 4.09
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PGAM5-201ENST00000317555 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.44■■■■■ 4.06
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PGAM5-201ENST00000317555 HFM1A2PYH4 1435 aa40.41■■■■■ 4.06
PGAM5-201ENST00000317555 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.35■■■■■ 4.05
PGAM5-201ENST00000317555 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.35■■■■■ 4.05
PGAM5-201ENST00000317555 ZFYVE9O95405 1425 aa40.33■■■■■ 4.05
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PGAM5-201ENST00000317555 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.32■■■■■ 4.04
PGAM5-201ENST00000317555 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.3■■■■■ 4.04
PGAM5-201ENST00000317555 TOM1O60784 492 aa40.26■■■■■ 4.04
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