RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306732.7

PITX2-201, Transcript of paired like homeodomain 2, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX2, Length 2,320 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2-201ENST00000306732 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.42■■□□□ 1.82
PITX2-201ENST00000306732 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX2-201ENST00000306732 ABCA8O94911 1581 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX2-201ENST00000306732 E9PCH4 1651 aa26.39■■□□□ 1.82
PITX2-201ENST00000306732 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.39■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 RRP1P56182 461 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 RALBP1Q15311 655 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 EXOC6Q8TAG9 804 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 CHD1O14646 1710 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
PITX2-201ENST00000306732 ATP10BO94823 1461 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 RCAN3Q9UKA8 241 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 PTPRGP23470 1445 aa26.29■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.28■■□□□ 1.8
PITX2-201ENST00000306732 PARD3Q8TEW0 1356 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 TSPY4P0CV99 314 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 TSPY10P0CW01 314 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 NLRP13Q86W25 1043 aa26.26■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.22■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.21■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PITX2-201ENST00000306732 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.2■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 PDE3BQ13370 1112 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.19■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 PDE4AP27815 886 aa26.17■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.17■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.16■■□□□ 1.78
PITX2-201ENST00000306732 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 BACH2Q9BYV9 841 aa26.13■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 RGL3Q3MIN7 710 aa26.12■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 PLIN1O60240 522 aa26.11■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.1■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.1■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 MS4A1P11836 297 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa26.09■■□□□ 1.77
PITX2-201ENST00000306732 A2MP01023 1474 aa26.08■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 PLA2R1Q13018 1463 aa26.07■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 TESK2Q96S53 571 aa26.06■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 PREX2Q70Z35 1606 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 SKAP1Q86WV1 359 aa26.04■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 CRBNQ96SW2 442 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 PANK3Q9H999 370 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.03■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 LAMC1P11047 1609 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 SHROOM2Q13796 1616 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 INSRP06213 1382 aa26.02■■□□□ 1.76
PITX2-201ENST00000306732 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 ERBINQ96RT1 1412 aa26.01■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 UNC13BO14795 1591 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.99■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.99■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 ERCC6L2Q5T890 1561 aa25.98■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 NEFMP07197 916 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 OSCARQ8IYS5 282 aa25.97■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.96■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.95■■□□□ 1.75
PITX2-201ENST00000306732 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.95■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 TTC37Q6PGP7 1564 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 TMF1P82094 1093 aa25.93■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 ADAMTS8Q9UP79 889 aa25.91■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP25.91■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 USP35Q9P2H5 1018 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.9■■□□□ 1.74
PITX2-201ENST00000306732 ABCC2Q92887 1545 aa25.89■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.87■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 KDM2BQ8NHM5 1336 aa25.87■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.86■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 WDR7Q9Y4E6 1490 aa25.84■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 IL27Q8NEV9 243 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 DDRGK1Q96HY6 314 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 PLXNC1O60486 1568 aa25.83■■□□□ 1.73
PITX2-201ENST00000306732 ATP10AO60312 1499 aa25.83■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 DUSP27Q5VZP5 1158 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 PPP2R1AP30153 589 aa25.82■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP25.79■■□□□ 1.72
PITX2-201ENST00000306732 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms