RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.79
CLEC1B-201ENST00000298527 TNRQ92752 1358 aa26.2■■□□□ 1.79
CLEC1B-201ENST00000298527 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
CLEC1B-201ENST00000298527 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.19■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.19■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 MBD5Q9P267 1494 aa26.18■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.17■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 PZPP20742 1482 aa26.17■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
CLEC1B-201ENST00000298527 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.14■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 TIAM1Q13009 1591 aa26.13■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF3BO15066 747 aa26.13■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP26.11■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.11■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 NLRP1Q9C000 1473 aa26.11■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.1■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 MED14O60244 1454 aa26.1■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 MIA2Q96PC5 1412 aa26.09■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa26.08■■□□□ 1.77
CLEC1B-201ENST00000298527 DEPDC5O75140 1603 aa26.07■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 RSPH4AQ5TD94 716 aa26.07■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.07■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 CEP162Q5TB80 1403 aa26.06■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.05■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 ALKQ9UM73 1620 aa26.03■■□□□ 1.76
CLEC1B-201ENST00000298527 IQGAP1P46940 1657 aa25.99■■□□□ 1.75
CLEC1B-201ENST00000298527 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.97■■□□□ 1.75
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC7Q96NW7 1537 aa25.94■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 SYNMO15061 1565 aa25.94■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPY4P0CV99 314 aa25.93■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 TSPY10P0CW01 314 aa25.93■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.9■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 NCOA2Q15596 1464 aa25.9■■□□□ 1.74
CLEC1B-201ENST00000298527 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.88■■□□□ 1.73
CLEC1B-201ENST00000298527 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CLEC1B-201ENST00000298527 ABCC3O15438 1527 aa25.87■■□□□ 1.73
CLEC1B-201ENST00000298527 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CLEC1B-201ENST00000298527 ERVK-7P63135 1459 aa25.85■■□□□ 1.73
CLEC1B-201ENST00000298527 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CLEC1B-201ENST00000298527 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.8■■□□□ 1.72
CLEC1B-201ENST00000298527 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.78■■□□□ 1.72
CLEC1B-201ENST00000298527 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
CLEC1B-201ENST00000298527 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.77■■□□□ 1.72
CLEC1B-201ENST00000298527 SLIT1O75093 1534 aa25.75■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.75■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 TXNDC2Q86VQ3 553 aa25.75■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 LTKP29376 864 aa25.73■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.73■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM135BQ49AJ0 1406 aa25.72■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 EID1Q9Y6B2 187 aa25.72■■□□□ 1.71
CLEC1B-201ENST00000298527 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.69■■□□□ 1.7
CLEC1B-201ENST00000298527 CEP152O94986 1710 aa25.68■■□□□ 1.7
CLEC1B-201ENST00000298527 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.68■■□□□ 1.7
CLEC1B-201ENST00000298527 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP25.67■■□□□ 1.7
CLEC1B-201ENST00000298527 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa25.65■■□□□ 1.7
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.63■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.62■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 TMEM94Q12767 1356 aa25.61■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 POTEAQ6S8J7 498 aa25.61■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 STAG3Q9UJ98 1225 aa25.6■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 KCNA6P17658 529 aa25.59■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 ERBINQ96RT1 1412 aa25.59■■□□□ 1.69
CLEC1B-201ENST00000298527 PIK3C2BO00750 1634 aa25.57■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 KIF15Q9NS87 1388 aa25.56■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.56■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.56■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa25.55■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.54■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP25.54■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 KANK1Q14678 1352 aa25.54■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 MAP3K1Q13233 1512 aa25.53■■□□□ 1.68
CLEC1B-201ENST00000298527 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.51■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 TET3O43151 1660 aa25.5■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 IDI1Q13907 227 aa25.49■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC26A8Q96RN1 970 aa25.49■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.49■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 MSH6P52701 1360 aa25.47■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.47■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 NWD1Q149M9 1564 aa25.46■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.46■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 ABCC5O15440 1437 aa25.46■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 JCADQ9P266 1359 aa25.45■■□□□ 1.67
CLEC1B-201ENST00000298527 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 SLAIN2Q9P270 581 aa25.44■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.41■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 ADGRB3O60242 1522 aa25.41■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 PHLPP1O60346 1717 aa25.4■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 NOS1P29475 1434 aa25.4■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa25.4■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.39■■□□□ 1.66
CLEC1B-201ENST00000298527 BCANQ96GW7 911 aa25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms