RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272133.3

CNIH3-201, Transcript of cornichon family AMPA receptor auxiliary protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CNIH3, Length 2,558 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH3-201ENST00000272133 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 NUP155O75694 1391 aa24.97■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 RALBP1Q15311 655 aa24.96■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.96■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ABCA8O94911 1581 aa24.96■■□□□ 1.59
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.95■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 E9PCH4 1651 aa24.93■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.92■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 ADCY10Q96PN6 1610 aa24.91■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 PDE4AP27815 886 aa24.89■■□□□ 1.58
CNIH3-201ENST00000272133 ATP10BO94823 1461 aa24.88■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.87■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 NLRP13Q86W25 1043 aa24.87■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.85■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.85■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.84■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 BACH2Q9BYV9 841 aa24.84■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 SHROOM2Q13796 1616 aa24.83■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 PTPRGP23470 1445 aa24.83■■□□□ 1.57
CNIH3-201ENST00000272133 KDM5DQ9BY66 1539 aa24.82■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 PDE3BQ13370 1112 aa24.82■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 ERCC6L2Q5T890 1561 aa24.81■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.81■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 PLIN1O60240 522 aa24.8■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 MS4A1P11836 297 aa24.78■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 SKAP1Q86WV1 359 aa24.78■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 PLEKHD1A6NEE1 506 aa24.77■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 NEFMP07197 916 aa24.77■■□□□ 1.56
CNIH3-201ENST00000272133 TSPY4P0CV99 314 aa24.76■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 TSPY10P0CW01 314 aa24.76■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.75■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.73■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.73■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa24.73■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 IL27Q8NEV9 243 aa24.71■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 CRBNQ96SW2 442 aa24.71■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 RGL3Q3MIN7 710 aa24.7■■□□□ 1.55
CNIH3-201ENST00000272133 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.69■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 USP35Q9P2H5 1018 aa24.68■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.68■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.67■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 CLASP1Q7Z460 1538 aa24.66■■□□□ 1.54
CNIH3-201ENST00000272133 TESK2Q96S53 571 aa24.64■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.63■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 PANK3Q9H999 370 aa24.63■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 GPRASP1Q5JY77 1395 aa24.62■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.61■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.61■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 A2MP01023 1474 aa24.61■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 INSRP06213 1382 aa24.6■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.59■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 ABCC2Q92887 1545 aa24.58■■□□□ 1.53
CNIH3-201ENST00000272133 PLA2R1Q13018 1463 aa24.58■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.57■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 ERBINQ96RT1 1412 aa24.57■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.57■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.56■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.56■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.55■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.55■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.54■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 SLC4A3P48751 1232 aa24.53■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 LAMC1P11047 1609 aa24.53■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 TMF1P82094 1093 aa24.52■■□□□ 1.52
CNIH3-201ENST00000272133 PREX2Q70Z35 1606 aa24.51■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 TTC37Q6PGP7 1564 aa24.51■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 MYO5CQ9NQX4 1742 aa24.51■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.5■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.49■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 DUSP27Q5VZP5 1158 aa24.48■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 NFKBIBQ15653 356 aa24.47■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP24.47■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 UNC13BO14795 1591 aa24.46■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.46■■□□□ 1.51
CNIH3-201ENST00000272133 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.44■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.44■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 C8orf34Q49A92 452 aa24.44■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 GSE1Q14687 1217 aa24.43■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 PPP2R1AP30153 589 aa24.43■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 FAM161AQ3B820 660 aa24.42■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa24.42■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.42■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.41■■□□□ 1.5
CNIH3-201ENST00000272133 WDR7Q9Y4E6 1490 aa24.41■■□□□ 1.5
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