RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216121.11

NIPSNAP1-201, Transcript of nipsnap homolog 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NIPSNAP1, Length 2,237 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa30.19■■■□□ 2.42
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERICH6BQ5W0A0 696 aa30.18■■■□□ 2.42
NIPSNAP1-201ENST00000216121 POLR3GLQ9BT43 218 aa30.16■■■□□ 2.42
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC144AA2RUR9 1427 aa30.14■■■□□ 2.42
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa30.12■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.11■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLA2R1Q13018 1463 aa30.11■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRAG1Q86YV5 1406 aa30.1■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa30.09■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DUOX2Q9NRD8 1548 aa30.09■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP30.08■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PLCH2O75038 1416 aa30.08■■■□□ 2.41
NIPSNAP1-201ENST00000216121 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa30.07■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.05■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MAGI2Q86UL8 1455 aa30.04■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ERBINQ96RT1 1412 aa30.03■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 E9PCH4 1651 aa30.03■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.03■■■□□ 2.49e-8■■□□□ 14.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP10AO60312 1499 aa30.02■■■□□ 2.4
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP30.01■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 A2MP01023 1474 aa30.01■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 GPRASP1Q5JY77 1395 aa30.01■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa30■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.99■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.98■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LAMC1P11047 1609 aa29.98■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.97■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCC1P33527 1531 aa29.97■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RGL3Q3MIN7 710 aa29.96■■■□□ 2.39
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RALBP1Q15311 655 aa29.95■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMC1Q8TDI8 760 aa29.94■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.92■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.91■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.91■■■□□ 2.38
NIPSNAP1-201ENST00000216121 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.88■■■□□ 2.37
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NUDCQ9Y266 331 aa29.88■■■□□ 2.37
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.85■■■□□ 2.37
NIPSNAP1-201ENST00000216121 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.84■■■□□ 2.37
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TESK2Q96S53 571 aa29.82■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.81■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.8■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.78■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.77■■■□□ 2.36
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NLRP13Q86W25 1043 aa29.76■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.76■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ANP32EQ9BTT0 268 aa29.75■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 AFAP1Q8N556 730 aa29.74■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.73■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 DEPDC5O75140 1603 aa29.72■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TRPM2O94759 1503 aa29.72■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.72■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TMF1P82094 1093 aa29.7■■■□□ 2.35
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PTPRTO14522 1441 aa29.7■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.68■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MADDQ8WXG6 1647 aa29.68■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.67■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CEP152O94986 1710 aa29.67■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 STAC3Q96MF2 364 aa29.67■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 TET3O43151 1660 aa29.65■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ATP7AQ04656 1500 aa29.64■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FANCAO15360 1455 aa29.64■■■□□ 2.34
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PANK3Q9H999 370 aa29.64■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 FANCIQ9NVI1 1328 aa29.63■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.62■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 IQGAP1P46940 1657 aa29.62■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.61■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CLTCL1P53675 1640 aa29.61■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 INSRP06213 1382 aa29.6■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.58■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KANK1Q14678 1352 aa29.58■■■□□ 2.33
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa29.57■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 PDE3BQ13370 1112 aa29.55■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.54■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ADGRL1O94910 1474 aa29.54■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.53■■■□□ 2.32
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIF3BO15066 747 aa29.51■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa29.49■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP29.49■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.49■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MSH5O43196 834 aa29.48■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CCDC136Q96JN2 1154 aa29.48■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 ASXL2Q76L83 1435 aa29.48■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 CDCA8Q53HL2 280 aa29.48■■■□□ 2.31
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SYNMO15061 1565 aa29.44■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RRP1P56182 461 aaKnown RBP29.44■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 RCAN3Q9UKA8 241 aa29.44■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.43■■■□□ 2.3
NIPSNAP1-201ENST00000216121 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
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