RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000086933.2

GSC2-201, Transcript of goosecoid homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene GSC2, Length 1,033 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSC2-201ENST00000086933 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.27■■■■■ 4.36
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GSC2-201ENST00000086933 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.23■■■■■ 4.35
GSC2-201ENST00000086933 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.22■■■■■ 4.35
GSC2-201ENST00000086933 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.15■■■■■ 4.34
GSC2-201ENST00000086933 KIF15Q9NS87 1388 aa42.14■■■■■ 4.34
GSC2-201ENST00000086933 ERBINQ96RT1 1412 aa42.12■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 PZPP20742 1482 aa42.11■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 ADGRL2O95490 1459 aa42.09■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 STRCQ7RTU9 1775 aa42.09■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.07■■■■■ 4.33
GSC2-201ENST00000086933 ABCC3O15438 1527 aa42.05■■■■■ 4.32
GSC2-201ENST00000086933 NCOA1Q15788 1441 aa42.05■■■■■ 4.32
GSC2-201ENST00000086933 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.05■■■■■ 4.32
GSC2-201ENST00000086933 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.02■■■■■ 4.32
GSC2-201ENST00000086933 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.02■■■■■ 4.32
GSC2-201ENST00000086933 DEPDC5O75140 1603 aa41.99■■■■■ 4.31
GSC2-201ENST00000086933 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP41.99■■■■■ 4.31
GSC2-201ENST00000086933 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.97■■■■■ 4.31
GSC2-201ENST00000086933 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.92■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.92■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 PTPRTO14522 1441 aa41.92■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 PLA2R1Q13018 1463 aa41.92■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP41.91■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.91■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 TNRQ92752 1358 aa41.9■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 DMRT2Q9Y5R5 561 aa41.9■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41.9■■■■■ 4.3
GSC2-201ENST00000086933 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.88■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.88■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.87■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.86■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 CEP152O94986 1710 aa41.85■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 NLRP1Q9C000 1473 aa41.83■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.82■■■■■ 4.29
GSC2-201ENST00000086933 ERVK-7P63135 1459 aa41.8■■■■■ 4.28
GSC2-201ENST00000086933 ROCK1Q13464 1354 aa41.79■■■■■ 4.28
GSC2-201ENST00000086933 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.75■■■■■ 4.27
GSC2-201ENST00000086933 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP41.74■■■■■ 4.27
GSC2-201ENST00000086933 PKD2Q13563 968 aa41.72■■■■■ 4.27
GSC2-201ENST00000086933 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP41.71■■■■■ 4.27
GSC2-201ENST00000086933 KANK1Q14678 1352 aa41.69■■■■■ 4.26
GSC2-201ENST00000086933 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP41.68■■■■■ 4.26
GSC2-201ENST00000086933 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.63■■■■■ 4.26
GSC2-201ENST00000086933 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.63■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.61■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 FBXO41Q8TF61 875 aa41.6■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.6■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 UNC13BO14795 1591 aa41.59■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.58■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 CERKQ8TCT0 537 aa41.57■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.57■■■■■ 4.25
GSC2-201ENST00000086933 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.56■■■■■ 4.24
GSC2-201ENST00000086933 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
GSC2-201ENST00000086933 NOS1P29475 1434 aa41.52■■■■■ 4.24
GSC2-201ENST00000086933 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.52■■■■■ 4.24
GSC2-201ENST00000086933 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP41.51■■■■■ 4.24
GSC2-201ENST00000086933 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.5■■■■■ 4.23
GSC2-201ENST00000086933 MED14O60244 1454 aa41.5■■■■■ 4.23
GSC2-201ENST00000086933 TET3O43151 1660 aa41.47■■■■■ 4.23
GSC2-201ENST00000086933 SYNMO15061 1565 aa41.45■■■■■ 4.23
GSC2-201ENST00000086933 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.43■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.42■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 SLIT1O75093 1534 aa41.41■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.41■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.4■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.39■■■■■ 4.22
GSC2-201ENST00000086933 PIK3C2BO00750 1634 aa41.38■■■■■ 4.21
GSC2-201ENST00000086933 ITGAEP38570 1179 aa41.37■■■■■ 4.21
GSC2-201ENST00000086933 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.34■■■■■ 4.21
GSC2-201ENST00000086933 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.33■■■■■ 4.21
GSC2-201ENST00000086933 IDI1Q13907 227 aa41.31■■■■■ 4.2
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GSC2-201ENST00000086933 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.29■■■■■ 4.2
GSC2-201ENST00000086933 IQGAP1P46940 1657 aa41.27■■■■■ 4.2
GSC2-201ENST00000086933 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.27■■■■■ 4.2
GSC2-201ENST00000086933 E9PCH4 1651 aa41.26■■■■■ 4.2
GSC2-201ENST00000086933 NUP155O75694 1391 aa41.25■■■■■ 4.19
GSC2-201ENST00000086933 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.25■■■■■ 4.19
GSC2-201ENST00000086933 ADGRB3O60242 1522 aa41.24■■■■■ 4.19
GSC2-201ENST00000086933 HFM1A2PYH4 1435 aa41.23■■■■■ 4.19
GSC2-201ENST00000086933 LTKP29376 864 aa41.19■■■■■ 4.18
GSC2-201ENST00000086933 CPS1P31327 1500 aa41.17■■■■■ 4.18
GSC2-201ENST00000086933 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.12■■■■■ 4.17
GSC2-201ENST00000086933 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.1■■■■■ 4.17
GSC2-201ENST00000086933 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.07■■■■■ 4.17
GSC2-201ENST00000086933 EID1Q9Y6B2 187 aa41.07■■■■■ 4.17
GSC2-201ENST00000086933 ZFYVE9O95405 1425 aa41.06■■■■■ 4.16
GSC2-201ENST00000086933 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.01■■■■■ 4.16
GSC2-201ENST00000086933 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.99■■■■■ 4.15
GSC2-201ENST00000086933 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.96■■■■■ 4.15
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GSC2-201ENST00000086933 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.9■■■■■ 4.14
GSC2-201ENST00000086933 TRPM2O94759 1503 aa40.88■■■■■ 4.14
GSC2-201ENST00000086933 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa40.88■■■■■ 4.14
GSC2-201ENST00000086933 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.81■■■■■ 4.12
GSC2-201ENST00000086933 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP40.8■■■■■ 4.12
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