RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W URC2Q04411 772 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W FMP42Q04991 504 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NTG2Q08214 380 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W REX3Q12090 404 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SPC3Q12133 184 aa8.13□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RPS5P26783 225 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W EMP70P32802 667 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ORC2P32833 620 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DHR2P36009 735 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RTC2P38279 296 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W TFB3Q03290 321 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ARP10Q04549 284 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ERB1Q04660 807 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W FMP45Q07651 309 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W HER1Q12276 1246 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NPC2Q12408 173 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W PNS1Q12412 539 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W APC2Q12440 853 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DFG16Q99234 619 aa8.12□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RIP1P08067 215 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DAT1P13483 248 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ERD1P16151 362 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SNF6P18888 332 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W KGD1P20967 1014 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W IDP1P21954 428 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W LST4P34239 828 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YKL077WP36081 392 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W EXO84P38261 753 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W IFA38P38286 347 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W IES5P40060 125 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YNL208WP40159 199 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YLR460CP54007 376 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W OST6Q03723 332 aa8.11□□□□□ -1.11
DDI1YER143W FLP1P03870 423 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W CDC26P14724 124 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ERD2P18414 219 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W STE4P18851 423 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W DPB2P24482 689 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NDC1P32500 655 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W TIM12P32830 109 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W WBP1P33767 430 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ALG3P38179 458 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W UBS1P38290 277 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ARN2P38724 620 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NSG1P38837 291 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YIL067CP40514 678 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W STB1P42845 420 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W IRC5P43610 853 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MDV1P47025 714 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RRP17Q04031 235 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W PAL1Q05518 499 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SEI1Q06058 285 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SYO1Q07395 620 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NOP12Q08208 459 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W UIP4Q08926 304 aa8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W PAR32Q12515 295 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RPP2BP02400 110 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ADE5,7P07244 802 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MET2P08465 486 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NAR1P23503 491 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YBR139WP38109 508 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W LEU5P38702 357 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RPP1P38786 293 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W ZRG8P40021 1076 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NTA1P40354 457 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W IRC7P43623 340 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W EFM3P47163 339 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W BUD9P53226 547 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NQM1P53228 333 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W NUP49Q02199 472 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W SNZ1Q03148 297 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YMR087WQ04299 284 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MRX10Q05648 414 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W RSA3Q05942 220 aaKnown RBP8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W YPR127WQ06494 345 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MCM21Q06675 368 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W TAD3Q9URQ3 322 aa8.09□□□□□ -1.11
DDI1YER143W MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data8.08□□□□□ -1.12not detected
DDI1YER143W YPK3P38070 525 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W CHL4P38907 458 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SHR5P41912 237 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YFR054CP43622 192 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W RBL2P48606 106 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YGL101WP53144 215 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W LSG1P53145 640 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PEX25Q02969 394 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W TY1A-MR1Q04215 440 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W GAL83Q04739 417 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W VID22Q05934 901 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W NEJ1Q06148 342 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YLR040CQ07988 224 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W AVO1Q08236 1176 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YOR289WQ12012 251 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W FRE7Q12333 620 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W PRP46Q12417 451 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YDL007C-AQ2V2Q0 85 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YGR161W-CQ3E744 92 aa8.08□□□□□ -1.12
DDI1YER143W YPK2P18961 677 aa8.07□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 49.1 ms