Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.63■□□□□ 0.57
NPC2Q12408 NSR1YGR159C 1245 nt18.59■□□□□ 0.57
NPC2Q12408 NOP1YDL014W 984 nt18.06■□□□□ 0.48
NPC2Q12408 YKL036CYKL036C 393 nt16.63■□□□□ 0.25
NPC2Q12408 MDJ1YFL016C 1536 nt16.58■□□□□ 0.24
NPC2Q12408 Q0297Q0297 156 nt15.84■□□□□ 0.13
NPC2Q12408 SRX1YKL086W 384 nt15.82■□□□□ 0.12
NPC2Q12408 YJL027CYJL027C 417 nt15.48■□□□□ 0.07
NPC2Q12408 SCS3YGL126W 1143 nt15.12■□□□□ 0.01
NPC2Q12408 YCR051WYCR051W 669 nt14.97□□□□□ -0.01
NPC2Q12408 DBP2YNL112W 1641 nt14.7□□□□□ -0.06
NPC2Q12408 YOL085CYOL085C 342 nt14.43□□□□□ -0.1
NPC2Q12408 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.37□□□□□ -0.11
NPC2Q12408 RPP1BYDL130W 321 nt14.2□□□□□ -0.14
NPC2Q12408 PKP1YIL042C 1185 nt14.2□□□□□ -0.14
NPC2Q12408 CCC1YLR220W 969 nt14.16□□□□□ -0.14
NPC2Q12408 YBR190WYBR190W 312 nt14.15□□□□□ -0.14
NPC2Q12408 RTC3YHR087W 336 nt13.78□□□□□ -0.2
NPC2Q12408 SCJ1YMR214W 1134 nt13.71□□□□□ -0.21
NPC2Q12408 RVS167YDR388W 1449 nt13.7□□□□□ -0.22
NPC2Q12408 PET122YER153C 765 nt13.58□□□□□ -0.24
NPC2Q12408 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.55□□□□□ -0.24
NPC2Q12408 ATS1YAL020C 1002 nt13.5□□□□□ -0.25
NPC2Q12408 SCR1SCR1 522 nt13.37□□□□□ -0.27
NPC2Q12408 SHR5YOL110W 714 nt13.25□□□□□ -0.29
NPC2Q12408 RRN5YLR141W 1092 nt13.18□□□□□ -0.3
NPC2Q12408 YDJ1YNL064C 1230 nt13.12□□□□□ -0.31
NPC2Q12408 PUT4YOR348C 1884 nt12.93□□□□□ -0.34
NPC2Q12408 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.92□□□□□ -0.34
NPC2Q12408 URN1YPR152C 1398 nt12.92□□□□□ -0.34
NPC2Q12408 DEP1YAL013W 1218 nt12.88□□□□□ -0.35
NPC2Q12408 RSB1YOR049C 1065 nt12.86□□□□□ -0.35
NPC2Q12408 GAR1YHR089C 618 nt12.81□□□□□ -0.36
NPC2Q12408 OPI9YLR338W 858 nt12.77□□□□□ -0.37
NPC2Q12408 SAH1YER043C 1350 nt12.69□□□□□ -0.38
NPC2Q12408 ARE1YCR048W 1833 nt12.68□□□□□ -0.38
NPC2Q12408 RPN10YHR200W 807 nt12.67□□□□□ -0.38
NPC2Q12408 YNL208WYNL208W 600 nt12.67□□□□□ -0.38
NPC2Q12408 PST2YDR032C 597 nt12.53□□□□□ -0.4
NPC2Q12408 POA1YBR022W 534 nt12.5□□□□□ -0.41
NPC2Q12408 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.48□□□□□ -0.41
NPC2Q12408 SSA3YBL075C 1950 nt12.43□□□□□ -0.42
NPC2Q12408 TIR1YER011W 765 nt12.4□□□□□ -0.42
NPC2Q12408 PUN1YLR414C 792 nt12.37□□□□□ -0.43
NPC2Q12408 YJR018WYJR018W 363 nt12.32□□□□□ -0.44
NPC2Q12408 SSA1YAL005C 1929 nt12.29□□□□□ -0.44
NPC2Q12408 BSC6YOL137W 1494 nt12.25□□□□□ -0.45
NPC2Q12408 PTC2YER089C 1395 nt12.23□□□□□ -0.45
NPC2Q12408 YJR120WYJR120W 351 nt12.19□□□□□ -0.46
NPC2Q12408 BUD23YCR047C 828 nt12.16□□□□□ -0.46
NPC2Q12408 SRB2YHR041C 633 nt12.12□□□□□ -0.47
NPC2Q12408 NAB2YGL122C 1578 nt12.08□□□□□ -0.48
NPC2Q12408 SHU1YHL006C 453 nt12.04□□□□□ -0.48
NPC2Q12408 RPP2BYDR382W 333 nt12.01□□□□□ -0.49
NPC2Q12408 YKL097CYKL097C 411 nt11.96□□□□□ -0.49
NPC2Q12408 FIS1YIL065C 468 nt11.95□□□□□ -0.5
NPC2Q12408 Q0182Q0182 405 nt11.91□□□□□ -0.5
NPC2Q12408 DAL1YIR027C 1383 nt11.91□□□□□ -0.5
NPC2Q12408 INM2YDR287W 879 nt11.88□□□□□ -0.51
NPC2Q12408 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt11.86□□□□□ -0.51
NPC2Q12408 WWM1YFL010C 636 nt11.85□□□□□ -0.51
NPC2Q12408 FPR4YLR449W 1179 nt11.84□□□□□ -0.51
NPC2Q12408 PHO4YFR034C 939 nt11.81□□□□□ -0.52
NPC2Q12408 BDH2YAL061W 1254 nt11.81□□□□□ -0.52
NPC2Q12408 SPT5YML010W 3192 nt11.79□□□□□ -0.52
NPC2Q12408 YBL100CYBL100C 315 nt11.76□□□□□ -0.53
NPC2Q12408 YGR021WYGR021W 873 nt11.73□□□□□ -0.53
NPC2Q12408 HOM6YJR139C 1080 nt11.73□□□□□ -0.53
NPC2Q12408 MOT3YMR070W 1473 nt11.68□□□□□ -0.54
NPC2Q12408 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt11.65□□□□□ -0.54
NPC2Q12408 MNP1YGL068W 585 nt11.65□□□□□ -0.54
NPC2Q12408 LSM3YLR438C-A 270 nt11.64□□□□□ -0.55
NPC2Q12408 FUN26YAL022C 1554 nt11.62□□□□□ -0.55
NPC2Q12408 YPS1YLR120C 1710 nt11.62□□□□□ -0.55
NPC2Q12408 TRM9YML014W 840 nt11.57□□□□□ -0.56
NPC2Q12408 RKM5YLR137W 1104 nt11.55□□□□□ -0.56
NPC2Q12408 YOR139CYOR139C 393 nt11.55□□□□□ -0.56
NPC2Q12408 YDR095CYDR095C 411 nt11.54□□□□□ -0.56
NPC2Q12408 MEP2YNL142W 1500 nt11.5□□□□□ -0.57
NPC2Q12408 CCT6YDR188W 1641 nt11.49□□□□□ -0.57
NPC2Q12408 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.45□□□□□ -0.58
NPC2Q12408 ALF1YNL148C 765 nt11.43□□□□□ -0.58
NPC2Q12408 YOL037CYOL037C 354 nt11.42□□□□□ -0.58
NPC2Q12408 NPL3YDR432W 1245 nt11.4□□□□□ -0.58
NPC2Q12408 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.35□□□□□ -0.59
NPC2Q12408 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.35□□□□□ -0.59
NPC2Q12408 DCW1YKL046C 1350 nt11.34□□□□□ -0.59
NPC2Q12408 SIS1YNL007C 1059 nt11.33□□□□□ -0.6
NPC2Q12408 SSA4YER103W 1929 nt11.33□□□□□ -0.6
NPC2Q12408 PTP1YDL230W 1008 nt11.32□□□□□ -0.6
NPC2Q12408 RPP2AYOL039W 321 nt11.3□□□□□ -0.6
NPC2Q12408 CAC2YML102W 1407 nt11.22□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 23.5 ms