RNA–Protein interactions for RNA: YHR215W

PHO12, Transcript of One of three repressible acid phosphatases, yeast

Gene PHO12, Length 1,404 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PHO12	YHR215W	FRS2	P15625	503 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	CDC23	P16522	626 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	PMU1	P36069	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	IST2	P38250	946 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	SLM1	P40485	686 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	RRT5	P43607	289 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	BNA6	P43619	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	BIO4	P53630	237 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	SPP2	Q02521	185 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	SRL4	Q03085	281 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	GPN3	Q06543	272 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	BSC6	Q08280	497 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	TIM18	Q08749	192 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	AYT1	Q12226	474 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	GIS3	Q12418	502 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PHO12	YHR215W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MRPL25	P23369	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	CWP1	P28319	239 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SUA5	P32579	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	GPX2	P38143	162 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YMR262W	P38430	313 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	PRM9	P39551	298 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RPH1	P39956	796 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RPR2	P40571	144 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YCH1	P42937	148 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SSN8	P47821	323 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RAD17	P48581	401 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	AHC1	Q12433	566 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	POM152	P39685	1337 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	CAP2	P13517	287 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	VMA5	P31412	392 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MNS1	P32906	549 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	COS9	P36034	407 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MCR1	P36060	302 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MST28	P39552	234 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YER085C	P40058	173 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SEC9	P40357	651 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	AZR1	P50080	613 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	TAF6	P53040	516 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	LST7	P53237	242 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	WSC2	P53832	503 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	CRZ1	P53968	678 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	UBX2	Q04228	584 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	COX2	P00410	251 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RAD7	P06779	565 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MRPL8	P22353	238 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MKK1	P32490	508 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YEF1	P32622	495 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YBR137W	P38276	179 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MSS2	P40990	351 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YAR1	P46683	200 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	HER2	Q03557	464 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	CCE1	Q03702	353 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SHS1	Q07657	551 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	BTS1	Q12051	335 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	ATG31	Q12421	196 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	PAB1	P04147	577 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	RIP-Chip
PHO12	YHR215W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SLY1	P22213	666 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	RAD51	P25454	400 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	TIR2	P33890	251 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YKR015C	P36111	568 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	DTR1	P38125	572 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	HIS2	P38635	335 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	GEP4	P38812	185 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	FMC1	P40491	155 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	AIM24	P47127	394 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	GOR1	P53839	350 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	CSM3	Q04659	317 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SIA1	Q12212	622 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YOR029W	Q12243	111 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MER1	P16523	270 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	VPS3	P23643	1011 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	POP5	P28005	173 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
PHO12	YHR215W	TCD1	P38756	429 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YHK8	P38776	514 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	MDM31	P38880	579 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	YJL213W	P40896	331 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PHO12	YHR215W	SFH5	P47008	294 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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