RNA–Protein interactions for RNA: snR34

snR34, Transcript of H/ACA box small nucleolar RNA (snoRNA), yeast

Gene snR34, Length 203 nt, Biotype snoRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
snR34	snR34	RXT2	P38255	430 aa		4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	WSS1	P38838	269 aa		4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	PFS1	P38872	237 aa		4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	TIM17	P39515	158 aa		4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	YDR061W	Q12298	539 aa		4.06	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	MRPS16	Q02608	121 aa		4.05	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	YFH1	Q07540	174 aa		4.05	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	PSK1	P31374	1356 aa		4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	PRB1	P09232	635 aa		4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	ZRC1	P20107	442 aa		4.03	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	YMR010W	Q03687	405 aa		4.03	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	RCF1	Q03713	159 aa		4.03	□□□□□ -1.76
snR34	snR34	GPI18	P38211	433 aa		4.02	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YSW1	P38280	609 aa		4.02	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	IGD1	P43598	195 aa		4.02	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	GAT3	Q07928	141 aa		4.02	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	HMS1	Q12398	434 aa		4.02	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MRPL8	P22353	238 aa		4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	CHA1	P25379	360 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	PSO2	P30620	661 aa		4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	DEP1	P31385	405 aa		4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MID2	P36027	376 aa		4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MKC7	P53379	596 aa		4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	4.01	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	CMK2	P22517	447 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	GIT1	P25346	518 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MSP1	P28737	362 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	PGU1	P47180	361 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YPS5	P53057	165 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	ENT5	Q03769	411 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	PEX27	Q08580	376 aa		4	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SCH9	P11792	824 aa	Known RBP	3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YBL028C	P38202	106 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SEC9	P40357	651 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	KEG1	P43614	200 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	CIN2	P46670	268 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	VHS1	Q03785	461 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MSC3	Q05812	728 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YPR078C	Q06813	372 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MCT1	Q12283	360 aa		3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.99	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	STE7	P06784	515 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	HEM14	P40012	539 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YGL262W	P53054	175 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	EOS1	P53938	366 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YPL107W	Q02873	248 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SHS1	Q07657	551 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	FRE6	Q12473	712 aa		3.98	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	DAP2	P18962	818 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MSK1	P32048	576 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	DPH2	P32461	534 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SOL2	P37262	315 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	MRPS9	P38120	278 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	WSC4	P38739	605 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SEO1	P39709	593 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SNL1	P40548	159 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	RET3	P53600	189 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	KTR6	P54070	446 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	YDL109C	Q12103	647 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	SKS1	Q12505	502 aa		3.97	□□□□□ -1.77
snR34	snR34	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	DAD2	P36162	133 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	BMT2	P38278	337 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	CWC22	P53333	577 aa	Known RBP	3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	VAC7	P53950	1165 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	YLH47	Q06493	454 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	MCH1	Q07376	486 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	YDL012C	Q12489	107 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	YOR338W	Q99326	363 aa		3.96	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	HEM4	P06174	275 aa		3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	ANP1	P32629	500 aa		3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	YGR018C	P53211	109 aa		3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	SFM1	Q12314	213 aa		3.95	□□□□□ -1.78
snR34	snR34	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	3.94	□□□□□ -1.78

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