RNA–Protein interactions for RNA: YOL003C

PFA4, Transcript of Palmitoyltransferase with autoacylation activity, yeast

Gene PFA4, Length 1,137 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFA4	YOL003C	GAT2	P40209	560 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PRE5	P40302	234 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RTC4	P53850	401 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RHO5	P53879	331 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	VPS60	Q03390	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	IMA2	Q08295	589 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	UAF30	Q08747	228 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PHO13	P19881	312 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PSO2	P30620	661 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YET1	P35723	206 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	TCD1	P38756	429 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YGR111W	P53265	400 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	AEP3	Q12089	606 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RUP1	Q12242	671 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SMC6	Q12749	1114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	LTV1	P34078	463 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CTM1	P38818	585 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CAJ1	P39101	391 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SDT1	P53078	280 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	HOM3	P10869	527 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	POP5	P28005	173 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SPR1	P32603	445 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RPC25	P35718	212 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	HEL1	P36113	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	OLA1	P38219	394 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SEC9	P40357	651 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	SIM1	P40472	476 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	CSM3	Q04659	317 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	PAL1	Q05518	499 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RAX1	Q08760	435 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	RBD2	Q12270	262 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFA4	YOL003C	FLO11	P08640	1367 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	MRPL4	P36517	319 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	VPS45	P38932	577 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	STN1	P38960	494 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	AIP1	P46680	615 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	EAF6	P47128	113 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RET3	P53600	189 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	ALF1	P53904	254 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	CIK1	Q01649	594 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	STD1	Q02794	444 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	MMT1	Q03218	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YLH47	Q06493	454 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	MHR1	Q06630	226 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	OM45	P16547	393 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YCL068C	P25593	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YBR056W	P38081	501 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	CHK1	P38147	527 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YBL028C	P38202	106 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	AIM33	Q04516	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	SUE1	Q06524	206 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YRM1	Q12340	786 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	CYS4	P32582	507 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	CHS6	P40955	746 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	MDE1	P47095	244 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	LSB1	P53281	241 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	PEX25	Q02969	394 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	SML1	Q04964	104 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	VAC14	Q06708	880 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	GPM3	Q12326	303 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	QCR6	P00127	147 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	PHA2	P32452	334 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	SBE22	P38814	852 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	GAA1	P39012	614 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	PES4	P39684	611 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	TOS3	P43637	560 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	YLR152C	P54072	576 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	IRC25	Q07951	179 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	DCI1	Q08558	271 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	ERP4	Q12450	207 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	TUS1	Q06412	1307 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	CKA2	P19454	339 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RPO26	P20435	155 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	RIM1	P32445	135 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	SRB4	P32569	687 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	PXA2	P34230	853 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	STP2	P38704	541 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	FAD1	P38913	306 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	EFM4	P40516	257 aa		4.04	□□□□□ -1.76
PFA4	YOL003C	BRO1	P48582	844 aa		4.04	□□□□□ -1.76

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