RNA–Protein interactions for RNA: YEL009C

GCN4, Transcript of bZIP transcriptional activator of amino acid biosynthetic genes, yeastyeast

Gene GCN4, Length 846 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
GCN4YEL009C GEX1P25596 615 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C URA10P30402 227 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SMI1P32566 505 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YME1P32795 747 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PXA2P34230 853 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PEX5P35056 612 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GEX2P36173 615 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CCT2P39076 527 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PAN6P40459 309 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DPH1P40487 425 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C IST3P40565 148 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DUG1P43616 481 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AIM23P47015 356 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NIT2P47016 307 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C STR3P53101 465 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C FLC3P53121 802 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SPC105P53148 917 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YTP1P53584 459 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C IPI3P53877 555 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TEP1P53916 434 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C KTR5P53966 522 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CDC14Q00684 551 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C REG1Q00816 1014 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SHR3Q02774 210 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PIR1Q03178 341 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TRS31Q03337 283 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YMR027WQ04371 470 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ADE13Q05911 482 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C STE23Q06010 1027 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YPR114WQ06107 315 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PDR8Q06149 701 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C POS5Q06892 414 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CUE5Q08412 411 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PER33Q12144 273 aa2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DBP10Q12389 995 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NOP58Q12499 511 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TOR2P32600 2474 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TOM1Q03280 3268 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RAD3P06839 778 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GPA2P10823 449 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HNM1P19807 563 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MRPL25P23369 157 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MNE1P24720 663 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YSP3P25036 478 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C DCC1P25559 380 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C IMP3P32899 183 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C LTV1P34078 463 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ALY1P36117 915 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MRP21P38175 177 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ARP1P38696 384 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SEO1P39709 593 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RGI2P40188 164 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SMX2P40204 77 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C OSW5P40219 148 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YFL012WP43580 148 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BUD13P46947 266 aaPredicted RBP2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SIP4P46954 829 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C URB2P47108 1174 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C UBP8P50102 471 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C EMC4P53073 190 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PRM1P53835 661 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C EFM6P53970 246 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NUP100Q02629 959 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PET117Q02771 107 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPN9Q04062 393 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SLD7Q08457 257 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TRE2Q08693 809 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YKL068W-AQ3E826 78 aa2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MEX67Q99257 599 aaKnown RBP2.19□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SSC1P0CS90 654 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C HSP26P15992 214 aaKnown RBP RIP-Chip data2.18□□□□□ -2.06not detected
GCN4YEL009C BRF1P29056 596 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C BEM1P29366 551 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RIM1P32445 135 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AEP1P32493 518 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C CSE1P33307 960 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PMT1P33775 817 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TOM20P35180 183 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPF2P36160 344 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ETR1P38071 380 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C MAK5P38112 773 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YHI9P38765 294 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C KRE9P39005 276 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C RPH1P39956 796 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YEL068CP39977 110 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C SER33P40510 469 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ATG27P46989 271 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C GLG2P47011 380 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C NUP84P52891 726 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C COG1P53079 417 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C COG7P53195 279 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C ART5P53244 586 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C PEX8P53248 589 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C TDA7P53882 636 aaPredicted RBP2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C YNL143CP53908 130 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C APJ1P53940 528 aa2.18□□□□□ -2.06
GCN4YEL009C AQR1P53943 586 aa2.18□□□□□ -2.06
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