Protein–RNA interactions for Protein: Q12389

DBP10, ATP-dependent RNA helicase DBP10, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 995 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DBP10Q12389 NSR1YGR159C 1245 nt18.85■□□□□ 0.61
DBP10Q12389 YML009W-BYML009W-B 477 nt18.31■□□□□ 0.52
DBP10Q12389 NOP1YDL014W 984 nt17.61■□□□□ 0.41
DBP10Q12389 MDJ1YFL016C 1536 nt17.33■□□□□ 0.37
DBP10Q12389 YKL036CYKL036C 393 nt16.29■□□□□ 0.2
DBP10Q12389 YJL027CYJL027C 417 nt15.88■□□□□ 0.13
DBP10Q12389 SRX1YKL086W 384 nt15.39■□□□□ 0.05
DBP10Q12389 Q0297Q0297 156 nt15.36■□□□□ 0.05
DBP10Q12389 DBP2YNL112W 1641 nt15.18■□□□□ 0.02
DBP10Q12389 YBR190WYBR190W 312 nt14.98□□□□□ -0.01
DBP10Q12389 SSA3YBL075C 1950 nt14.92□□□□□ -0.02
DBP10Q12389 SCS3YGL126W 1143 nt14.82□□□□□ -0.04
DBP10Q12389 YCR051WYCR051W 669 nt14.59□□□□□ -0.07
DBP10Q12389 RTC3YHR087W 336 nt14.47□□□□□ -0.09
DBP10Q12389 TRN1tP(UGG)A 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 SUF9tP(UGG)F 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 SUF8tP(UGG)H 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 SUF7tP(UGG)M 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 SUF11tP(UGG)O2 72 nt14.34□□□□□ -0.11
DBP10Q12389 PUT4YOR348C 1884 nt14.18□□□□□ -0.14
DBP10Q12389 YOL085CYOL085C 342 nt14.07□□□□□ -0.16
DBP10Q12389 CCC1YLR220W 969 nt14.04□□□□□ -0.16
DBP10Q12389 RVS167YDR388W 1449 nt13.94□□□□□ -0.18
DBP10Q12389 SCJ1YMR214W 1134 nt13.88□□□□□ -0.19
DBP10Q12389 PKP1YIL042C 1185 nt13.85□□□□□ -0.19
DBP10Q12389 RPP1BYDL130W 321 nt13.81□□□□□ -0.2
DBP10Q12389 ARE1YCR048W 1833 nt13.71□□□□□ -0.21
DBP10Q12389 POA1YBR022W 534 nt13.58□□□□□ -0.24
DBP10Q12389 SPT5YML010W 3192 nt13.57□□□□□ -0.24
DBP10Q12389 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt13.45□□□□□ -0.26
DBP10Q12389 BSC6YOL137W 1494 nt13.44□□□□□ -0.26
DBP10Q12389 SAH1YER043C 1350 nt13.44□□□□□ -0.26
DBP10Q12389 URN1YPR152C 1398 nt13.39□□□□□ -0.27
DBP10Q12389 OPI9YLR338W 858 nt13.38□□□□□ -0.27
DBP10Q12389 SHR5YOL110W 714 nt13.38□□□□□ -0.27
DBP10Q12389 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt13.3□□□□□ -0.28
DBP10Q12389 ATS1YAL020C 1002 nt13.29□□□□□ -0.28
DBP10Q12389 SSA4YER103W 1929 nt13.25□□□□□ -0.29
DBP10Q12389 PET122YER153C 765 nt13.15□□□□□ -0.3
DBP10Q12389 DEP1YAL013W 1218 nt13.15□□□□□ -0.3
DBP10Q12389 SCR1SCR1 522 nt13.13□□□□□ -0.31
DBP10Q12389 BUD23YCR047C 828 nt13.01□□□□□ -0.33
DBP10Q12389 RPN10YHR200W 807 nt12.98□□□□□ -0.33
DBP10Q12389 SSA1YAL005C 1929 nt12.98□□□□□ -0.33
DBP10Q12389 Q0182Q0182 405 nt12.96□□□□□ -0.33
DBP10Q12389 PUN1YLR414C 792 nt12.94□□□□□ -0.34
DBP10Q12389 YNL208WYNL208W 600 nt12.91□□□□□ -0.34
DBP10Q12389 BDF1YLR399C 2061 nt12.91□□□□□ -0.34
DBP10Q12389 YDJ1YNL064C 1230 nt12.9□□□□□ -0.34
DBP10Q12389 PTC2YER089C 1395 nt12.89□□□□□ -0.35
DBP10Q12389 NAB2YGL122C 1578 nt12.84□□□□□ -0.35
DBP10Q12389 RRN5YLR141W 1092 nt12.8□□□□□ -0.36
DBP10Q12389 YJR018WYJR018W 363 nt12.73□□□□□ -0.37
DBP10Q12389 MEP2YNL142W 1500 nt12.72□□□□□ -0.37
DBP10Q12389 TAT1YBR069C 1860 nt12.7□□□□□ -0.38
DBP10Q12389 FIS1YIL065C 468 nt12.67□□□□□ -0.38
DBP10Q12389 GAR1YHR089C 618 nt12.63□□□□□ -0.39
DBP10Q12389 FPS1YLL043W 2010 nt12.61□□□□□ -0.39
DBP10Q12389 RSB1YOR049C 1065 nt12.61□□□□□ -0.39
DBP10Q12389 YER088W-BYER088W-B 147 nt12.54□□□□□ -0.4
DBP10Q12389 YJR120WYJR120W 351 nt12.54□□□□□ -0.4
DBP10Q12389 DAL1YIR027C 1383 nt12.54□□□□□ -0.4
DBP10Q12389 DCW1YKL046C 1350 nt12.51□□□□□ -0.41
DBP10Q12389 YPS1YLR120C 1710 nt12.48□□□□□ -0.41
DBP10Q12389 PHO4YFR034C 939 nt12.44□□□□□ -0.42
DBP10Q12389 MOT3YMR070W 1473 nt12.44□□□□□ -0.42
DBP10Q12389 FPR4YLR449W 1179 nt12.37□□□□□ -0.43
DBP10Q12389 YBR220CYBR220C 1683 nt12.36□□□□□ -0.43
DBP10Q12389 INM2YDR287W 879 nt12.36□□□□□ -0.43
DBP10Q12389 EMI2YDR516C 1503 nt12.3□□□□□ -0.44
DBP10Q12389 YDR095CYDR095C 411 nt12.29□□□□□ -0.44
DBP10Q12389 TIR1YER011W 765 nt12.28□□□□□ -0.44
DBP10Q12389 PST2YDR032C 597 nt12.26□□□□□ -0.45
DBP10Q12389 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.26□□□□□ -0.45
DBP10Q12389 PAC11YDR488C 1602 nt12.24□□□□□ -0.45
DBP10Q12389 NVJ2YPR091C 2313 nt12.23□□□□□ -0.45
DBP10Q12389 RPP2BYDR382W 333 nt12.23□□□□□ -0.45
DBP10Q12389 SDH1YKL148C 1923 nt12.17□□□□□ -0.46
DBP10Q12389 YDL221WYDL221W 552 nt12.17□□□□□ -0.46
DBP10Q12389 YMR090WYMR090W 684 nt12.17□□□□□ -0.46
DBP10Q12389 PTP1YDL230W 1008 nt12.14□□□□□ -0.47
DBP10Q12389 YBL100CYBL100C 315 nt12.13□□□□□ -0.47
DBP10Q12389 CAC2YML102W 1407 nt12.12□□□□□ -0.47
DBP10Q12389 SRB2YHR041C 633 nt12.06□□□□□ -0.48
DBP10Q12389 PCH2YBR186W 1695 nt12.03□□□□□ -0.48
DBP10Q12389 GUT2YIL155C 1950 nt12.03□□□□□ -0.48
DBP10Q12389 RPP2AYOL039W 321 nt12.01□□□□□ -0.49
DBP10Q12389 FUN26YAL022C 1554 nt11.99□□□□□ -0.49
DBP10Q12389 BDH2YAL061W 1254 nt11.97□□□□□ -0.49
DBP10Q12389 SCC4YER147C 1875 nt11.96□□□□□ -0.49
DBP10Q12389 IRC15YPL017C 1500 nt11.96□□□□□ -0.5
DBP10Q12389 SEC11YIR022W 504 nt11.95□□□□□ -0.5
DBP10Q12389 PIB2YGL023C 1908 nt11.94□□□□□ -0.5
DBP10Q12389 YKL097CYKL097C 411 nt11.89□□□□□ -0.51
DBP10Q12389 GIS3YLR094C 1509 nt11.86□□□□□ -0.51
DBP10Q12389 ALF1YNL148C 765 nt11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.6 ms