RNA–Protein interactions for RNA: YGR165W

MRPS35, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS35, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS35	YGR165W	RSF2	P46974	1380 aa		4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ROM2	P51862	1356 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SRV2	P17555	526 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	UTR4	P32626	227 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RAD24	P32641	659 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TRS65	P32893	560 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	VPS17	P32913	551 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ECM15	P35195	104 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	MIC60	P36112	540 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	DON1	Q05610	365 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
MRPS35	YGR165W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
MRPS35	YGR165W	ARA1	P38115	344 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RRT2	P38332	387 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	LCB2	P40970	561 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	FMS1	P50264	508 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GPI1	P53306	609 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	FMP42	Q04991	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	BRR1	Q99177	341 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CPR2	P23285	205 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	MNE1	P24720	663 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	NIP100	P33420	868 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	VHC1	P38329	1120 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CSM2	P40465	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YIR014W	P40570	242 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	COS5	P47187	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YGL082W	P53155	381 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CIK1	Q01649	594 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ERO1	Q03103	563 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	COS7	Q07788	383 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	VPS54	Q12071	889 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SLM3	Q12093	417 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GPM3	Q12326	303 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	GPH1	P06738	902 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	URA4	P20051	364 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YCR007C	P25354	239 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SLM4	P38247	162 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SKO1	Q02100	647 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SYO1	Q07395	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	VAM3	Q12241	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CTF3	Q12748	733 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	MHP1	P43638	1398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	RIP1	P08067	215 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	BUB3	P26449	341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	BEM1	P29366	551 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	HIR2	P32480	875 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	BLI1	P35727	113 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YNK1	P36010	153 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	CBP4	P37267	147 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YND1	P40009	630 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SER3	P40054	469 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	ACL4	Q03771	387 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SXM1	Q04175	944 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	MMR1	Q06324	491 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YEH2	Q07950	538 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	SRL1	Q08673	210 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.09	□□□□□ -1.75
MRPS35	YGR165W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	HIP1	P06775	603 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	SIP2	P34164	415 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	CCT2	P39076	527 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	FAU1	P40099	211 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	IKS1	P47042	667 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	URB2	P47108	1174 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	MDG1	P53885	366 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	MPS1	P54199	764 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	YMR130W	Q04223	302 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	BNA5	Q05979	453 aa		4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	SIR4	P11978	1358 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	CAR1	P00812	333 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	BRF1	P29056	596 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	YTA12	P40341	825 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	EFM4	P40516	257 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	YGR111W	P53265	400 aa		4.07	□□□□□ -1.76
MRPS35	YGR165W	YIF1	P53845	314 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25.2 ms