RNA–Protein interactions for RNA: YBL064C

PRX1, Transcript of Mitochondrial peroxiredoxin with thioredoxin peroxidase activity, yeast

Gene PRX1, Length 786 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRX1	YBL064C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	ARN1	P38731	627 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	VPS41	P38959	992 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	EFM4	P40516	257 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	CUL3	P53202	744 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YGR126W	P53274	230 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	HST1	P53685	503 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	TOF2	Q02208	771 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	FMP30	Q02883	468 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	RSF1	Q05043	376 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	PIG1	Q06216	648 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	SIL1	Q08199	421 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	SUT2	Q12286	268 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YLR111W	Q12528	110 aa		4.17	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YIM1	P28625	365 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	NIP100	P33420	868 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	LTV1	P34078	463 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	PIM1	P36775	1133 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	SLM4	P38247	162 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YHR054C	P38780	354 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	YGR111W	P53265	400 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	SKO1	Q02100	647 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	ADA2	Q02336	434 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	RRP45	Q05636	305 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	ATG26	Q06321	1198 aa		4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	RRP36	Q12481	300 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
PRX1	YBL064C	CBP1	P07252	654 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	COR1	P07256	457 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SPS4	P09937	338 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
PRX1	YBL064C	RAD14	P28519	371 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	IME2	P32581	645 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PPQ1	P32945	549 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ATG27	P46989	271 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	FMS1	P50264	508 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YGL138C	P53122	345 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ALF1	P53904	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MMR1	Q06324	491 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TPO3	Q06451	622 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.15	□□□□□ -1.75	not detected
PRX1	YBL064C	PNS1	Q12412	539 aa		4.15	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SRB8	P25648	1427 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HIP1	P06775	603 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SNF3	P10870	884 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ADY2	P25613	283 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SHP1	P34223	423 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SWH1	P35845	1188 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HOT13	P36078	116 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	HEL1	P36113	551 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	UBA4	P38820	440 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	TAX4	P47030	604 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	URB2	P47108	1174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	COS5	P47187	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YGR149W	P48236	432 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YGL108C	P53139	140 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YNL144C	P53907	740 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	EOS1	P53938	366 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SWF1	Q04629	336 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	RNH1	Q04740	348 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YDL057W	Q07379	328 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	COS7	Q07788	383 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.14	□□□□□ -1.75	not detected
PRX1	YBL064C	DCI1	Q08558	271 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	VPS54	Q12071	889 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.14	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YSP2	Q06681	1438 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	CHC1	P22137	1653 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	URA4	P20051	364 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YHR210C	P38893	341 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	MBB1	P39534	108 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ATF1	P40353	525 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SNG1	P46950	547 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	YNR068C	P53754	272 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SLG1	P54867	378 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	ACL4	Q03771	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PHO92	Q06390	306 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	THP1	Q08231	455 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	APC5	Q08683	685 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	UAF30	Q08747	228 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	PFA4	Q12006	378 aa		4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	CFT2	Q12102	859 aa	Predicted RBP	4.13	□□□□□ -1.75
PRX1	YBL064C	SKS1	Q12505	502 aa		4.13	□□□□□ -1.75

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