RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeastyeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR104WYKR104W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-AP0CX57 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-PR1P0CX58 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-ORP0CX59 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-PR2P0CX60 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-DR5P0CX65 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-ER2P0CX66 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-GR3P0CX67 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-LR1P0CX68 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-MR2P0CX69 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W KEX2P13134 814 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W GLC3P32775 704 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-JR2P47099 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-DR1Q03856 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W AIM7Q12156 149 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-BRQ12217 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-NL2Q12470 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W TY1A-GR2Q12485 440 aa9.58□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W SIT4P20604 311 aa9.57□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.57□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W SEC2P17065 759 aa9.56□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W NIS1P53939 407 aa9.56□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W YNL115CP53925 644 aa9.55□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W YMR196WQ04336 1088 aa9.55□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W ERG12P07277 443 aa9.54□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W AMS1P22855 1083 aa9.54□□□□□ -0.88
YKR104WYKR104W SDH2P21801 266 aa9.52□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W ERF2Q06551 359 aa9.52□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W RRN7P40992 514 aa9.51□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W FPK1P53739 893 aa9.51□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W RPN1P38764 993 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W HST2P53686 357 aa9.47□□□□□ -0.89
YKR104WYKR104W RAS1P01119 309 aa9.46□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W SLY41P22215 453 aa9.44□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W TUB4P53378 473 aa9.44□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W GLN1P32288 370 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W AGE1Q04412 482 aa9.42□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W MMP1Q12372 583 aa9.42□□□□□ -0.9
YKR104WYKR104W KIN1P13185 1064 aa9.39□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W PAC1P39946 494 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W PUS6P53294 404 aa9.37□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W SCJ1P25303 377 aa9.36□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W CST6P40535 587 aa9.36□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W BUB1P41695 1021 aaKnown RBP RIP-Chip data9.36□□□□□ -0.91not detected
YKR104WYKR104W KXD1P53158 218 aa9.36□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W TBF1Q02457 562 aa9.36□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W LAM6Q08001 693 aa9.36□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W CSN12P47130 423 aa9.35□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W BDP1P46678 594 aa9.34□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP9.34□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W TAF7Q05021 590 aa9.34□□□□□ -0.91
YKR104WYKR104W MOD5P07884 428 aa9.32□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W ESS1P22696 170 aa9.32□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W SRC1Q03707 834 aa9.32□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W SSA2P10592 639 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W TRM1P15565 570 aaKnown RBP9.3□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W TPD3P31383 635 aa9.3□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W RPA14P50106 137 aa9.3□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W TRK1P12685 1235 aa9.29□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W ALR1Q08269 859 aa9.29□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W HXT10P43581 546 aa9.28□□□□□ -0.92
YKR104WYKR104W KTR1P27810 393 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W PKH3Q03306 898 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W HED1Q03937 162 aa9.27□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W YDL206WQ12424 762 aa9.27□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W PDC1P06169 563 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W YPR097WQ06839 1073 aa9.26□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W YJU3P28321 313 aa9.25□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W RRD1P40454 393 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
YKR104WYKR104W CDC4P07834 779 aa9.21□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W ARG8P18544 423 aa9.21□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W RSC30P38781 883 aa9.21□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W CLA4P48562 842 aa9.2□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W PUS5Q06244 254 aa9.19□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W GUA1P38625 525 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W AIR1P40507 360 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W SYH1Q02875 849 aaKnown RBP9.18□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W RAD59Q12223 238 aa9.18□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W HPC2Q01448 625 aa9.17□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W LEO1P38439 464 aa9.16□□□□□ -0.94
YKR104WYKR104W KIP2P28743 706 aa9.13□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W GCR2Q01722 534 aa9.12□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W IXR1P33417 597 aa9.1□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W BRL1P38770 471 aa9.1□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W BRE2P43132 505 aa9.1□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W HST3P53687 447 aa9.09□□□□□ -0.95
YKR104WYKR104W VAC17P25591 423 aa9.08□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W MET32Q12041 191 aa9.08□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W AFT1P22149 690 aa9.07□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W ASH1P34233 588 aa9.06□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W CSE4P36012 229 aa9.06□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W MAK16P10962 306 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W RTT106P40161 455 aa9.04□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W HGH1P48362 394 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
YKR104WYKR104W TFB3Q03290 321 aa9.02□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W MRT4P33201 236 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
YKR104WYKR104W NAF1P53919 492 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 35.1 ms