RNA–Protein interactions for RNA: YHR160C

PEX18, Transcript of Peroxin, yeast

Gene PEX18, Length 852 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PEX18	YHR160C	SEC2	P17065	759 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	GCD11	P32481	527 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-JR2	P47099	440 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-DR1	Q03856	440 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-ML1	Q04706	440 aa	Known RBP	7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-BR	Q12217	440 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-NL2	Q12470	440 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TY1A-GR2	Q12485	440 aa		7.77	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	SDH2	P21801	266 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	TEA1	P47988	759 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	ERF2	Q06551	359 aa		7.76	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	KEX2	P13134	814 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	SAS4	Q04003	481 aa		7.75	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	CLB5	P30283	435 aa		7.74	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	GLC3	P32775	704 aa		7.73	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	NIS1	P53939	407 aa		7.72	□□□□□ -1.17
PEX18	YHR160C	RAS1	P01119	309 aa		7.71	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	YNR021W	P53723	404 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	ATF2	P53296	535 aa		7.69	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	SIT4	P20604	311 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	RRN7	P40992	514 aa		7.67	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	FPK1	P53739	893 aa		7.66	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	AMS1	P22855	1083 aa		7.65	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	MRF1	P30775	413 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	SPT16	P32558	1035 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
PEX18	YHR160C	LEU3	P08638	886 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	YNL115C	P53925	644 aa		7.64	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	RTF1	P53064	558 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	YMR196W	Q04336	1088 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	AGE1	Q04412	482 aa		7.62	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	ERG12	P07277	443 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	SCJ1	P25303	377 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	PAC1	P39946	494 aa	Known RBP	7.61	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	TUB4	P53378	473 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	YEL077C	Q3E7X8	1277 aa		7.61	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	CST6	P40535	587 aa		7.6	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	SRC1	Q03707	834 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	AIM7	Q12156	149 aa		7.59	□□□□□ -1.19
PEX18	YHR160C	SLY41	P22215	453 aa		7.58	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	7.58	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	HST2	P53686	357 aa		7.56	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	FRK1	Q03002	865 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	BDP1	P46678	594 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	LAM6	Q08001	693 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	MMP1	Q12372	583 aa		7.54	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	ESS1	P22696	170 aa		7.53	□□□□□ -1.2
PEX18	YHR160C	KTR1	P27810	393 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	GLN1	P32288	370 aa	Known RBP	7.52	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	CLA4	P48562	842 aa		7.52	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	MOD5	P07884	428 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	KIN1	P13185	1064 aa		7.51	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	RPN1	P38764	993 aa	Known RBP	7.51	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	YJU3	P28321	313 aa		7.5	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	AIR1	P40507	360 aa	Known RBP	7.48	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	CSN12	P47130	423 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	PUS6	P53294	404 aa		7.48	□□□□□ -1.21
PEX18	YHR160C	TBF1	Q02457	562 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	PUS5	Q06244	254 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	YDL206W	Q12424	762 aa		7.46	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	PDC1	P06169	563 aa	Known RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	TRK1	P12685	1235 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	KXD1	P53158	218 aa		7.45	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	PKH3	Q03306	898 aa	Predicted RBP	7.45	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	BUB1	P41695	1021 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.43	□□□□□ -1.22	not detected
PEX18	YHR160C	HXT10	P43581	546 aa		7.43	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	RSC30	P38781	883 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	RPA14	P50106	137 aa		7.41	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	GUA1	P38625	525 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	RRD1	P40454	393 aa	Known RBP	7.4	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	YPR097W	Q06839	1073 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	ALR1	Q08269	859 aa		7.4	□□□□□ -1.22
PEX18	YHR160C	ARG8	P18544	423 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	TPD3	P31383	635 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	HED1	Q03937	162 aa		7.39	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	CDC4	P07834	779 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	RAD59	Q12223	238 aa		7.36	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	SSA2	P10592	639 aa	Known RBP	7.34	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	MET32	Q12041	191 aa		7.34	□□□□□ -1.23
PEX18	YHR160C	SYH1	Q02875	849 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
PEX18	YHR160C	KIP2	P28743	706 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PEX18	YHR160C	ASH1	P34233	588 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PEX18	YHR160C	BRE2	P43132	505 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PEX18	YHR160C	ITT1	Q04638	464 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PEX18	YHR160C	IXR1	P33417	597 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	VAC17	P25591	423 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	HPC2	Q01448	625 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	TFB3	Q03290	321 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	AFT1	P22149	690 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	HST3	P53687	447 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	PKC1	P24583	1151 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	FIG4	P42837	879 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	MAK16	P10962	306 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	GCR2	Q01722	534 aa		7.22	□□□□□ -1.25
PEX18	YHR160C	LEO1	P38439	464 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	BRL1	P38770	471 aa		7.2	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	7.19	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	APP1	P53933	587 aa		7.19	□□□□□ -1.26
PEX18	YHR160C	TEC1	P18412	486 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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