RNA–Protein interactions for RNA: YDL057W

YDL057W, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YDL057W, Length 987 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YDL057WYDL057W THI12P42883 340 aa8.47□□□□□ -1.05
YDL057WYDL057W THI5P43534 340 aa8.47□□□□□ -1.05
YDL057WYDL057W THI11P47183 340 aa8.47□□□□□ -1.05
YDL057WYDL057W THI13Q07748 340 aa8.47□□□□□ -1.05
YDL057WYDL057W IML1P47170 1584 aa8.45□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W GLN1P32288 370 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W YAP5P40574 245 aa8.44□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W IFH1P39520 1085 aa8.43□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W CKB1P43639 278 aa8.43□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.43□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
YDL057WYDL057W IPL1P38991 367 aa8.39□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W SSP1P38871 571 aa8.37□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W VNX1P42839 908 aa8.37□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W VMR1P38735 1592 aa8.36□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W WSC3Q12215 556 aa8.35□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W MRM1P25270 412 aa8.34□□□□□ -1.07
YDL057WYDL057W PIB1Q06651 286 aa8.31□□□□□ -1.08
YDL057WYDL057W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data8.3□□□□□ -1.08not detected
YDL057WYDL057W SPP1Q03012 353 aa8.29□□□□□ -1.08
YDL057WYDL057W SRB8P25648 1427 aa8.28□□□□□ -1.08
YDL057WYDL057W TYS1P36421 394 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
YDL057WYDL057W CST9Q06032 482 aa8.27□□□□□ -1.09
YDL057WYDL057W GTT3P39996 337 aa8.26□□□□□ -1.09
YDL057WYDL057W APP1P53933 587 aa8.25□□□□□ -1.09
YDL057WYDL057W YMR074CQ04773 145 aa8.21□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W TIF11P38912 153 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W BUD21Q08492 214 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W BCK1Q01389 1478 aa8.19□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W MGA2P40578 1113 aa8.18□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W PDR11P40550 1411 aa8.15□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W VPS29P38759 282 aa8.15□□□□□ -1.1
YDL057WYDL057W PDR5P33302 1511 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W YRF1-2P40105 1681 aa8.12□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W FKH1P40466 484 aa8.12□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.12□□□□□ -1.11not detected
YDL057WYDL057W DBP1P24784 617 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W RTG3P38165 486 aa8.11□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W RCR1P38212 213 aa8.1□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W ULI1P43604 169 aa8.1□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W STS1P38637 319 aa8.09□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W IOC2Q12072 812 aa8.09□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W LDB19Q12502 818 aa8.09□□□□□ -1.11
YDL057WYDL057W ENT1Q12518 454 aa8.08□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W MRX12P47084 519 aa8.07□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W GCN2P15442 1659 aa8.06□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W YNR029CP53729 429 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W KRE5P22023 1365 aa8.06□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W SET4P42948 560 aa8.05□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W RIA1P53893 1110 aa8.05□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W YOL036WQ08206 761 aa8.05□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W ENV9Q08651 330 aa8.05□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W SSM4P40318 1319 aa8.03□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W VMA1P17255 1071 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W IMH1Q06704 911 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W MSB4Q12317 492 aa8.03□□□□□ -1.12
YDL057WYDL057W RRP5Q05022 1729 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W YJL171CP46992 396 aa8.01□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W NUP192P47054 1683 aa8.01□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W TRP5P00931 707 aaKnown RBP7.98□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W SSA1P10591 642 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W EAP1P36041 632 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
YDL057WYDL057W UBP1P25037 809 aa7.96□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W SAM3Q08986 587 aa7.95□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W RTG1P32607 177 aa7.94□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W BMT6Q12291 365 aa7.92□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W EDE1P34216 1381 aa7.91□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W TY3B-IQ7LHG5 1498 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W UGA2P38067 497 aa7.9□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W YBL086CP38177 466 aa7.9□□□□□ -1.14
YDL057WYDL057W URB1P34241 1764 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W YNL035CP53962 389 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W LEU3P08638 886 aa7.86□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W POL5P39985 1022 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W NCR1Q12200 1170 aa7.86□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W PRP45P28004 379 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W ALD4P46367 519 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W CAB1Q04430 367 aa7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W GYP5Q12344 894 aa7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W TY4B-HP0C2J7 1802 aa7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W TY4B-JP47024 1803 aa7.85□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W RPN11P43588 306 aaKnown RBP7.84□□□□□ -1.15
YDL057WYDL057W FKS3Q04952 1785 aa7.82□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W SEC61P32915 480 aa7.82□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W ALD2P47771 506 aa7.82□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W RAV1P47104 1357 aa7.82□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W RAD9P14737 1309 aa7.81□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W DCW1P36091 449 aa7.81□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W RRD1P40454 393 aaKnown RBP7.81□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W RAM2P29703 316 aa7.8□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W TAF5P38129 798 aa7.8□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W DAN4P47179 1161 aa7.8□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W SSA2P10592 639 aaKnown RBP7.79□□□□□ -1.16
YDL057WYDL057W ROM2P51862 1356 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YDL057WYDL057W HTA1P04911 132 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
YDL057WYDL057W HTA2P04912 132 aa7.77□□□□□ -1.17
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.2 ms