RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.62■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 PREX2Q70Z35 1606 aa22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa22.61■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.59■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 AKNAQ7Z591 1439 aa22.59■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 ITSN2Q9NZM3 1697 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 ARAP3Q8WWN8 1544 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.58■■□□□ 1.21
NPIPB11-202ENST00000614927 MIA2Q96PC5 1412 aa22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 NEO1Q92859 1461 aa22.56■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.56■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.54■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGRL1O94910 1474 aa22.54■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.53■■□□□ 1.2
NPIPB11-202ENST00000614927 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.51■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.5■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 RAPGEF3O95398 923 aa22.5■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ITGAEP38570 1179 aa22.49■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 AFAP1Q8N556 730 aa22.48■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC1P33527 1531 aa22.46■■□□□ 1.19
NPIPB11-202ENST00000614927 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.45■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.42■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 MBD5Q9P267 1494 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY4P0CV99 314 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 TSPY10P0CW01 314 aa22.41■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.4■■□□□ 1.18
NPIPB11-202ENST00000614927 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM6BO15054 1643 aa22.39■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC5O15440 1437 aa22.37■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 DAPK1P53355 1430 aa22.36■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.33■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
NPIPB11-202ENST00000614927 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.31■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 PTPRKQ15262 1439 aa22.3■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RICTORQ6R327 1708 aa22.29■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 KDM5CP41229 1560 aa22.27■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.27■■□□□ 1.16
NPIPB11-202ENST00000614927 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.25■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.24■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP7AQ04656 1500 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.23■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.22■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.21■■□□□ 1.15
NPIPB11-202ENST00000614927 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.2■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF15Q9NS87 1388 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 NCOA1Q15788 1441 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.19■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ROCK1Q13464 1354 aa22.17■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.16■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ATP10AO60312 1499 aa22.15■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGRL2O95490 1459 aa22.15■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.14
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCA6Q8N139 1617 aa22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.13■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 A2MP01023 1474 aa22.12■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.11■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 PLXNC1O60486 1568 aa22.1■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF3BO15066 747 aa22.09■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.08■■□□□ 1.13
NPIPB11-202ENST00000614927 HFM1A2PYH4 1435 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 NAIPQ13075 1403 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 MLECQ14165 292 aa22.07■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 GGT6Q6P531 493 aa22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.04■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 ERBINQ96RT1 1412 aa22.03■■□□□ 1.12
NPIPB11-202ENST00000614927 TRIM52Q96A61 297 aa21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 REREQ9P2R6 1566 aa21.99■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.98■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 AGLP35573 1532 aa21.96■■□□□ 1.11
NPIPB11-202ENST00000614927 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.95■■□□□ 1.1
NPIPB11-202ENST00000614927 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.7 ms