RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614927.1

NPIPB11-202, Transcript of nuclear pore complex interacting protein family member B11, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NPIPB11, Length 1,216 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB11-202ENST00000614927 NISCHQ9Y2I1 1504 aa34.71■■■■□ 3.15
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NPIPB11-202ENST00000614927 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.65■■■□□ 2.18
NPIPB11-202ENST00000614927 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.6■■■□□ 2.17
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NPIPB11-202ENST00000614927 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.75■■□□□ 1.87
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NPIPB11-202ENST00000614927 SMARCA2P51531 1590 aa26.54■■□□□ 1.84
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NPIPB11-202ENST00000614927 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.47■■□□□ 1.83
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NPIPB11-202ENST00000614927 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.99■■□□□ 1.75
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NPIPB11-202ENST00000614927 CFTRP13569 1480 aa25.68■■□□□ 1.7
NPIPB11-202ENST00000614927 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.66■■□□□ 1.7
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NPIPB11-202ENST00000614927 ERCC6Q03468 1493 aa25.53■■□□□ 1.68
NPIPB11-202ENST00000614927 FANCD2Q9BXW9 1451 aa25.49■■□□□ 1.67
NPIPB11-202ENST00000614927 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.4■■□□□ 1.66
NPIPB11-202ENST00000614927 PRDM2Q13029 1718 aa25.37■■□□□ 1.65
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.37■■□□□ 1.65
NPIPB11-202ENST00000614927 MRC2Q9UBG0 1479 aa25.26■■□□□ 1.63
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCC8Q09428 1581 aa25.19■■□□□ 1.62
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NPIPB11-202ENST00000614927 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
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NPIPB11-202ENST00000614927 SYNJ1O43426 1573 aa25.02■■□□□ 1.6
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NPIPB11-202ENST00000614927 TOP2BQ02880 1626 aa24.96■■□□□ 1.59
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NPIPB11-202ENST00000614927 WDR97A6NE52 1622 aa24.59■■□□□ 1.53
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NPIPB11-202ENST00000614927 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa24.55■■□□□ 1.52
NPIPB11-202ENST00000614927 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa24.51■■□□□ 1.51
NPIPB11-202ENST00000614927 GRIN2BQ13224 1484 aa24.51■■□□□ 1.51
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NPIPB11-202ENST00000614927 FBLN2P98095 1184 aa24.42■■□□□ 1.5
NPIPB11-202ENST00000614927 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.41■■□□□ 1.5
NPIPB11-202ENST00000614927 ERICH3Q5RHP9 1530 aa24.4■■□□□ 1.5
NPIPB11-202ENST00000614927 PBRM1Q86U86 1689 aa24.4■■□□□ 1.5
NPIPB11-202ENST00000614927 EEA1Q15075 1411 aa24.39■■□□□ 1.5
NPIPB11-202ENST00000614927 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
NPIPB11-202ENST00000614927 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
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NPIPB11-202ENST00000614927 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.31■■□□□ 1.48
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NPIPB11-202ENST00000614927 ADAMTS12P58397 1594 aa24.27■■□□□ 1.48
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NPIPB11-202ENST00000614927 PRXQ9BXM0 1461 aa24.19■■□□□ 1.46
NPIPB11-202ENST00000614927 GRIN2AQ12879 1464 aa24.19■■□□□ 1.46
NPIPB11-202ENST00000614927 OSCARQ8IYS5 282 aa24.16■■□□□ 1.46
NPIPB11-202ENST00000614927 CHD1O14646 1710 aa24.15■■□□□ 1.46
NPIPB11-202ENST00000614927 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NPIPB11-202ENST00000614927 KIF21BO75037 1637 aa24.06■■□□□ 1.44
NPIPB11-202ENST00000614927 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.04■■□□□ 1.44
NPIPB11-202ENST00000614927 GOLGA3Q08378 1498 aa24.04■■□□□ 1.44
NPIPB11-202ENST00000614927 NUP160Q12769 1436 aa24.03■■□□□ 1.44
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