RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602548.2

CENPVL1-201, Transcript of centromere protein V like 1, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CENPVL1, Length 1,620 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPVL1-201ENST00000602548 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa36.88■■■■□ 3.49
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CENPVL1-201ENST00000602548 NEO1Q92859 1461 aa36.88■■■■□ 3.49
CENPVL1-201ENST00000602548 ITSN2Q9NZM3 1697 aa36.86■■■■□ 3.49
CENPVL1-201ENST00000602548 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.85■■■■□ 3.49
CENPVL1-201ENST00000602548 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP36.84■■■■□ 3.49
CENPVL1-201ENST00000602548 PHLDB1Q86UU1 1377 aa36.83■■■■□ 3.49
CENPVL1-201ENST00000602548 MYOM3Q5VTT5 1437 aa36.79■■■■□ 3.48
CENPVL1-201ENST00000602548 AKNAQ7Z591 1439 aa36.79■■■■□ 3.48
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP36.75■■■■□ 3.47
CENPVL1-201ENST00000602548 ADGRL1O94910 1474 aa36.72■■■■□ 3.47
CENPVL1-201ENST00000602548 MIA2Q96PC5 1412 aa36.7■■■■□ 3.47
CENPVL1-201ENST00000602548 KDM6BO15054 1643 aa36.7■■■■□ 3.47
CENPVL1-201ENST00000602548 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa36.68■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.67■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.66■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 ABCC1P33527 1531 aa36.64■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP36.64■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 FGD6Q6ZV73 1430 aa36.64■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa36.64■■■■□ 3.46
CENPVL1-201ENST00000602548 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP36.62■■■■□ 3.45
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CENPVL1-201ENST00000602548 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa36.6■■■■□ 3.45
CENPVL1-201ENST00000602548 SYCP2Q9BX26 1530 aa36.58■■■■□ 3.45
CENPVL1-201ENST00000602548 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa36.57■■■■□ 3.45
CENPVL1-201ENST00000602548 RAPGEF3O95398 923 aa36.57■■■■□ 3.44
CENPVL1-201ENST00000602548 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.55■■■■□ 3.44
CENPVL1-201ENST00000602548 PTPN23Q9H3S7 1636 aa36.55■■■■□ 3.44
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CENPVL1-201ENST00000602548 RICTORQ6R327 1708 aa36.51■■■■□ 3.44
CENPVL1-201ENST00000602548 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP36.51■■■■□ 3.44
CENPVL1-201ENST00000602548 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa36.51■■■■□ 3.43
CENPVL1-201ENST00000602548 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.5■■■■□ 3.43
CENPVL1-201ENST00000602548 MBD5Q9P267 1494 aa36.49■■■■□ 3.43
CENPVL1-201ENST00000602548 AFAP1Q8N556 730 aa36.48■■■■□ 3.43
CENPVL1-201ENST00000602548 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.43■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 KDM5CP41229 1560 aa36.43■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 ARHGEF5Q12774 1597 aa36.42■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.41■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa36.41■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.41■■■■□ 3.42
CENPVL1-201ENST00000602548 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.34■■■■□ 3.41
CENPVL1-201ENST00000602548 MAGI2Q86UL8 1455 aa36.34■■■■□ 3.41
CENPVL1-201ENST00000602548 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.33■■■■□ 3.41
CENPVL1-201ENST00000602548 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.33■■■■□ 3.41
CENPVL1-201ENST00000602548 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.33■■■■□ 3.41
CENPVL1-201ENST00000602548 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.31■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 TSPY4P0CV99 314 aa36.3■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 TSPY10P0CW01 314 aa36.3■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 DAPK1P53355 1430 aa36.29■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 ABCC5O15440 1437 aa36.29■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.27■■■■□ 3.4
CENPVL1-201ENST00000602548 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.25■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 ATP7AQ04656 1500 aa36.25■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.25■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.24■■■■□ 3.39
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CENPVL1-201ENST00000602548 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.23■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.23■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.22■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.22■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.2■■■■□ 3.39
CENPVL1-201ENST00000602548 ABCA6Q8N139 1617 aa36.16■■■■□ 3.38
CENPVL1-201ENST00000602548 ITGAEP38570 1179 aa36.16■■■■□ 3.38
CENPVL1-201ENST00000602548 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.15■■■■□ 3.38
CENPVL1-201ENST00000602548 ATP10AO60312 1499 aa36.13■■■■□ 3.37
CENPVL1-201ENST00000602548 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.12■■■■□ 3.37
CENPVL1-201ENST00000602548 PTPRKQ15262 1439 aa36.11■■■■□ 3.37
CENPVL1-201ENST00000602548 PLXNC1O60486 1568 aa36.06■■■■□ 3.36
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CENPVL1-201ENST00000602548 ADGRL2O95490 1459 aa36.05■■■■□ 3.36
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CENPVL1-201ENST00000602548 REREQ9P2R6 1566 aa36.03■■■■□ 3.36
CENPVL1-201ENST00000602548 NCOA1Q15788 1441 aa36.03■■■■□ 3.36
CENPVL1-201ENST00000602548 A2MP01023 1474 aa36.02■■■■□ 3.36
CENPVL1-201ENST00000602548 KIF15Q9NS87 1388 aa36■■■■□ 3.35
CENPVL1-201ENST00000602548 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36■■■■□ 3.35
CENPVL1-201ENST00000602548 ROCK1Q13464 1354 aa35.99■■■■□ 3.35
CENPVL1-201ENST00000602548 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
CENPVL1-201ENST00000602548 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP35.96■■■■□ 3.35
CENPVL1-201ENST00000602548 DUOX2Q9NRD8 1548 aa35.94■■■■□ 3.34
CENPVL1-201ENST00000602548 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa35.94■■■■□ 3.34
CENPVL1-201ENST00000602548 AGLP35573 1532 aa35.92■■■■□ 3.34
CENPVL1-201ENST00000602548 ERBINQ96RT1 1412 aa35.86■■■■□ 3.33
CENPVL1-201ENST00000602548 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa35.82■■■■□ 3.33
CENPVL1-201ENST00000602548 KIF3BO15066 747 aa35.82■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP35.8■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP35.8■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 MLECQ14165 292 aa35.79■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 HFM1A2PYH4 1435 aa35.79■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 BCORL1Q5H9F3 1711 aa35.78■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 NAIPQ13075 1403 aa35.78■■■■□ 3.32
CENPVL1-201ENST00000602548 GGT6Q6P531 493 aa35.73■■■■□ 3.31
CENPVL1-201ENST00000602548 GCC2Q8IWJ2 1684 aa35.73■■■■□ 3.31
CENPVL1-201ENST00000602548 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP35.69■■■■□ 3.3
CENPVL1-201ENST00000602548 ADAMTSL3P82987 1691 aa35.66■■■■□ 3.3
CENPVL1-201ENST00000602548 PPP6R1Q9UPN7 881 aa35.64■■■■□ 3.3
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