RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589887.1

E2F3P1-201, Transcript of E2F transcription factor 3 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene E2F3P1, Length 1,230 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3P1-201ENST00000589887 KLHL34Q8N239 644 aa16.05■□□□□ 0.16
E2F3P1-201ENST00000589887 SHROOM2Q13796 1616 aa16.05■□□□□ 0.16
E2F3P1-201ENST00000589887 TIE1P35590 1138 aa16.03■□□□□ 0.16
E2F3P1-201ENST00000589887 TRPC6Q9Y210 931 aa16.02■□□□□ 0.16
E2F3P1-201ENST00000589887 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP16.02■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 DCAF8Q5TAQ9 597 aa16■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.99■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 GSE1Q14687 1217 aa15.98■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 FHAD1B1AJZ9 1412 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 ERICH3Q5RHP9 1530 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 IFNL1Q8IU54 200 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 SPOCK2Q92563 424 aa15.96■□□□□ 0.15
E2F3P1-201ENST00000589887 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.94■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 SLC39A7Q92504 469 aa15.93■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 C7P10643 843 aa15.92■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.91■□□□□ 0.14
E2F3P1-201ENST00000589887 PYGBP11216 843 aa15.89■□□□□ 0.13
E2F3P1-201ENST00000589887 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa15.89■□□□□ 0.13
E2F3P1-201ENST00000589887 POTEB2H3BUK9 544 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F3P1-201ENST00000589887 METRNQ9UJH8 293 aa15.87■□□□□ 0.13
E2F3P1-201ENST00000589887 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP15.85■□□□□ 0.13
E2F3P1-201ENST00000589887 POTEFA5A3E0 1075 aa15.79■□□□□ 0.12
E2F3P1-201ENST00000589887 ADCY10Q96PN6 1610 aa15.79■□□□□ 0.12
E2F3P1-201ENST00000589887 IER5LQ5T953 404 aa15.78■□□□□ 0.12
E2F3P1-201ENST00000589887 JPH4Q96JJ6 628 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F3P1-201ENST00000589887 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.77■□□□□ 0.12
E2F3P1-201ENST00000589887 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP15.76■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.76■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 DIP2BQ9P265 1576 aa15.75■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 MAPKBP1O60336 1514 aa15.75■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 TMEM106CQ9BVX2 250 aa15.75■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 OTUD5Q96G74 571 aa15.74■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 ABCC10Q5T3U5 1492 aa15.73■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 POTEJP0CG39 1038 aa15.73■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 CUL7Q14999 1698 aa15.71■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 IGF1RP08069 1367 aa15.71■□□□□ 0.11
E2F3P1-201ENST00000589887 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa15.7■□□□□ 0.1
E2F3P1-201ENST00000589887 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP15.7■□□□□ 0.1
E2F3P1-201ENST00000589887 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.67■□□□□ 0.1
E2F3P1-201ENST00000589887 KIF27Q86VH2 1401 aa15.65■□□□□ 0.1
E2F3P1-201ENST00000589887 FAM69CQ0P6D2 419 aa15.63■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 TSPOAP1O95153 1857 aa15.62■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.6■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 KDM6BO15054 1643 aa15.6■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 PSEN1P49768 467 aa15.59■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
E2F3P1-201ENST00000589887 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 SEC24BO95487 1268 aa15.57■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa15.56■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 IQGAP2Q13576 1575 aa15.56■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 ABCC2Q92887 1545 aa15.54■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 PTPRGP23470 1445 aa15.54■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 DISP1Q96F81 1524 aa15.53■□□□□ 0.08
E2F3P1-201ENST00000589887 GLI2P10070 1586 aa15.51■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa15.51■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 OCEL1Q9H607 264 aa15.51■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.51■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 TNIKQ9UKE5 1360 aa15.5■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 ASXL2Q76L83 1435 aa15.5■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 PLCG2P16885 1265 aa15.48■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.48■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa15.47■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 UGGT2Q9NYU1 1516 aa15.47■□□□□ 0.07
E2F3P1-201ENST00000589887 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.46■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 KDM5BQ9UGL1 1544 aa15.45■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 KIAA0556O60303 1618 aa15.45■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 PLB1Q6P1J6 1458 aa15.45■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.45■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 UACAQ9BZF9 1416 aa15.44■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.42■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP15.42■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
E2F3P1-201ENST00000589887 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa15.38■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 GOLGA2Q08379 1002 aa15.38■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 ADGRL1O94910 1474 aa15.36■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 PKD2Q13563 968 aa15.35■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 CABP2Q9NPB3 220 aa15.35■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 VGFO15240 615 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
E2F3P1-201ENST00000589887 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP15.32■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 WDR7Q9Y4E6 1490 aa15.32■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 ABCA8O94911 1581 aa15.32■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.3■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 CFAP43Q8NDM7 1665 aa15.28■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 PRXQ9BXM0 1461 aa15.27■□□□□ 0.04
E2F3P1-201ENST00000589887 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.26■□□□□ 0.03
E2F3P1-201ENST00000589887 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa15.25■□□□□ 0.03
E2F3P1-201ENST00000589887 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
E2F3P1-201ENST00000589887 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.7 ms