RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 TSPOAP1O95153 1857 aa23.38■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 FANCAO15360 1455 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.35■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 MIA2Q96PC5 1412 aa23.34■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.33■■□□□ 1.33
ATG4D-211ENST00000589753 CFAP74Q9C0B2 1584 aa23.32■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.31■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 NEO1Q92859 1461 aa23.3■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.28■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 AKNAQ7Z591 1439 aa23.27■■□□□ 1.32
ATG4D-211ENST00000589753 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.26■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 ADGRL1O94910 1474 aa23.24■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 ABCC1P33527 1531 aa23.23■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.21■■□□□ 1.31
ATG4D-211ENST00000589753 SYCP2Q9BX26 1530 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.19■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.18■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP23.17■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 MBD5Q9P267 1494 aa23.16■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP23.15■■□□□ 1.3
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.14■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 POGZQ7Z3K3 1410 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.12■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.11■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 DAPK1P53355 1430 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 KDM6BO15054 1643 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 RAPGEF3O95398 923 aa23.09■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 RICTORQ6R327 1708 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 AFAP1Q8N556 730 aa23.08■■□□□ 1.29
ATG4D-211ENST00000589753 ABCC5O15440 1437 aa23.08■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 KDM5CP41229 1560 aa23.06■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 TSPY4P0CV99 314 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 TSPY10P0CW01 314 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 ITGAEP38570 1179 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.05■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.03■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
ATG4D-211ENST00000589753 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa23.01■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 PTPRKQ15262 1439 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 C9orf84Q5VXU9 1444 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.99■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 ATP7AQ04656 1500 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.97■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.96■■□□□ 1.27
ATG4D-211ENST00000589753 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa22.95■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.94■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 ADGRL2O95490 1459 aa22.93■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.92■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 ROCK1Q13464 1354 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 PLXNC1O60486 1568 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 NCOA1Q15788 1441 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.91■■□□□ 1.26
ATG4D-211ENST00000589753 ABCA6Q8N139 1617 aa22.89■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.88■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa22.87■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 KIF15Q9NS87 1388 aa22.86■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 ATP10AO60312 1499 aa22.84■■□□□ 1.25
ATG4D-211ENST00000589753 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 HFM1A2PYH4 1435 aa22.82■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 A2MP01023 1474 aa22.81■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 NAIPQ13075 1403 aa22.8■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 REREQ9P2R6 1566 aa22.79■■□□□ 1.24
ATG4D-211ENST00000589753 ERBINQ96RT1 1412 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.76■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.74■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 AGLP35573 1532 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.71■■□□□ 1.23
ATG4D-211ENST00000589753 KIF3BO15066 747 aa22.69■■□□□ 1.22
ATG4D-211ENST00000589753 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.68■■□□□ 1.22
ATG4D-211ENST00000589753 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.67■■□□□ 1.22
ATG4D-211ENST00000589753 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.67■■□□□ 1.22
ATG4D-211ENST00000589753 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
ATG4D-211ENST00000589753 DEPDC5O75140 1603 aa22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.2 ms