RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589753.1

ATG4D-211, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 931 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-211ENST00000589753 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.88■■■■□ 3.33
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ATG4D-211ENST00000589753 NACADO15069 1562 aa29.65■■■□□ 2.34
ATG4D-211ENST00000589753 MYO15BQ96JP2 1530 aa29.64■■■□□ 2.34
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ATG4D-211ENST00000589753 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa28.69■■■□□ 2.18
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ATG4D-211ENST00000589753 PEG3Q9GZU2 1588 aa27.45■■□□□ 1.99
ATG4D-211ENST00000589753 SMARCA2P51531 1590 aa27.44■■□□□ 1.98
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ATG4D-211ENST00000589753 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa26.55■■□□□ 1.84
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ATG4D-211ENST00000589753 CFTRP13569 1480 aa26.54■■□□□ 1.84
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ATG4D-211ENST00000589753 FANCD2Q9BXW9 1451 aa26.29■■□□□ 1.8
ATG4D-211ENST00000589753 ERCC6Q03468 1493 aa26.25■■□□□ 1.79
ATG4D-211ENST00000589753 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa26.25■■□□□ 1.79
ATG4D-211ENST00000589753 CEP164Q9UPV0 1460 aa26.21■■□□□ 1.79
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ATG4D-211ENST00000589753 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
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ATG4D-211ENST00000589753 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
ATG4D-211ENST00000589753 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.75
ATG4D-211ENST00000589753 WDR62O43379 1518 aa25.95■■□□□ 1.74
ATG4D-211ENST00000589753 DNMBPQ6XZF7 1577 aa25.95■■□□□ 1.74
ATG4D-211ENST00000589753 TOPBP1Q92547 1522 aa25.93■■□□□ 1.74
ATG4D-211ENST00000589753 CUX1P39880 1505 aa25.92■■□□□ 1.74
ATG4D-211ENST00000589753 SYNJ1O43426 1573 aa25.86■■□□□ 1.73
ATG4D-211ENST00000589753 TOP2BQ02880 1626 aa25.85■■□□□ 1.73
ATG4D-211ENST00000589753 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.84■■□□□ 1.73
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ATG4D-211ENST00000589753 SOGA1O94964 1423 aa25.65■■□□□ 1.7
ATG4D-211ENST00000589753 IFT140Q96RY7 1462 aa25.64■■□□□ 1.69
ATG4D-211ENST00000589753 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa25.63■■□□□ 1.69
ATG4D-211ENST00000589753 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP25.59■■□□□ 1.69
ATG4D-211ENST00000589753 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa25.53■■□□□ 1.68
ATG4D-211ENST00000589753 WDR97A6NE52 1622 aa25.52■■□□□ 1.68
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ATG4D-211ENST00000589753 KIF27Q86VH2 1401 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4D-211ENST00000589753 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa25.38■■□□□ 1.65
ATG4D-211ENST00000589753 GAPVD1Q14C86 1478 aa25.36■■□□□ 1.65
ATG4D-211ENST00000589753 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.31■■□□□ 1.64
ATG4D-211ENST00000589753 GRIN2BQ13224 1484 aa25.28■■□□□ 1.64
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ATG4D-211ENST00000589753 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.23■■□□□ 1.63
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ATG4D-211ENST00000589753 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa25.18■■□□□ 1.62
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ATG4D-211ENST00000589753 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
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ATG4D-211ENST00000589753 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
ATG4D-211ENST00000589753 CHD1O14646 1710 aa24.98■■□□□ 1.59
ATG4D-211ENST00000589753 GRIN2AQ12879 1464 aa24.96■■□□□ 1.59
ATG4D-211ENST00000589753 KIF21BO75037 1637 aa24.94■■□□□ 1.58
ATG4D-211ENST00000589753 GOLGA3Q08378 1498 aa24.84■■□□□ 1.57
ATG4D-211ENST00000589753 NUP160Q12769 1436 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4D-211ENST00000589753 EHMT2Q96KQ7 1210 aa24.82■■□□□ 1.56
ATG4D-211ENST00000589753 CEP170Q5SW79 1584 aa24.81■■□□□ 1.56
ATG4D-211ENST00000589753 OSCARQ8IYS5 282 aa24.81■■□□□ 1.56
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