RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583667.1

GGA3-217, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 4

Gene GGA3, Length 531 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-217ENST00000583667 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.97■□□□□ 0.63
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GGA3-217ENST00000583667 UBAP1LF5GYI3 381 aa18.96■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 P3H3Q8IVL6 736 aa18.96■□□□□ 0.63
GGA3-217ENST00000583667 MAGI2Q86UL8 1455 aa18.96■□□□□ 0.63
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GGA3-217ENST00000583667 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa18.94■□□□□ 0.62
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GGA3-217ENST00000583667 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
GGA3-217ENST00000583667 CFAP74Q9C0B2 1584 aa18.85■□□□□ 0.61
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GGA3-217ENST00000583667 C9orf84Q5VXU9 1444 aa18.84■□□□□ 0.61
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GGA3-217ENST00000583667 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
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GGA3-217ENST00000583667 ARHGAP5Q13017 1502 aa18.44■□□□□ 0.54
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GGA3-217ENST00000583667 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.34■□□□□ 0.53
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GGA3-217ENST00000583667 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.29■□□□□ 0.52
GGA3-217ENST00000583667 GGT6Q6P531 493 aa18.29■□□□□ 0.52
GGA3-217ENST00000583667 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.29■□□□□ 0.52
GGA3-217ENST00000583667 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
GGA3-217ENST00000583667 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
GGA3-217ENST00000583667 ITSN2Q9NZM3 1697 aa18.26■□□□□ 0.51
GGA3-217ENST00000583667 LRRC7Q96NW7 1537 aa18.26■□□□□ 0.51
GGA3-217ENST00000583667 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.26■□□□□ 0.51
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