RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGAP5Q13017 1502 aa37.51■■■■□ 3.59
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCNB3Q8WWL7 1395 aa37.5■■■■□ 3.59
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PHLDB1Q86UU1 1377 aa37.49■■■■□ 3.59
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITSN2Q9NZM3 1697 aa37.49■■■■□ 3.59
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AKNAQ7Z591 1439 aa37.44■■■■□ 3.58
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa37.43■■■■□ 3.58
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP37.4■■■■□ 3.58
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRL1O94910 1474 aa37.36■■■■□ 3.57
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP37.33■■■■□ 3.57
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa37.32■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC1P33527 1531 aa37.3■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP37.28■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYOM3Q5VTT5 1437 aa37.27■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SCAPERQ9BY12 1400 aa37.27■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RICTORQ6R327 1708 aa37.27■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa37.26■■■■□ 3.56
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP37.25■■■■□ 3.55
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa37.22■■■■□ 3.55
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 POGZQ7Z3K3 1410 aa37.2■■■■□ 3.55
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MIA2Q96PC5 1412 aa37.19■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RAPGEF3O95398 923 aa37.19■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SYCP2Q9BX26 1530 aa37.19■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa37.19■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.17■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa37.17■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa37.16■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa37.14■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP37.13■■■■□ 3.54
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa37.13■■■■□ 3.53
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FGD6Q6ZV73 1430 aa37.1■■■■□ 3.53
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDM5CP41229 1560 aa37.1■■■■□ 3.53
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa37.1■■■■□ 3.53
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPN23Q9H3S7 1636 aa37.09■■■■□ 3.53
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP37.06■■■■□ 3.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MBD5Q9P267 1494 aa37.05■■■■□ 3.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AFAP1Q8N556 730 aa37.03■■■■□ 3.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF5Q12774 1597 aa37.01■■■■□ 3.52
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAGI2Q86UL8 1455 aa37.01■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 HECW2Q9P2P5 1572 aa37■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa36.98■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa36.98■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CCDC141Q6ZP82 1450 aa36.97■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.95■■■■□ 3.51
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RSPH4AQ5TD94 716 aa36.92■■■■□ 3.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.91■■■■□ 3.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 YEATS2Q9ULM3 1422 aa36.91■■■■□ 3.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP36.91■■■■□ 3.5
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP36.88■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP7AQ04656 1500 aa36.88■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP36.86■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.86■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CROCC2H7BZ55 1655 aa36.86■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCA6Q8N139 1617 aa36.85■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa36.85■■■■□ 3.49
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP36.82■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa36.81■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MAST1Q9Y2H9 1570 aa36.81■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP36.8■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ABCC5O15440 1437 aa36.79■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DAPK1P53355 1430 aa36.79■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ATP10AO60312 1499 aa36.79■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSPY4P0CV99 314 aa36.78■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 TSPY10P0CW01 314 aa36.78■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SHANK2Q9UPX8 1470 aa36.77■■■■□ 3.48
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP36.76■■■■□ 3.47
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 C9orf84Q5VXU9 1444 aa36.76■■■■□ 3.47
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 REREQ9P2R6 1566 aa36.74■■■■□ 3.47
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGBQ8N7X0 1667 aa36.72■■■■□ 3.47
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa36.71■■■■□ 3.47
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PLXNC1O60486 1568 aa36.68■■■■□ 3.46
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 A2MP01023 1474 aa36.63■■■■□ 3.45
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.59■■■■□ 3.45
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 AGLP35573 1532 aa36.59■■■■□ 3.45
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADGRL2O95490 1459 aa36.57■■■■□ 3.45
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 PTPRKQ15262 1439 aa36.57■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.56■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CHIC2Q9UKJ5 165 aa36.55■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.53■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa36.53■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ITGAEP38570 1179 aa36.51■■■■□ 3.44
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF15Q9NS87 1388 aa36.51■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 DUOX2Q9NRD8 1548 aa36.5■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 NCOA1Q15788 1441 aa36.5■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ADAMTSL3P82987 1691 aa36.47■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa36.46■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ROCK1Q13464 1354 aa36.45■■■■□ 3.43
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.44■■■■□ 3.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MLECQ14165 292 aa36.41■■■■□ 3.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ERBINQ96RT1 1412 aa36.4■■■■□ 3.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa36.39■■■■□ 3.42
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 MADDQ8WXG6 1647 aa36.38■■■■□ 3.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa36.38■■■■□ 3.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.34■■■■□ 3.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 KIF3BO15066 747 aa36.33■■■■□ 3.41
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP36.3■■■■□ 3.4
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa36.28■■■■□ 3.4
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GGT6Q6P531 493 aa36.28■■■■□ 3.4
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 GCC2Q8IWJ2 1684 aa36.27■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13 ms