RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560255.2

ST20-AS1-201, ST20 antisense RNA 1, humanhuman

BASIC

Gene ST20-AS1, Length 4,223 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST20-AS1-201ENST00000560255 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa19.08■□□□□ 0.65
ST20-AS1-201ENST00000560255 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa19.08■□□□□ 0.65
ST20-AS1-201ENST00000560255 CCDC18Q5T9S5 1454 aa19.07■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 NUDCQ9Y266 331 aa19.07■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP19.06■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.04■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 PLPPR3Q6T4P5 718 aa19.04■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.02■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.02■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 ZBTB7CA1YPR0 619 aa19.02■□□□□ 0.64
ST20-AS1-201ENST00000560255 ARID3AQ99856 593 aa19.01■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 FANCIQ9NVI1 1328 aa19.01■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 FGD6Q6ZV73 1430 aa19■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 STAG3Q9UJ98 1225 aa19■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 TOP2BQ02880 1626 aa18.99■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 NUP155O75694 1391 aa18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 PLEKHG5O94827 1062 aa18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 CUX1P39880 1505 aa18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 PDE4AP27815 886 aa18.98■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 WASHC2AQ641Q2 1341 aa18.97■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
ST20-AS1-201ENST00000560255 PDS5BQ9NTI5 1447 aa18.94■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 CFTRP13569 1480 aa18.94■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.94■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.93■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 PLCB2Q00722 1185 aa18.93■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 NESP48681 1621 aa18.93■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 WDR97A6NE52 1622 aa18.93■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa18.92■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.92■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.92■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 UACAQ9BZF9 1416 aa18.92■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.91■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 HMGXB3Q12766 1538 aa18.91■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 IL27Q8NEV9 243 aa18.91■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 MSH5O43196 834 aa18.91■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 CCDC146Q8IYE0 955 aa18.9■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 CCDC184Q52MB2 194 aa18.9■□□□□ 0.62
ST20-AS1-201ENST00000560255 ERCC6Q03468 1493 aa18.88■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.87■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 TMF1P82094 1093 aa18.87■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 ZBED9Q6R2W3 1325 aa18.86■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 KIF7Q2M1P5 1343 aa18.86■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.85■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa18.85■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.84■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 CFAP53Q96M91 514 aa18.84■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.84■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 CRBNQ96SW2 442 aa18.83■□□□□ 0.61
ST20-AS1-201ENST00000560255 CCDC7Q96M83 1385 aa18.83■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 NCOA2Q15596 1464 aa18.83■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 APBB1O00213 710 aa18.82■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 GSE1Q14687 1217 aa18.82■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 CDCA8Q53HL2 280 aa18.82■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 TIAM1Q13009 1591 aa18.82■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.81■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 RALBP1Q15311 655 aa18.81■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 HSCBQ8IWL3 235 aa18.81■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 USP47Q96K76 1375 aa18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 RRP1P56182 461 aaKnown RBP18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 NBPF8Q3BBV2 869 aa18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 BCL2L13Q9BXK5 485 aa18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP18.8■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.79■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 JPH4Q96JJ6 628 aa18.79■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 NLRP13Q86W25 1043 aa18.78■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.78■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.77■□□□□ 0.6
ST20-AS1-201ENST00000560255 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP18.75■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 GOLGA2Q08379 1002 aa18.74■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.74■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.74■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.74■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 CNTLNQ9NXG0 1405 aa18.73■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP18.73■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.73■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 MORC1Q86VD1 984 aa18.73■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 HFM1A2PYH4 1435 aa18.72■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 CDCA7LQ96GN5 454 aa18.72■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.71■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 PANK3Q9H999 370 aa18.71■□□□□ 0.59
ST20-AS1-201ENST00000560255 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ST20-AS1-201ENST00000560255 USP35Q9P2H5 1018 aa18.7■□□□□ 0.58
ST20-AS1-201ENST00000560255 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP18.7■□□□□ 0.58
ST20-AS1-201ENST00000560255 SKAP1Q86WV1 359 aa18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms