RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558180.2

IRX3-203, Transcript of iroquois homeobox 3, humanhuman

TSL 4

Gene IRX3, Length 1,540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3-203ENST00000558180 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP43.68■■■■■ 4.58
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IRX3-203ENST00000558180 CD109Q6YHK3 1445 aa43.65■■■■■ 4.58
IRX3-203ENST00000558180 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP43.65■■■■■ 4.58
IRX3-203ENST00000558180 ARHGAP5Q13017 1502 aa43.63■■■■■ 4.58
IRX3-203ENST00000558180 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP43.63■■■■■ 4.57
IRX3-203ENST00000558180 ARAP3Q8WWN8 1544 aa43.62■■■■■ 4.57
IRX3-203ENST00000558180 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP43.62■■■■■ 4.57
IRX3-203ENST00000558180 PCGF6Q9BYE7 350 aa43.6■■■■■ 4.57
IRX3-203ENST00000558180 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa43.58■■■■■ 4.57
IRX3-203ENST00000558180 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa43.56■■■■■ 4.56
IRX3-203ENST00000558180 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa43.55■■■■■ 4.56
IRX3-203ENST00000558180 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa43.5■■■■■ 4.55
IRX3-203ENST00000558180 KIF13AQ9H1H9 1805 aa43.5■■■■■ 4.55
IRX3-203ENST00000558180 FANCAO15360 1455 aa43.48■■■■■ 4.55
IRX3-203ENST00000558180 ITGAEP38570 1179 aa43.43■■■■■ 4.54
IRX3-203ENST00000558180 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa43.4■■■■■ 4.54
IRX3-203ENST00000558180 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa43.38■■■■■ 4.53
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IRX3-203ENST00000558180 AKNAQ7Z591 1439 aa43.35■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 MBD5Q9P267 1494 aa43.35■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 ABCC1P33527 1531 aa43.33■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 CFAP74Q9C0B2 1584 aa43.33■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 SYCP2Q9BX26 1530 aa43.32■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP43.32■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 ABCC5O15440 1437 aa43.32■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 DAPK1P53355 1430 aa43.32■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 NEO1Q92859 1461 aa43.32■■■■■ 4.53
IRX3-203ENST00000558180 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa43.32■■■■■ 4.52
IRX3-203ENST00000558180 PTPRKQ15262 1439 aa43.31■■■■■ 4.52
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IRX3-203ENST00000558180 TSPOAP1O95153 1857 aa43.29■■■■■ 4.52
IRX3-203ENST00000558180 ARHGEF5Q12774 1597 aa43.28■■■■■ 4.52
IRX3-203ENST00000558180 ADGRL1O94910 1474 aa43.28■■■■■ 4.52
IRX3-203ENST00000558180 RSPH4AQ5TD94 716 aa43.27■■■■■ 4.52
IRX3-203ENST00000558180 TEX14Q8IWB6 1497 aa43.25■■■■■ 4.51
IRX3-203ENST00000558180 SCAPERQ9BY12 1400 aa43.24■■■■■ 4.51
IRX3-203ENST00000558180 CCDC141Q6ZP82 1450 aa43.21■■■■■ 4.51
IRX3-203ENST00000558180 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa43.19■■■■■ 4.51
IRX3-203ENST00000558180 CHIC2Q9UKJ5 165 aa43.17■■■■■ 4.5
IRX3-203ENST00000558180 CROCC2H7BZ55 1655 aa43.15■■■■■ 4.5
IRX3-203ENST00000558180 TSPY4P0CV99 314 aa43.14■■■■■ 4.5
IRX3-203ENST00000558180 TSPY10P0CW01 314 aa43.14■■■■■ 4.5
IRX3-203ENST00000558180 SHANK2Q9UPX8 1470 aa43.12■■■■■ 4.49
IRX3-203ENST00000558180 AFAP1Q8N556 730 aa43.12■■■■■ 4.49
IRX3-203ENST00000558180 C9orf84Q5VXU9 1444 aa43.09■■■■■ 4.49
IRX3-203ENST00000558180 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP43.06■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 ROCK1Q13464 1354 aa43.05■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 POGZQ7Z3K3 1410 aa43.04■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa43.03■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 MAST1Q9Y2H9 1570 aa43.02■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 ADGRL2O95490 1459 aa43.02■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa43.01■■■■■ 4.48
IRX3-203ENST00000558180 RAPGEF3O95398 923 aa42.99■■■■■ 4.47
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IRX3-203ENST00000558180 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.97■■■■■ 4.47
IRX3-203ENST00000558180 ADGBQ8N7X0 1667 aa42.97■■■■■ 4.47
IRX3-203ENST00000558180 HFM1A2PYH4 1435 aa42.96■■■■■ 4.47
IRX3-203ENST00000558180 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa42.94■■■■■ 4.46
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IRX3-203ENST00000558180 KDM5CP41229 1560 aa42.93■■■■■ 4.46
IRX3-203ENST00000558180 SETD5Q9C0A6 1442 aa42.92■■■■■ 4.46
IRX3-203ENST00000558180 RICTORQ6R327 1708 aa42.91■■■■■ 4.46
IRX3-203ENST00000558180 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.89■■■■■ 4.46
IRX3-203ENST00000558180 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa42.88■■■■■ 4.45
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IRX3-203ENST00000558180 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP42.86■■■■■ 4.45
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IRX3-203ENST00000558180 MLH3Q9UHC1 1453 aa42.84■■■■■ 4.45
IRX3-203ENST00000558180 PLXNC1O60486 1568 aa42.83■■■■■ 4.45
IRX3-203ENST00000558180 KIF15Q9NS87 1388 aa42.83■■■■■ 4.45
IRX3-203ENST00000558180 MYT1LQ9UL68 1186 aa42.82■■■■■ 4.45
IRX3-203ENST00000558180 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa42.82■■■■■ 4.44
IRX3-203ENST00000558180 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.82■■■■■ 4.44
IRX3-203ENST00000558180 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa42.79■■■■■ 4.44
IRX3-203ENST00000558180 HECW2Q9P2P5 1572 aa42.79■■■■■ 4.44
IRX3-203ENST00000558180 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.76■■■■■ 4.44
IRX3-203ENST00000558180 HRCP23327 699 aa42.73■■■■■ 4.43
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IRX3-203ENST00000558180 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP42.38■■■■■ 4.37
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IRX3-203ENST00000558180 NUP155O75694 1391 aa42.33■■■■■ 4.37
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