RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000535353.3

CSAG2-201, Transcript of CSAG family member 2, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CSAG2, Length 237 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG2-201ENST00000535353 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa16.15■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 HECW1Q76N89 1606 aa16.15■□□□□ 0.18
CSAG2-201ENST00000535353 SETD1AO15047 1707 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 ATP10BO94823 1461 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 C9orf84Q5VXU9 1444 aa16.1■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 PIP4K2BP78356 416 aa16.09■□□□□ 0.17
CSAG2-201ENST00000535353 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa16.08■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 GOLGA3Q08378 1498 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 ALKQ9UM73 1620 aa16.07■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 ATP10AO60312 1499 aa16.06■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 TOM1O60784 492 aa16.04■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
CSAG2-201ENST00000535353 CPS1P31327 1500 aa16.02■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 PLA2R1Q13018 1463 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa16.01■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 ARID3CA6NKF2 412 aa15.98■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa15.97■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.97■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 REREQ9P2R6 1566 aa15.96■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 PTPRKQ15262 1439 aa15.96■□□□□ 0.15
CSAG2-201ENST00000535353 MYO3AQ8NEV4 1616 aa15.95■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 POTEAQ6S8J7 498 aa15.94■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.93■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 NPATQ14207 1427 aa15.93■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 MROH2AA6NES4 1674 aa15.92■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 PKD2Q13563 968 aa15.92■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 AGLP35573 1532 aa15.92■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa15.91■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa15.9■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
CSAG2-201ENST00000535353 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.89■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.88■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 KDM5CP41229 1560 aa15.87■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 CNTLNQ9NXG0 1405 aa15.86■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 ABCA6Q8N139 1617 aa15.85■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP15.84■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 NEURL4Q96JN8 1562 aa15.83■□□□□ 0.13
CSAG2-201ENST00000535353 VWDEQ8N2E2 1590 aa15.83■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP15.81■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.8■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 SYNMO15061 1565 aa15.79■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP15.78■□□□□ 0.12
CSAG2-201ENST00000535353 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.75■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP15.75■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.74■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 PLCH2O75038 1416 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 SAMD9Q5K651 1589 aa15.74■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 STRCP1A6NGW2 1772 aa15.73■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 LRRC7Q96NW7 1537 aa15.72■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP15.71■□□□□ 0.11
CSAG2-201ENST00000535353 ZMYM3Q14202 1370 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG2-201ENST00000535353 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.69■□□□□ 0.1
CSAG2-201ENST00000535353 A2ML1A8K2U0 1454 aa15.68■□□□□ 0.1
CSAG2-201ENST00000535353 PLEKHD1A6NEE1 506 aa15.67■□□□□ 0.1
CSAG2-201ENST00000535353 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa15.63■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 P3H3Q8IVL6 736 aa15.63■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 DEPDC5O75140 1603 aa15.63■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 IQGAP1P46940 1657 aa15.62■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 AFAP1Q8N556 730 aa15.61■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 MED14O60244 1454 aa15.6■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.59■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 ITSN2Q9NZM3 1697 aa15.59■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 SETBP1Q9Y6X0 1596 aa15.58■□□□□ 0.09
CSAG2-201ENST00000535353 FAM135BQ49AJ0 1406 aa15.58■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.57■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa15.57■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 TRIM52Q96A61 297 aa15.56■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.56■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 ABCC1P33527 1531 aa15.53■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 KIF14Q15058 1648 aa15.52■□□□□ 0.08
CSAG2-201ENST00000535353 PLXNC1O60486 1568 aa15.52■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 PRXQ9BXM0 1461 aa15.52■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.5■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 LRP6O75581 1613 aa15.49■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 PHLPP1O60346 1717 aa15.48■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 IFFO2Q5TF58 517 aa15.48■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 LRP5O75197 1615 aa15.47■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 ANKLE2Q86XL3 938 aa15.47■□□□□ 0.07
CSAG2-201ENST00000535353 ZRANB1Q9UGI0 708 aa15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39 ms