RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGAP5Q13017 1502 aa40.18■■■■■ 4.02
NDUFS3-211ENST00000533507 PREX2Q70Z35 1606 aa40.17■■■■■ 4.02
NDUFS3-211ENST00000533507 PLCH2O75038 1416 aa40.16■■■■■ 4.02
NDUFS3-211ENST00000533507 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa40.16■■■■■ 4.02
NDUFS3-211ENST00000533507 CD109Q6YHK3 1445 aa40.14■■■■■ 4.02
NDUFS3-211ENST00000533507 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa40.1■■■■■ 4.01
NDUFS3-211ENST00000533507 DIP2BQ9P265 1576 aa40.09■■■■■ 4.01
NDUFS3-211ENST00000533507 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP40.08■■■■■ 4.01
NDUFS3-211ENST00000533507 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa40.07■■■■■ 4.01
NDUFS3-211ENST00000533507 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.06■■■■■ 4
NDUFS3-211ENST00000533507 GLI2P10070 1586 aa40.04■■■■■ 4
NDUFS3-211ENST00000533507 FANCAO15360 1455 aa39.99■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP39.98■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa39.98■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.97■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 TRHP20396 242 aaPredicted RBP39.97■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.96■■■■□ 3.99
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.93■■■■□ 3.98
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPOAP1O95153 1857 aa39.91■■■■□ 3.98
NDUFS3-211ENST00000533507 CHIC2Q9UKJ5 165 aa39.89■■■■□ 3.98
NDUFS3-211ENST00000533507 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa39.88■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 SYCP2Q9BX26 1530 aa39.86■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 DAPK1P53355 1430 aa39.85■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 AKNAQ7Z591 1439 aa39.85■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCC5O15440 1437 aa39.83■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP39.83■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 PTPRKQ15262 1439 aa39.82■■■■□ 3.97
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRL1O94910 1474 aa39.82■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa39.82■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 CFAP74Q9C0B2 1584 aa39.81■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPY4P0CV99 314 aa39.8■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 TSPY10P0CW01 314 aa39.8■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.79■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 MBD5Q9P267 1494 aa39.79■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCC1P33527 1531 aa39.79■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa39.78■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 SCAPERQ9BY12 1400 aa39.78■■■■□ 3.96
NDUFS3-211ENST00000533507 NEO1Q92859 1461 aa39.75■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 ARHGEF5Q12774 1597 aa39.74■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC141Q6ZP82 1450 aa39.74■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.73■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 AFAP1Q8N556 730 aa39.72■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa39.71■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP39.7■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.7■■■■□ 3.95
NDUFS3-211ENST00000533507 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.67■■■■□ 3.94
NDUFS3-211ENST00000533507 CROCC2H7BZ55 1655 aa39.66■■■■□ 3.94
NDUFS3-211ENST00000533507 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.65■■■■□ 3.94
NDUFS3-211ENST00000533507 RAPGEF3O95398 923 aa39.59■■■■□ 3.93
NDUFS3-211ENST00000533507 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP39.59■■■■□ 3.93
NDUFS3-211ENST00000533507 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.59■■■■□ 3.93
NDUFS3-211ENST00000533507 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP39.58■■■■□ 3.93
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa39.57■■■■□ 3.93
NDUFS3-211ENST00000533507 ROCK1Q13464 1354 aa39.55■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.55■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.55■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.54■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.53■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 NCOA1Q15788 1441 aa39.52■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 HFM1A2PYH4 1435 aa39.51■■■■□ 3.92
NDUFS3-211ENST00000533507 NAIPQ13075 1403 aa39.49■■■■□ 3.91
NDUFS3-211ENST00000533507 ADGRL2O95490 1459 aa39.48■■■■□ 3.91
NDUFS3-211ENST00000533507 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa39.47■■■■□ 3.91
NDUFS3-211ENST00000533507 MAST1Q9Y2H9 1570 aa39.47■■■■□ 3.91
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF15Q9NS87 1388 aa39.43■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa39.41■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 RICTORQ6R327 1708 aa39.39■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP7AQ04656 1500 aa39.39■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.38■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 GCC2Q8IWJ2 1684 aa39.38■■■■□ 3.9
NDUFS3-211ENST00000533507 KDM5CP41229 1560 aa39.38■■■■□ 3.89
NDUFS3-211ENST00000533507 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP39.35■■■■□ 3.89
NDUFS3-211ENST00000533507 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.34■■■■□ 3.89
NDUFS3-211ENST00000533507 PLXNC1O60486 1568 aa39.33■■■■□ 3.89
NDUFS3-211ENST00000533507 HECW2Q9P2P5 1572 aa39.32■■■■□ 3.89
NDUFS3-211ENST00000533507 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa39.31■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa39.31■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 MLH3Q9UHC1 1453 aa39.31■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa39.31■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 KDM6BO15054 1643 aa39.29■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM52Q96A61 297 aa39.27■■■■□ 3.88
NDUFS3-211ENST00000533507 HRCP23327 699 aa39.26■■■■□ 3.87
NDUFS3-211ENST00000533507 DUOX2Q9NRD8 1548 aa39.24■■■■□ 3.87
NDUFS3-211ENST00000533507 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP39.2■■■■□ 3.87
NDUFS3-211ENST00000533507 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa39.19■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 YEATS2Q9ULM3 1422 aa39.19■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCA6Q8N139 1617 aa39.15■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP39.14■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 MAGI2Q86UL8 1455 aa39.14■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 ERBINQ96RT1 1412 aa39.14■■■■□ 3.86
NDUFS3-211ENST00000533507 A2MP01023 1474 aa39.13■■■■□ 3.85
NDUFS3-211ENST00000533507 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP39.1■■■■□ 3.85
NDUFS3-211ENST00000533507 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa39.1■■■■□ 3.85
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF3BO15066 747 aa39.09■■■■□ 3.85
NDUFS3-211ENST00000533507 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP39.07■■■■□ 3.84
NDUFS3-211ENST00000533507 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP39.04■■■■□ 3.84
NDUFS3-211ENST00000533507 NUP155O75694 1391 aa39.03■■■■□ 3.84
NDUFS3-211ENST00000533507 ATP10AO60312 1499 aa39.02■■■■□ 3.84
NDUFS3-211ENST00000533507 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP38.97■■■■□ 3.83
NDUFS3-211ENST00000533507 MPHOSPH9Q99550 1183 aa38.96■■■■□ 3.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.8 ms