RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533507.5

NDUFS3-211, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase core subunit S3, humanhuman

TSL 2

Gene NDUFS3, Length 1,769 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS3-211ENST00000533507 NISCHQ9Y2I1 1504 aa61.5■■■■■ 7.44
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa53.98■■■■■ 6.23
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCC9O60706 1549 aa51.94■■■■■ 5.9
NDUFS3-211ENST00000533507 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP51.46■■■■■ 5.83
NDUFS3-211ENST00000533507 DCAF8L2P0C7V8 631 aa51.39■■■■■ 5.82
NDUFS3-211ENST00000533507 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa50.77■■■■■ 5.72
NDUFS3-211ENST00000533507 NACADO15069 1562 aa50.51■■■■■ 5.68
NDUFS3-211ENST00000533507 MYO15BQ96JP2 1530 aa50.47■■■■■ 5.67
NDUFS3-211ENST00000533507 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa50.31■■■■■ 5.64
NDUFS3-211ENST00000533507 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa49.78■■■■■ 5.56
NDUFS3-211ENST00000533507 SCRIBQ14160 1630 aa49.64■■■■■ 5.54
NDUFS3-211ENST00000533507 UNC13AQ9UPW8 1703 aa49.2■■■■■ 5.47
NDUFS3-211ENST00000533507 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP48.87■■■■■ 5.41
NDUFS3-211ENST00000533507 BICRAQ9NZM4 1560 aa48.72■■■■■ 5.39
NDUFS3-211ENST00000533507 CECR2Q9BXF3 1484 aa47.88■■■■■ 5.26
NDUFS3-211ENST00000533507 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP47.58■■■■■ 5.21
NDUFS3-211ENST00000533507 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP47.54■■■■■ 5.2
NDUFS3-211ENST00000533507 MROH2BQ7Z745 1585 aa47.5■■■■■ 5.19
NDUFS3-211ENST00000533507 SMARCA4P51532 1647 aa47.45■■■■■ 5.19
NDUFS3-211ENST00000533507 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP47.41■■■■■ 5.18
NDUFS3-211ENST00000533507 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP47.39■■■■■ 5.18
NDUFS3-211ENST00000533507 WIZO95785 1651 aa47.09■■■■■ 5.13
NDUFS3-211ENST00000533507 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa46.92■■■■■ 5.1
NDUFS3-211ENST00000533507 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa46.9■■■■■ 5.1
NDUFS3-211ENST00000533507 SMARCA2P51531 1590 aa46.86■■■■■ 5.09
NDUFS3-211ENST00000533507 PEG3Q9GZU2 1588 aa46.83■■■■■ 5.09
NDUFS3-211ENST00000533507 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP46.64■■■■■ 5.06
NDUFS3-211ENST00000533507 NCAPD3P42695 1498 aa46.61■■■■■ 5.05
NDUFS3-211ENST00000533507 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP46.54■■■■■ 5.04
NDUFS3-211ENST00000533507 DNAJC5BQ9UF47 199 aa46.53■■■■■ 5.04
NDUFS3-211ENST00000533507 HMGXB3Q12766 1538 aa46.45■■■■■ 5.03
NDUFS3-211ENST00000533507 CCDC88BA6NC98 1476 aa46.1■■■■■ 4.97
NDUFS3-211ENST00000533507 CADPSQ9ULU8 1353 aa45.42■■■■■ 4.86
NDUFS3-211ENST00000533507 CFTRP13569 1480 aa45.36■■■■■ 4.85
NDUFS3-211ENST00000533507 NESP48681 1621 aa45.3■■■■■ 4.84
NDUFS3-211ENST00000533507 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa45.19■■■■■ 4.82
NDUFS3-211ENST00000533507 PRDM2Q13029 1718 aa45.04■■■■■ 4.8
NDUFS3-211ENST00000533507 CHIC1Q5VXU3 224 aa44.94■■■■■ 4.78
NDUFS3-211ENST00000533507 PDS5BQ9NTI5 1447 aa44.93■■■■■ 4.78
NDUFS3-211ENST00000533507 FANCD2Q9BXW9 1451 aa44.92■■■■■ 4.78
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCC8Q09428 1581 aa44.89■■■■■ 4.78
NDUFS3-211ENST00000533507 TRIM41Q8WV44 630 aa44.74■■■■■ 4.75
NDUFS3-211ENST00000533507 CEP164Q9UPV0 1460 aa44.73■■■■■ 4.75
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa44.72■■■■■ 4.75
NDUFS3-211ENST00000533507 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP44.7■■■■■ 4.75
NDUFS3-211ENST00000533507 ERCC6Q03468 1493 aa44.67■■■■■ 4.74
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNJ1O43426 1573 aa44.5■■■■■ 4.71
NDUFS3-211ENST00000533507 CUX1P39880 1505 aa44.46■■■■■ 4.71
NDUFS3-211ENST00000533507 TOP2BQ02880 1626 aa44.37■■■■■ 4.69
NDUFS3-211ENST00000533507 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP44.36■■■■■ 4.69
NDUFS3-211ENST00000533507 MRC2Q9UBG0 1479 aa44.36■■■■■ 4.69
NDUFS3-211ENST00000533507 DNMBPQ6XZF7 1577 aa44.33■■■■■ 4.69
NDUFS3-211ENST00000533507 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa44.32■■■■■ 4.68
NDUFS3-211ENST00000533507 TOPBP1Q92547 1522 aa44.31■■■■■ 4.68
NDUFS3-211ENST00000533507 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP44.15■■■■■ 4.66
NDUFS3-211ENST00000533507 FGD5Q6ZNL6 1462 aa44.15■■■■■ 4.66
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR62O43379 1518 aa44.11■■■■■ 4.65
NDUFS3-211ENST00000533507 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP44.04■■■■■ 4.64
NDUFS3-211ENST00000533507 SOGA1O94964 1423 aa43.95■■■■■ 4.63
NDUFS3-211ENST00000533507 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP43.95■■■■■ 4.63
NDUFS3-211ENST00000533507 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa43.93■■■■■ 4.62
NDUFS3-211ENST00000533507 CUX2O14529 1486 aa43.79■■■■■ 4.6
NDUFS3-211ENST00000533507 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa43.75■■■■■ 4.59
NDUFS3-211ENST00000533507 IFT140Q96RY7 1462 aa43.69■■■■■ 4.59
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa43.69■■■■■ 4.58
NDUFS3-211ENST00000533507 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP43.67■■■■■ 4.58
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF27Q86VH2 1401 aa43.66■■■■■ 4.58
NDUFS3-211ENST00000533507 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP43.62■■■■■ 4.57
NDUFS3-211ENST00000533507 EEA1Q15075 1411 aa43.58■■■■■ 4.57
NDUFS3-211ENST00000533507 WDR97A6NE52 1622 aa43.57■■■■■ 4.57
NDUFS3-211ENST00000533507 CSRNP3Q8WYN3 585 aa43.53■■■■■ 4.56
NDUFS3-211ENST00000533507 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP43.49■■■■■ 4.55
NDUFS3-211ENST00000533507 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP43.46■■■■■ 4.551e-6■■■■□ 23.2
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NDUFS3-211ENST00000533507 GAPVD1Q14C86 1478 aa43.43■■■■■ 4.54
NDUFS3-211ENST00000533507 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa43.37■■■■■ 4.53
NDUFS3-211ENST00000533507 IGF1RP08069 1367 aa43.33■■■■■ 4.53
NDUFS3-211ENST00000533507 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP43.3■■■■■ 4.52
NDUFS3-211ENST00000533507 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa43.26■■■■■ 4.52
NDUFS3-211ENST00000533507 GRIN2BQ13224 1484 aa43.2■■■■■ 4.51
NDUFS3-211ENST00000533507 PBRM1Q86U86 1689 aa43.2■■■■■ 4.51
NDUFS3-211ENST00000533507 ERICH3Q5RHP9 1530 aa43.18■■■■■ 4.5
NDUFS3-211ENST00000533507 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa43.14■■■■■ 4.5
NDUFS3-211ENST00000533507 PRXQ9BXM0 1461 aa43.07■■■■■ 4.48
NDUFS3-211ENST00000533507 CUL7Q14999 1698 aa43.04■■■■■ 4.48
NDUFS3-211ENST00000533507 KIF21BO75037 1637 aa43.03■■■■■ 4.48
NDUFS3-211ENST00000533507 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa43.02■■■■■ 4.48
NDUFS3-211ENST00000533507 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa43.01■■■■■ 4.48
NDUFS3-211ENST00000533507 UBTFP17480 764 aaKnown RBP43.01■■■■■ 4.47
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NDUFS3-211ENST00000533507 FHAD1B1AJZ9 1412 aa42.93■■■■■ 4.46
NDUFS3-211ENST00000533507 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP42.91■■■■■ 4.46
NDUFS3-211ENST00000533507 FBLN2P98095 1184 aa42.9■■■■■ 4.46
NDUFS3-211ENST00000533507 ADAMTS12P58397 1594 aa42.9■■■■■ 4.46
NDUFS3-211ENST00000533507 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP42.85■■■■■ 4.45
NDUFS3-211ENST00000533507 SYNJ2O15056 1496 aa42.76■■■■■ 4.44
NDUFS3-211ENST00000533507 TNIKQ9UKE5 1360 aa42.67■■■■■ 4.42
NDUFS3-211ENST00000533507 GRIN2AQ12879 1464 aa42.66■■■■■ 4.42
NDUFS3-211ENST00000533507 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP42.64■■■■■ 4.42
NDUFS3-211ENST00000533507 CHD1O14646 1710 aa42.54■■■■■ 4.4
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