RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495756.5

ATG3-208, Transcript of autophagy related 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG3, Length 1,455 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3-208ENST00000495756 ARHGAP5Q13017 1502 aa29.97■■■□□ 2.39
ATG3-208ENST00000495756 TSPOAP1O95153 1857 aa29.95■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 FGD6Q6ZV73 1430 aa29.95■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 MIA2Q96PC5 1412 aa29.95■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 FANCAO15360 1455 aa29.92■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.92■■■□□ 2.38
ATG3-208ENST00000495756 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 TEX14Q8IWB6 1497 aa29.88■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 CFAP74Q9C0B2 1584 aa29.87■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 PTPN23Q9H3S7 1636 aa29.86■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP29.85■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa29.85■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 NEO1Q92859 1461 aa29.85■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa29.83■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
ATG3-208ENST00000495756 AKNAQ7Z591 1439 aa29.82■■■□□ 2.36
ATG3-208ENST00000495756 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa29.78■■■□□ 2.36
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ATG3-208ENST00000495756 ADGRL1O94910 1474 aa29.78■■■□□ 2.36
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ATG3-208ENST00000495756 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa29.76■■■□□ 2.35
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ATG3-208ENST00000495756 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.74■■■□□ 2.35
ATG3-208ENST00000495756 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29.73■■■□□ 2.35
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ATG3-208ENST00000495756 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.72■■■□□ 2.35
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ATG3-208ENST00000495756 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.65■■■□□ 2.34
ATG3-208ENST00000495756 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.64■■■□□ 2.34
ATG3-208ENST00000495756 POGZQ7Z3K3 1410 aa29.63■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.63■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 ABCC5O15440 1437 aa29.62■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 DAPK1P53355 1430 aa29.61■■■□□ 2.33
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ATG3-208ENST00000495756 AFAP1Q8N556 730 aa29.61■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa29.6■■■□□ 2.33
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ATG3-208ENST00000495756 RICTORQ6R327 1708 aa29.59■■■□□ 2.33
ATG3-208ENST00000495756 ITGAEP38570 1179 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 CROCC2H7BZ55 1655 aa29.57■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa29.56■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 KDM6BO15054 1643 aa29.56■■■□□ 2.32
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ATG3-208ENST00000495756 TSPY4P0CV99 314 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 TSPY10P0CW01 314 aa29.54■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 SHANK2Q9UPX8 1470 aa29.53■■■□□ 2.32
ATG3-208ENST00000495756 C9orf84Q5VXU9 1444 aa29.51■■■□□ 2.31
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ATG3-208ENST00000495756 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.47■■■□□ 2.31
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ATG3-208ENST00000495756 HECW2Q9P2P5 1572 aa29.46■■■□□ 2.31
ATG3-208ENST00000495756 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.45■■■□□ 2.31
ATG3-208ENST00000495756 ATP7AQ04656 1500 aa29.44■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.43■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.43■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 ADGRL2O95490 1459 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.42■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 ROCK1Q13464 1354 aa29.4■■■□□ 2.3
ATG3-208ENST00000495756 NCOA1Q15788 1441 aa29.4■■■□□ 2.3
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ATG3-208ENST00000495756 ABCA6Q8N139 1617 aa29.34■■■□□ 2.29
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ATG3-208ENST00000495756 KIF15Q9NS87 1388 aa29.32■■■□□ 2.28
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ATG3-208ENST00000495756 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa29.31■■■□□ 2.28
ATG3-208ENST00000495756 HFM1A2PYH4 1435 aa29.3■■■□□ 2.28
ATG3-208ENST00000495756 NAIPQ13075 1403 aa29.27■■■□□ 2.28
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ATG3-208ENST00000495756 ATP10AO60312 1499 aa29.26■■■□□ 2.27
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ATG3-208ENST00000495756 A2MP01023 1474 aa29.25■■■□□ 2.27
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ATG3-208ENST00000495756 REREQ9P2R6 1566 aa29.2■■■□□ 2.27
ATG3-208ENST00000495756 ERBINQ96RT1 1412 aa29.19■■■□□ 2.26
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ATG3-208ENST00000495756 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.13■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa29.12■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa29.11■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 AGLP35573 1532 aa29.1■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 BCORL1Q5H9F3 1711 aa29.09■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 KIF3BO15066 747 aa29.08■■■□□ 2.25
ATG3-208ENST00000495756 HRCP23327 699 aa29.04■■■□□ 2.24
ATG3-208ENST00000495756 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.02■■■□□ 2.24
ATG3-208ENST00000495756 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.02■■■□□ 2.24
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