RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489697.1

RAI1-204, Transcript of retinoic acid induced 1, humanhuman

TSL 3

Gene RAI1, Length 1,570 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAI1-204ENST00000489697 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 FANCAO15360 1455 aa24.62■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 ARAP3Q8WWN8 1544 aa24.62■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa24.62■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.59■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 ITSN2Q9NZM3 1697 aa24.59■■□□□ 1.53
RAI1-204ENST00000489697 NEO1Q92859 1461 aa24.58■■□□□ 1.52
RAI1-204ENST00000489697 AKNAQ7Z591 1439 aa24.56■■□□□ 1.52
RAI1-204ENST00000489697 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.54■■□□□ 1.52
RAI1-204ENST00000489697 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
RAI1-204ENST00000489697 MIA2Q96PC5 1412 aa24.52■■□□□ 1.52
RAI1-204ENST00000489697 ADGRL1O94910 1474 aa24.51■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.5■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.5■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 SCAPERQ9BY12 1400 aa24.48■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.46■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
RAI1-204ENST00000489697 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP24.45■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 ABCC1P33527 1531 aa24.45■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.44■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.44■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.43■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.43■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP24.43■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 KDM6BO15054 1643 aa24.43■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 RAPGEF3O95398 923 aa24.42■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.42■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.4■■□□□ 1.5
RAI1-204ENST00000489697 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.39■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 AFAP1Q8N556 730 aa24.38■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.38■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 MBD5Q9P267 1494 aa24.38■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.34■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 RICTORQ6R327 1708 aa24.34■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.33■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.33■■□□□ 1.49
RAI1-204ENST00000489697 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.31■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.31■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.3■■□□□ 1.481e-6■■□□□ 13.5
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RAI1-204ENST00000489697 ABCC5O15440 1437 aa24.28■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.28■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 TSPY4P0CV99 314 aa24.27■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 TSPY10P0CW01 314 aa24.27■■□□□ 1.48
RAI1-204ENST00000489697 DAPK1P53355 1430 aa24.26■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.26■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 ITGAEP38570 1179 aa24.25■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.23■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.21■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.21■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.21■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.2■■□□□ 1.47
RAI1-204ENST00000489697 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.2■■□□□ 1.46
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RAI1-204ENST00000489697 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 PTPRKQ15262 1439 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.16■■□□□ 1.46
RAI1-204ENST00000489697 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.13■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 ABCA6Q8N139 1617 aa24.12■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.12■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.1■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 ATP10AO60312 1499 aa24.1■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.1■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 ADGRL2O95490 1459 aa24.09■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 NCOA1Q15788 1441 aa24.08■■□□□ 1.45
RAI1-204ENST00000489697 PLXNC1O60486 1568 aa24.06■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.06■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 ROCK1Q13464 1354 aa24.06■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 KIF15Q9NS87 1388 aa24.06■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 A2MP01023 1474 aa24.04■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
RAI1-204ENST00000489697 REREQ9P2R6 1566 aa24■■□□□ 1.43
RAI1-204ENST00000489697 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
RAI1-204ENST00000489697 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.99■■□□□ 1.43
RAI1-204ENST00000489697 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.98■■□□□ 1.43
RAI1-204ENST00000489697 AGLP35573 1532 aa23.94■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 NAIPQ13075 1403 aa23.94■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 ERBINQ96RT1 1412 aa23.94■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.94■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 KIF3BO15066 747 aa23.94■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 HFM1A2PYH4 1435 aa23.93■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 MLECQ14165 292 aa23.92■■□□□ 1.42
RAI1-204ENST00000489697 GGT6Q6P531 493 aa23.89■■□□□ 1.41
RAI1-204ENST00000489697 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.88■■□□□ 1.41
RAI1-204ENST00000489697 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
RAI1-204ENST00000489697 SETD5Q9C0A6 1442 aa23.84■■□□□ 1.41
RAI1-204ENST00000489697 BCORL1Q5H9F3 1711 aa23.84■■□□□ 1.41
RAI1-204ENST00000489697 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.82■■□□□ 1.4
RAI1-204ENST00000489697 PCGF6Q9BYE7 350 aa23.82■■□□□ 1.4
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