RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487476.5

NF1-211, Transcript of neurofibromin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NF1, Length 2,265 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NF1-211ENST00000487476 PREX2Q70Z35 1606 aa25.77■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.77■■□□□ 1.72
NF1-211ENST00000487476 TRHP20396 242 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 MYO5CQ9NQX4 1742 aa25.76■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.75■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 KIF13AQ9H1H9 1805 aa25.74■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa25.74■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 PTPN23Q9H3S7 1636 aa25.73■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa25.73■■□□□ 1.71
NF1-211ENST00000487476 FANCAO15360 1455 aa25.7■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.7■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP25.7■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 ITGAEP38570 1179 aa25.69■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.68■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.67■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.67■■□□□ 1.72e-6■■■■□ 25.4
NF1-211ENST00000487476 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.67■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 TSPOAP1O95153 1857 aa25.65■■□□□ 1.7
NF1-211ENST00000487476 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.64■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 AKNAQ7Z591 1439 aa25.62■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa25.62■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 SYCP2Q9BX26 1530 aa25.59■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 MBD5Q9P267 1494 aa25.59■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 PTPRKQ15262 1439 aa25.58■■□□□ 1.69
NF1-211ENST00000487476 ADGRL1O94910 1474 aa25.57■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.57■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 ABCC1P33527 1531 aa25.56■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 NEO1Q92859 1461 aa25.56■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.56■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 ABCC5O15440 1437 aa25.56■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 DAPK1P53355 1430 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 AFAP1Q8N556 730 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 TEX14Q8IWB6 1497 aa25.54■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.52■■□□□ 1.68
NF1-211ENST00000487476 RAPGEF3O95398 923 aa25.51■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.5■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 ARHGEF5Q12774 1597 aa25.48■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 CCDC141Q6ZP82 1450 aa25.48■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.47■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 HRCP23327 699 aa25.46■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 TSPY4P0CV99 314 aa25.46■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 TSPY10P0CW01 314 aa25.46■■□□□ 1.67
NF1-211ENST00000487476 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.43■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 C9orf84Q5VXU9 1444 aa25.42■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.42■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.4■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.39■■□□□ 1.66
NF1-211ENST00000487476 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.38■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.36■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 NCOA1Q15788 1441 aa25.35■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.35■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 RICTORQ6R327 1708 aa25.34■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 ROCK1Q13464 1354 aa25.33■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 KDM5CP41229 1560 aa25.33■■□□□ 1.65
NF1-211ENST00000487476 ADGRL2O95490 1459 aa25.32■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.32■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.31■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.31■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 NAIPQ13075 1403 aa25.3■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.3■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 HFM1A2PYH4 1435 aa25.29■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 ATP7AQ04656 1500 aa25.29■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 KIF15Q9NS87 1388 aa25.28■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.28■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 MLH3Q9UHC1 1453 aa25.28■■□□□ 1.64
NF1-211ENST00000487476 ADGBQ8N7X0 1667 aa25.26■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.26■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 SETD5Q9C0A6 1442 aa25.26■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 YEATS2Q9ULM3 1422 aa25.25■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 HECW2Q9P2P5 1572 aa25.25■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 KDM6BO15054 1643 aa25.24■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa25.23■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa25.23■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 PLXNC1O60486 1568 aa25.22■■□□□ 1.63
NF1-211ENST00000487476 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.19■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 ABCA6Q8N139 1617 aa25.18■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.17■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.17■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.15■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa25.15■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
NF1-211ENST00000487476 A2MP01023 1474 aa25.13■■□□□ 1.61
NF1-211ENST00000487476 ATP10AO60312 1499 aa25.1■■□□□ 1.61
NF1-211ENST00000487476 ERBINQ96RT1 1412 aa25.09■■□□□ 1.61
NF1-211ENST00000487476 KIF3BO15066 747 aa25.08■■□□□ 1.61
NF1-211ENST00000487476 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.07■■□□□ 1.6
NF1-211ENST00000487476 TRIM52Q96A61 297 aa25.07■■□□□ 1.6
NF1-211ENST00000487476 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
NF1-211ENST00000487476 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.01■■□□□ 1.59
NF1-211ENST00000487476 GGT6Q6P531 493 aa24.99■■□□□ 1.59
NF1-211ENST00000487476 NUP155O75694 1391 aa24.99■■□□□ 1.59
NF1-211ENST00000487476 REREQ9P2R6 1566 aa24.96■■□□□ 1.59
NF1-211ENST00000487476 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms