RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478545.1

HIVEP1-204, Transcript of human immunodeficiency virus type I enhancer binding protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene HIVEP1, Length 576 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGAP5Q13017 1502 aa25.17■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 AKNAQ7Z591 1439 aa25.17■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 PHLDB1Q86UU1 1377 aa25.17■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 NEO1Q92859 1461 aa25.16■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.14■■□□□ 1.62
HIVEP1-204ENST00000478545 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
HIVEP1-204ENST00000478545 PREX2Q70Z35 1606 aa25.13■■□□□ 1.61
HIVEP1-204ENST00000478545 KDM6BO15054 1643 aa25.12■■□□□ 1.61
HIVEP1-204ENST00000478545 CFAP74Q9C0B2 1584 aa25.11■■□□□ 1.61
HIVEP1-204ENST00000478545 RAPGEF3O95398 923 aa25.09■■□□□ 1.61
HIVEP1-204ENST00000478545 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.07■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 ADGRL1O94910 1474 aa25.06■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.06■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.61e-6■■■■□ 22.7
HIVEP1-204ENST00000478545 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 MYOM3Q5VTT5 1437 aa25.03■■□□□ 1.6
HIVEP1-204ENST00000478545 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa25.01■■□□□ 1.59
HIVEP1-204ENST00000478545 AFAP1Q8N556 730 aa25■■□□□ 1.59
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa24.98■■□□□ 1.59
HIVEP1-204ENST00000478545 MIA2Q96PC5 1412 aa24.96■■□□□ 1.59
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC1P33527 1531 aa24.96■■□□□ 1.59
HIVEP1-204ENST00000478545 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa24.95■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 RICTORQ6R327 1708 aa24.95■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa24.95■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa24.95■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 MYT1LQ9UL68 1186 aa24.93■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa24.93■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 POGZQ7Z3K3 1410 aa24.93■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.92■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.92■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.92■■□□□ 1.58
HIVEP1-204ENST00000478545 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.89■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa24.89■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.88■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 MBD5Q9P267 1494 aa24.88■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP24.85■■□□□ 1.57
HIVEP1-204ENST00000478545 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 TSPY4P0CV99 314 aa24.82■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 TSPY10P0CW01 314 aa24.82■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa24.81■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 KDM5CP41229 1560 aa24.81■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 MAGI2Q86UL8 1455 aa24.8■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.79■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.78■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 MLH3Q9UHC1 1453 aa24.78■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.78■■□□□ 1.56
HIVEP1-204ENST00000478545 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa24.76■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.76■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCC5O15440 1437 aa24.74■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa24.74■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ITGAEP38570 1179 aa24.72■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.72■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ATP10AO60312 1499 aa24.71■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 DAPK1P53355 1430 aa24.71■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ATP7AQ04656 1500 aa24.71■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa24.7■■□□□ 1.55
HIVEP1-204ENST00000478545 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.7■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.68■■□□□ 1.544e-7■■■■■ 35.6
HIVEP1-204ENST00000478545 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.68■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 ABCA6Q8N139 1617 aa24.67■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa24.66■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.64■■□□□ 1.54
HIVEP1-204ENST00000478545 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.63■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.62■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 PTPRKQ15262 1439 aa24.61■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.6■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 MLECQ14165 292 aa24.6■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 A2MP01023 1474 aa24.59■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa24.58■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.58■■□□□ 1.53
HIVEP1-204ENST00000478545 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.57■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 REREQ9P2R6 1566 aa24.54■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 NCOA1Q15788 1441 aa24.54■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF15Q9NS87 1388 aa24.54■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa24.53■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 PLXNC1O60486 1568 aa24.52■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 KIF3BO15066 747 aa24.52■■□□□ 1.52
HIVEP1-204ENST00000478545 ADGRL2O95490 1459 aa24.51■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 AGLP35573 1532 aa24.51■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 GGT6Q6P531 493 aa24.5■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 ROCK1Q13464 1354 aa24.48■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.48■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.48■■□□□ 1.51
HIVEP1-204ENST00000478545 ADAMTSL3P82987 1691 aa24.41■■□□□ 1.5
HIVEP1-204ENST00000478545 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP24.41■■□□□ 1.5
HIVEP1-204ENST00000478545 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.4■■□□□ 1.5
HIVEP1-204ENST00000478545 ERBINQ96RT1 1412 aa24.39■■□□□ 1.5
HIVEP1-204ENST00000478545 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.39■■□□□ 1.49
HIVEP1-204ENST00000478545 PPP6R1Q9UPN7 881 aa24.37■■□□□ 1.49
HIVEP1-204ENST00000478545 MADDQ8WXG6 1647 aa24.35■■□□□ 1.49
HIVEP1-204ENST00000478545 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.3 ms