RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472040.1

GREB1-209, Transcript of growth regulating estrogen receptor binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene GREB1, Length 571 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1-209ENST00000472040 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa22.47■■□□□ 1.19
GREB1-209ENST00000472040 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.47■■□□□ 1.19
GREB1-209ENST00000472040 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.44■■□□□ 1.18
GREB1-209ENST00000472040 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa22.43■■□□□ 1.18
GREB1-209ENST00000472040 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
GREB1-209ENST00000472040 ARHGAP5Q13017 1502 aa22.41■■□□□ 1.18
GREB1-209ENST00000472040 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa22.4■■□□□ 1.18
GREB1-209ENST00000472040 RSPH4AQ5TD94 716 aa22.39■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 TEX14Q8IWB6 1497 aa22.39■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 NEO1Q92859 1461 aa22.39■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa22.39■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 CFAP74Q9C0B2 1584 aa22.38■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 FANCAO15360 1455 aa22.38■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.38■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 AKNAQ7Z591 1439 aa22.33■■□□□ 1.17
GREB1-209ENST00000472040 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.33■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa22.32■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 ABCC1P33527 1531 aa22.28■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.28■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 MBD5Q9P267 1494 aa22.28■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 ADGRL1O94910 1474 aa22.27■■□□□ 1.16
GREB1-209ENST00000472040 SCAPERQ9BY12 1400 aa22.25■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 TSPOAP1O95153 1857 aa22.24■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa22.22■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 CCDC141Q6ZP82 1450 aa22.22■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 SYCP2Q9BX26 1530 aa22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 TSPY4P0CV99 314 aa22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 TSPY10P0CW01 314 aa22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 ABCC5O15440 1437 aa22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 DAPK1P53355 1430 aa22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
GREB1-209ENST00000472040 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa22.19■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.19■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa22.17■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 POGZQ7Z3K3 1410 aa22.16■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa22.16■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.15■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 ROCK1Q13464 1354 aa22.14■■□□□ 1.14
GREB1-209ENST00000472040 KDM5CP41229 1560 aa22.13■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 AFAP1Q8N556 730 aa22.13■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 CROCC2H7BZ55 1655 aa22.12■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 ADGRL2O95490 1459 aa22.12■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 PTPRKQ15262 1439 aa22.12■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.11■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 C9orf84Q5VXU9 1444 aa22.11■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 MAGI2Q86UL8 1455 aa22.1■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 RICTORQ6R327 1708 aa22.1■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 ITGAEP38570 1179 aa22.09■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.09■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.08■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 RAPGEF3O95398 923 aa22.08■■□□□ 1.13
GREB1-209ENST00000472040 NCOA1Q15788 1441 aa22.07■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 ADGBQ8N7X0 1667 aa22.04■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.04■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.04■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 PLXNC1O60486 1568 aa22.04■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 ATP7AQ04656 1500 aa22.03■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.03■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 HFM1A2PYH4 1435 aa22.03■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.03■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 KDM6BO15054 1643 aa22.02■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa22.02■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 HRCP23327 699 aa22.02■■□□□ 1.12
GREB1-209ENST00000472040 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa21.99■■□□□ 1.11
GREB1-209ENST00000472040 NAIPQ13075 1403 aa21.97■■□□□ 1.11
GREB1-209ENST00000472040 MYT1LQ9UL68 1186 aa21.97■■□□□ 1.11
GREB1-209ENST00000472040 KIF15Q9NS87 1388 aa21.97■■□□□ 1.11
GREB1-209ENST00000472040 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.97■■□□□ 1.11
GREB1-209ENST00000472040 DUOX2Q9NRD8 1548 aa21.96■■□□□ 1.11
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GREB1-209ENST00000472040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
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GREB1-209ENST00000472040 ERBINQ96RT1 1412 aa21.93■■□□□ 1.1
GREB1-209ENST00000472040 ATP10AO60312 1499 aa21.92■■□□□ 1.1
GREB1-209ENST00000472040 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.92■■□□□ 1.1
GREB1-209ENST00000472040 REREQ9P2R6 1566 aa21.91■■□□□ 1.1
GREB1-209ENST00000472040 A2MP01023 1474 aa21.9■■□□□ 1.1
GREB1-209ENST00000472040 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa21.9■■□□□ 1.1
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GREB1-209ENST00000472040 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa21.87■■□□□ 1.09
GREB1-209ENST00000472040 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
GREB1-209ENST00000472040 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.86■■□□□ 1.09
GREB1-209ENST00000472040 AGLP35573 1532 aa21.85■■□□□ 1.09
GREB1-209ENST00000472040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa21.83■■□□□ 1.09
GREB1-209ENST00000472040 PPP6R1Q9UPN7 881 aa21.79■■□□□ 1.08
GREB1-209ENST00000472040 KIF3BO15066 747 aa21.77■■□□□ 1.08
GREB1-209ENST00000472040 UNC13BO14795 1591 aa21.74■■□□□ 1.07
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