RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467128.5

USP34-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 34, human

TSL 4

Gene USP34, Length 531 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP34-208	ENST00000467128	LHX8	Q68G74	356 aa		13.83	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	UACA	Q9BZF9	1416 aa		13.81	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	ZRANB1	Q9UGI0	708 aa		13.8	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	KDM5B	Q9UGL1	1544 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	ABCA8	O94911	1581 aa		13.79	□□□□□ -0.2
USP34-208	ENST00000467128	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		13.74	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	ZCCHC11	Q5TAX3	1644 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	NPM1	P06748	294 aa	Known RBP eCLIP	13.73	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	DIP2B	Q9P265	1576 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		13.73	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	RAPGEF6	Q8TEU7	1601 aa		13.72	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	GALR2	O43603	387 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
USP34-208	ENST00000467128	UBTF	P17480	764 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	GLI2	P10070	1586 aa		13.69	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP35	Q9NRY4	1499 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	FHOD3	Q2V2M9	1422 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	ASXL2	Q76L83	1435 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	CLCN6	P51797	869 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	PROM2	Q8N271	834 aa		13.68	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	FMN1	Q68DA7	1419 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.67	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	WDR7	Q9Y4E6	1490 aa		13.66	□□□□□ -0.22
USP34-208	ENST00000467128	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		13.64	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K4	Q9Y6R4	1608 aa		13.62	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	ATP10B	O94823	1461 aa		13.61	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	P3H3	Q8IVL6	736 aa		13.6	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	CFAP43	Q8NDM7	1665 aa		13.59	□□□□□ -0.23
USP34-208	ENST00000467128	CLIP1	P30622	1438 aa		13.58	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		13.57	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	FYCO1	Q9BQS8	1478 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	ABCA9	Q8IUA7	1624 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	CASKIN1	Q8WXD9	1431 aa		13.55	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	CEP162	Q5TB80	1403 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	CCDC18	Q5T9S5	1454 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	TEX14	Q8IWB6	1497 aa		13.54	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	PAK3	O75914	559 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	MAGI3	Q5TCQ9	1506 aa		13.53	□□□□□ -0.24
USP34-208	ENST00000467128	TSPOAP1	O95153	1857 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	LRRIQ1	Q96JM4	1722 aa		13.51	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	CDK13	Q14004	1512 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.49	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	PELP1	Q8IZL8	1130 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	KDM6B	O15054	1643 aa		13.48	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	MS4A3	Q96HJ5	214 aa		13.47	□□□□□ -0.25
USP34-208	ENST00000467128	KIF14	Q15058	1648 aa		13.46	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	PLEKHD1	A6NEE1	506 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	CDK11A	Q9UQ88	783 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	CFAP74	Q9C0B2	1584 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	PHLDB1	Q86UU1	1377 aa		13.45	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	GEMIN5	Q8TEQ6	1508 aa	Known RBP eCLIP	13.44	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	ARAP3	Q8WWN8	1544 aa		13.44	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	NEO1	Q92859	1461 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	TTC37	Q6PGP7	1564 aa		13.43	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	ARID3C	A6NKF2	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	TSPYL2	Q9H2G4	693 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	OTUD5	Q96G74	571 aa		13.41	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	VPS8	Q8N3P4	1428 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	MYO5C	Q9NQX4	1742 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	KCNH8	Q96L42	1107 aa		13.4	□□□□□ -0.26
USP34-208	ENST00000467128	CCDC61	Q9Y6R9	512 aa		13.39	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	LOC105371045	A0A1W2PR82	267 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	MAP3K1	Q13233	1512 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.37	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	PREX2	Q70Z35	1606 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	13.36	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	PLCH2	O75038	1416 aa		13.36	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	ATP1B4	Q9UN42	357 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	FANCA	O15360	1455 aa		13.35	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.34	□□□□□ -0.27
USP34-208	ENST00000467128	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	CDC42BPA	Q5VT25	1732 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		13.32	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	RICTOR	Q6R327	1708 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	TRPC6	Q9Y210	931 aa		13.31	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	AKNA	Q7Z591	1439 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	POTEJ	P0CG39	1038 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	MIER1	Q8N108	512 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	KIF12	Q96FN5	646 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	ITSN2	Q9NZM3	1697 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	MTUS2	Q5JR59	1369 aa		13.3	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	METRN	Q9UJH8	293 aa		13.29	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.29	□□□□□ -0.28
USP34-208	ENST00000467128	ARHGAP5	Q13017	1502 aa		13.29	□□□□□ -0.28

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