RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 PREX2Q70Z35 1606 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa14.32□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 FANCAO15360 1455 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 TEX14Q8IWB6 1497 aa14.31□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.3□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF13AQ9H1H9 1805 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.29□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 NEO1Q92859 1461 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.28□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 CFAP74Q9C0B2 1584 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 AKNAQ7Z591 1439 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.27□□□□□ -0.12
SH3BP4-208ENST00000462602 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.26□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRL1O94910 1474 aa14.24□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.23□□□□□ -0.134e-7■■■□□ 17.7
SH3BP4-208ENST00000462602 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPOAP1O95153 1857 aa14.23□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC1P33527 1531 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 MBD5Q9P267 1494 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPY4P0CV99 314 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPY10P0CW01 314 aa14.21□□□□□ -0.13
SH3BP4-208ENST00000462602 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.2□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCC5O15440 1437 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 DAPK1P53355 1430 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ITGAEP38570 1179 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 AFAP1Q8N556 730 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 POGZQ7Z3K3 1410 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 RAPGEF3O95398 923 aa14.15□□□□□ -0.14
SH3BP4-208ENST00000462602 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 PTPRKQ15262 1439 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ROCK1Q13464 1354 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM5CP41229 1560 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGRL2O95490 1459 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 NCOA1Q15788 1441 aa14.08□□□□□ -0.15
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGI2Q86UL8 1455 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 RICTORQ6R327 1708 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 KDM6BO15054 1643 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP7AQ04656 1500 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF15Q9NS87 1388 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 HFM1A2PYH4 1435 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 PLXNC1O60486 1568 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 NAIPQ13075 1403 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.03□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.02□□□□□ -0.16
SH3BP4-208ENST00000462602 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 HRCP23327 699 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ATP10AO60312 1499 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 A2MP01023 1474 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ERBINQ96RT1 1412 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCA6Q8N139 1617 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-208ENST00000462602 KIF3BO15066 747 aa13.95□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 REREQ9P2R6 1566 aa13.94□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 AGLP35573 1532 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM52Q96A61 297 aa13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.92□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
SH3BP4-208ENST00000462602 PPP6R1Q9UPN7 881 aa13.9□□□□□ -0.18
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