RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452802.5

LMCD1-AS1-205, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LMCD1-AS1, Length 1,387 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.81■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 IQGAP2Q13576 1575 aa20.78■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 UGGT2Q9NYU1 1516 aa20.78■□□□□ 0.92
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.74■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP20.73■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DISP1Q96F81 1524 aa20.73■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.73■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PHLDB1Q86UU1 1377 aa20.72■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DMRT2Q9Y5R5 561 aa20.72■□□□□ 0.91
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KCNH8Q96L42 1107 aa20.7■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.68■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RAPGEF3O95398 923 aa20.67■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.66■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HECW1Q76N89 1606 aa20.65■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 YEATS2Q9ULM3 1422 aa20.64■□□□□ 0.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 STRCQ7RTU9 1775 aa20.63■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 P3H3Q8IVL6 736 aa20.62■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa20.62■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KIAA0556O60303 1618 aa20.6■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LTBP4Q8N2S1 1624 aa20.59■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.58■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 IQSEC2Q5JU85 1478 aa20.56■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa20.55■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SETD5Q9C0A6 1442 aa20.54■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP20.54■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NCOA2Q15596 1464 aa20.54■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MYOM3Q5VTT5 1437 aa20.53■□□□□ 0.88
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.52■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa20.51■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PREX1Q8TCU6 1659 aa20.5■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.5■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa20.5■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PTPRTO14522 1441 aa20.48■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NEO1Q92859 1461 aa20.46■□□□□ 0.87
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 POGZQ7Z3K3 1410 aa20.44■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa20.44■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ABCA8O94911 1581 aa20.43■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FANCAO15360 1455 aa20.43■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa20.43■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MIA2Q96PC5 1412 aa20.43■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HFM1A2PYH4 1435 aa20.42■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ABCA9Q8IUA7 1624 aa20.42■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.42■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 AKNAQ7Z591 1439 aa20.41■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 UBAP1LF5GYI3 381 aa20.4■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MLECQ14165 292 aa20.4■□□□□ 0.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PTPRKQ15262 1439 aa20.36■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.35■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RICTORQ6R327 1708 aa20.34■□□□□ 0.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 GCC2Q8IWJ2 1684 aa20.32■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa20.32■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HSPA1LP34931 641 aa20.32■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NAIPQ13075 1403 aa20.3■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa20.3■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARID3CA6NKF2 412 aa20.29■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.28■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa20.27■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ITGAEP38570 1179 aa20.27■□□□□ 0.84
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ATP10BO94823 1461 aa20.25■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP20.25■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NCOA1Q15788 1441 aa20.24■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ROCK1Q13464 1354 aa20.21■□□□□ 0.83
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.2■□□□□ 0.82
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MAGI2Q86UL8 1455 aa20.17■□□□□ 0.82
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DAPK1P53355 1430 aa20.14■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PIP4K2BP78356 416 aa20.13■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa20.11■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ABCC5O15440 1437 aa20.1■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KIF14Q15058 1648 aa20.1■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ADGRL2O95490 1459 aa20.09■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.09■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ATP10AO60312 1499 aa20.09■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.09■□□□□ 0.81
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa20.07■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 C3P01024 1663 aa20.07■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.06■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa20.06■□□□□ 0.8
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms