RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452802.5

LMCD1-AS1-205, LMCD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene LMCD1-AS1, Length 1,387 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP30.71■■■□□ 2.51
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.45■■■□□ 2.47
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ABCC9O60706 1549 aa28.79■■■□□ 2.2
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.67■■■□□ 2.18
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DNAJC5BQ9UF47 199 aa28.34■■■□□ 2.13
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.33■■□□□ 1.97
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa26.94■■□□□ 1.9
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa26.7■■□□□ 1.86
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.59■■□□□ 1.85
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NACADO15069 1562 aa26.18■■□□□ 1.78
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.12■■□□□ 1.77
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.09■■□□□ 1.77
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.06■■□□□ 1.76
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.91■■□□□ 1.74
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.74■■□□□ 1.71
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa25.48■■□□□ 1.67
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.37■■□□□ 1.65
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa25.35■■□□□ 1.65
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CUX2O14529 1486 aa25.33■■□□□ 1.65
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TRIM41Q8WV44 630 aa25.18■■□□□ 1.62
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ERCC6Q03468 1493 aa24.9■■□□□ 1.58
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SCRIBQ14160 1630 aa24.89■■□□□ 1.57
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FOXD1Q16676 465 aa24.53■■□□□ 1.52
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NESP48681 1621 aa24.37■■□□□ 1.49
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 NCAPD3P42695 1498 aa24.23■■□□□ 1.47
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP24.13■■□□□ 1.45
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SMARCA2P51531 1590 aa24.09■■□□□ 1.45
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.98■■□□□ 1.43
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.93■■□□□ 1.42
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 OSCARQ8IYS5 282 aa23.91■■□□□ 1.42
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HMGXB3Q12766 1538 aa23.91■■□□□ 1.42
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.86■■□□□ 1.41
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.82■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23.77■■□□□ 1.4
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 WDR62O43379 1518 aa23.7■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MRC2Q9UBG0 1479 aa23.69■■□□□ 1.38
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TRHP20396 242 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARHGEF11O15085 1522 aa23.61■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SMARCA4P51532 1647 aa23.58■■□□□ 1.37
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 POTEDQ86YR6 584 aa23.54■■□□□ 1.36
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.5■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.49■■□□□ 1.35
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CADPSQ9ULU8 1353 aa23.42■■□□□ 1.34
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.36■■□□□ 1.33
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ARAP1Q96P48 1450 aa23.32■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.3■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 WIZO95785 1651 aa23.29■■□□□ 1.32
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FANCD2Q9BXW9 1451 aa23.17■■□□□ 1.3
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MSH5O43196 834 aa23.09■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.98■■□□□ 1.27
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 IFT140Q96RY7 1462 aa22.89■■□□□ 1.26
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CHD1O14646 1710 aa22.88■■□□□ 1.25
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CFTRP13569 1480 aa22.88■■□□□ 1.25
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.86■■□□□ 1.25
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FBLN2P98095 1184 aa22.72■■□□□ 1.23
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.66■■□□□ 1.22
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CLASP1Q7Z460 1538 aa22.65■■□□□ 1.22
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TOPBP1Q92547 1522 aa22.58■■□□□ 1.21
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa22.57■■□□□ 1.2
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa22.55■■□□□ 1.2
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.53■■□□□ 1.2
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 GAPVD1Q14C86 1478 aa22.49■■□□□ 1.19
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ABCC8Q09428 1581 aa22.47■■□□□ 1.19
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 PRDM2Q13029 1718 aa22.43■■□□□ 1.18
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SYNJ1O43426 1573 aa22.42■■□□□ 1.18
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 EEA1Q15075 1411 aa22.39■■□□□ 1.18
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa22.38■■□□□ 1.17
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ADRA2BP18089 450 aa22.37■■□□□ 1.17
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.35■■□□□ 1.17
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.34■■□□□ 1.17
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.16
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa22.24■■□□□ 1.15
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 ERCC6L2Q5T890 1561 aa22.24■■□□□ 1.15
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa22.18■■□□□ 1.14
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.18■■□□□ 1.14
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 TOP2BQ02880 1626 aa22.18■■□□□ 1.14
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SYNJ2O15056 1496 aa22.17■■□□□ 1.14
LMCD1-AS1-205ENST00000452802 SOGA1O94964 1423 aa22.17■■□□□ 1.14
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