RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP15.73■□□□□ 0.11
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TTC37Q6PGP7 1564 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.71■□□□□ 0.11
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GLI2P10070 1586 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DIP2BQ9P265 1576 aa15.7■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHLDB1Q86UU1 1377 aa15.69■□□□□ 0.1
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGAP5Q13017 1502 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CD109Q6YHK3 1445 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MIA2Q96PC5 1412 aa15.67■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.66■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.66■□□□□ 0.1
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLCH2O75038 1416 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFAP74Q9C0B2 1584 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa15.64■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRHP20396 242 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TEX14Q8IWB6 1497 aa15.62■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FANCAO15360 1455 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF13AQ9H1H9 1805 aa15.61■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa15.6■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa15.59■□□□□ 0.09
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.58■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NEO1Q92859 1461 aa15.57■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPOAP1O95153 1857 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa15.55■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NPM3O75607 178 aaKnown RBP15.55■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRL1O94910 1474 aa15.54■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCC1P33527 1531 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AKNAQ7Z591 1439 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYCP2Q9BX26 1530 aa15.53■□□□□ 0.08
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RSPH4AQ5TD94 716 aa15.51■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CCDC141Q6ZP82 1450 aa15.5■□□□□ 0.07
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGEF5Q12774 1597 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ITGAEP38570 1179 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.49■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DAPK1P53355 1430 aa15.48■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPY4P0CV99 314 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TSPY10P0CW01 314 aa15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP15.47■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.46■□□□□ 0.07
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SHANK2Q9UPX8 1470 aa15.46■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CROCC2H7BZ55 1655 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POGZQ7Z3K3 1410 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MBD5Q9P267 1494 aa15.45■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCC5O15440 1437 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MYT1LQ9UL68 1186 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.43■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PCGF6Q9BYE7 350 aa15.42■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.42■□□□□ 0.06
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGBQ8N7X0 1667 aa15.41■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAST1Q9Y2H9 1570 aa15.4■□□□□ 0.06
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHIC2Q9UKJ5 165 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KDM5CP41229 1560 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KDM6BO15054 1643 aa15.39■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ROCK1Q13464 1354 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RICTORQ6R327 1708 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HECW2Q9P2P5 1572 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AFAP1Q8N556 730 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ATP7AQ04656 1500 aa15.38■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.37■□□□□ 0.05
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADGRL2O95490 1459 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.37■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PLXNC1O60486 1568 aa15.36■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP15.36■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PTPRKQ15262 1439 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa15.35■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF15Q9NS87 1388 aa15.34■□□□□ 0.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 HFM1A2PYH4 1435 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 NCOA1Q15788 1441 aa15.33■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa15.32■□□□□ 0.04
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.32■□□□□ 0.04
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