RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429798.1

LIMD1-AS1-202, LIMD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene LIMD1-AS1, Length 955 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.77■■□□□ 1.4
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1.01
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa19.73■□□□□ 0.75
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CECR2Q9BXF3 1484 aa18.56■□□□□ 0.56
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SMARCA2P51531 1590 aa18.35■□□□□ 0.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa18.34■□□□□ 0.53
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PEG3Q9GZU2 1588 aa18.3■□□□□ 0.52
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CADPSQ9ULU8 1353 aa17.72■□□□□ 0.43
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa17.7■□□□□ 0.42
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CFTRP13569 1480 aa17.69■□□□□ 0.42
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PRDM2Q13029 1718 aa17.63■□□□□ 0.41
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FANCD2Q9BXW9 1451 aa17.54■□□□□ 0.4
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOPBP1Q92547 1522 aa17.28■□□□□ 0.36
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TOP2BQ02880 1626 aa17.28■□□□□ 0.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SYNJ1O43426 1573 aa17.28■□□□□ 0.36
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa17.27■□□□□ 0.36
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CUX2O14529 1486 aa17.14■□□□□ 0.33
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SOGA1O94964 1423 aa17.12■□□□□ 0.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IFT140Q96RY7 1462 aa17.11■□□□□ 0.33
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa17.05■□□□□ 0.32
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa17.05■□□□□ 0.32
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LIMD1-AS1-202ENST00000429798 WDR97A6NE52 1622 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF27Q86VH2 1401 aa17.01■□□□□ 0.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EEA1Q15075 1411 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GAPVD1Q14C86 1478 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP16.9■□□□□ 0.3
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 GRIN2BQ13224 1484 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 PBRM1Q86U86 1689 aa16.88■□□□□ 0.29
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ERICH3Q5RHP9 1530 aa16.87■□□□□ 0.29
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa16.86■□□□□ 0.29
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CUL7Q14999 1698 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CSRNP3Q8WYN3 585 aa16.83■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP16.8■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 IGF1RP08069 1367 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa16.8■□□□□ 0.28
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 ADAMTS12P58397 1594 aa16.77■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa16.77■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 FHAD1B1AJZ9 1412 aa16.76■□□□□ 0.27
LIMD1-AS1-202ENST00000429798 KIF21BO75037 1637 aa16.74■□□□□ 0.27
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