RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418576.3

SEMA3B-202, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SEMA3B, Length 1,765 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-202ENST00000418576 PHLDB1Q86UU1 1377 aa28.61■■■□□ 2.17
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SEMA3B-202ENST00000418576 CFAP74Q9C0B2 1584 aa28.59■■■□□ 2.17
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SEMA3B-202ENST00000418576 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa28.3■■■□□ 2.12
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SEMA3B-202ENST00000418576 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.25■■■□□ 2.11
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SEMA3B-202ENST00000418576 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.24■■■□□ 2.11
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SEMA3B-202ENST00000418576 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP28.22■■■□□ 2.11
SEMA3B-202ENST00000418576 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.21■■■□□ 2.11
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SEMA3B-202ENST00000418576 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa28.07■■■□□ 2.08
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SEMA3B-202ENST00000418576 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.07■■■□□ 2.08
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SEMA3B-202ENST00000418576 CROCC2H7BZ55 1655 aa28.05■■■□□ 2.08
SEMA3B-202ENST00000418576 ATP10AO60312 1499 aa28.05■■■□□ 2.08
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SEMA3B-202ENST00000418576 ABCA6Q8N139 1617 aa28.01■■■□□ 2.07
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SEMA3B-202ENST00000418576 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.97■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 ADGRL2O95490 1459 aa27.96■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 A2MP01023 1474 aa27.96■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 PLXNC1O60486 1568 aa27.96■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 NCOA1Q15788 1441 aa27.96■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.07
SEMA3B-202ENST00000418576 ROCK1Q13464 1354 aa27.95■■■□□ 2.06
SEMA3B-202ENST00000418576 ADGBQ8N7X0 1667 aa27.95■■■□□ 2.06
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF15Q9NS87 1388 aa27.94■■■□□ 2.06
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SEMA3B-202ENST00000418576 REREQ9P2R6 1566 aa27.93■■■□□ 2.06
SEMA3B-202ENST00000418576 DUOX2Q9NRD8 1548 aa27.9■■■□□ 2.06
SEMA3B-202ENST00000418576 AGLP35573 1532 aa27.86■■■□□ 2.05
SEMA3B-202ENST00000418576 ERBINQ96RT1 1412 aa27.84■■■□□ 2.05
SEMA3B-202ENST00000418576 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP27.83■■■□□ 2.05
SEMA3B-202ENST00000418576 KIF3BO15066 747 aa27.82■■■□□ 2.04
SEMA3B-202ENST00000418576 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.8■■■□□ 2.04
SEMA3B-202ENST00000418576 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa27.8■■■□□ 2.04
SEMA3B-202ENST00000418576 MLECQ14165 292 aa27.8■■■□□ 2.04
SEMA3B-202ENST00000418576 HFM1A2PYH4 1435 aa27.77■■■□□ 2.04
SEMA3B-202ENST00000418576 GGT6Q6P531 493 aa27.76■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP27.76■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 NAIPQ13075 1403 aa27.75■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.72■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 PPP6R1Q9UPN7 881 aa27.71■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP27.71■■■□□ 2.03
SEMA3B-202ENST00000418576 GCC2Q8IWJ2 1684 aa27.68■■■□□ 2.02
SEMA3B-202ENST00000418576 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.66■■■□□ 2.02
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