RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000405636.6

TOMM40-202, Transcript of translocase of outer mitochondrial membrane 40, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOMM40, Length 1,709 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM40-202ENST00000405636 FAM69CQ0P6D2 419 aa39.85■■■■□ 3.97
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TOMM40-202ENST00000405636 GLI2P10070 1586 aa39.84■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 KIF13AQ9H1H9 1805 aa39.82■■■■□ 3.97
TOMM40-202ENST00000405636 PCGF6Q9BYE7 350 aa39.82■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 CD109Q6YHK3 1445 aa39.8■■■■□ 3.96
TOMM40-202ENST00000405636 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa39.8■■■■□ 3.96
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TOMM40-202ENST00000405636 ARAP3Q8WWN8 1544 aa39.72■■■■□ 3.95
TOMM40-202ENST00000405636 TSPOAP1O95153 1857 aa39.7■■■■□ 3.95
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TOMM40-202ENST00000405636 DAPK1P53355 1430 aa39.52■■■■□ 3.92
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TOMM40-202ENST00000405636 TEX14Q8IWB6 1497 aa39.41■■■■□ 3.9
TOMM40-202ENST00000405636 AFAP1Q8N556 730 aa39.34■■■■□ 3.89
TOMM40-202ENST00000405636 C9orf84Q5VXU9 1444 aa39.32■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 SHANK2Q9UPX8 1470 aa39.3■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 POGZQ7Z3K3 1410 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 ADGBQ8N7X0 1667 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 RSPH4AQ5TD94 716 aa39.28■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 TSPY4P0CV99 314 aa39.27■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 TSPY10P0CW01 314 aa39.27■■■■□ 3.88
TOMM40-202ENST00000405636 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa39.26■■■■□ 3.88
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TOMM40-202ENST00000405636 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa39.23■■■■□ 3.87
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TOMM40-202ENST00000405636 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa39.17■■■■□ 3.86
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TOMM40-202ENST00000405636 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP39.16■■■■□ 3.86
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TOMM40-202ENST00000405636 MYT1LQ9UL68 1186 aa39.11■■■■□ 3.85
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TOMM40-202ENST00000405636 ATP10AO60312 1499 aa38.72■■■■□ 3.79
TOMM40-202ENST00000405636 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa38.68■■■■□ 3.78
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TOMM40-202ENST00000405636 KIF3BO15066 747 aa38.67■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 UNC13BO14795 1591 aa38.66■■■■□ 3.78
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TOMM40-202ENST00000405636 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP38.64■■■■□ 3.78
TOMM40-202ENST00000405636 DEPDC5O75140 1603 aa38.6■■■■□ 3.77
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