RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380298.2

SLC22A23-201, Transcript of solute carrier family 22 member 23, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC22A23, Length 1,574 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGAP5Q13017 1502 aa42.61■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 NEO1Q92859 1461 aa42.6■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 ITSN2Q9NZM3 1697 aa42.6■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa42.6■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 PHLDB1Q86UU1 1377 aa42.59■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP42.59■■■■■ 4.41
SLC22A23-201ENST00000380298 CFAP74Q9C0B2 1584 aa42.56■■■■■ 4.4
SLC22A23-201ENST00000380298 MYOM3Q5VTT5 1437 aa42.55■■■■■ 4.4
SLC22A23-201ENST00000380298 AKNAQ7Z591 1439 aa42.5■■■■■ 4.39
SLC22A23-201ENST00000380298 MIA2Q96PC5 1412 aa42.48■■■■■ 4.39
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP42.44■■■■■ 4.39
SLC22A23-201ENST00000380298 ADGRL1O94910 1474 aa42.4■■■■■ 4.38
SLC22A23-201ENST00000380298 FGD6Q6ZV73 1430 aa42.38■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa42.38■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa42.37■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 SCAPERQ9BY12 1400 aa42.34■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa42.34■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP42.33■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCC1P33527 1531 aa42.33■■■■■ 4.37
SLC22A23-201ENST00000380298 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP42.3■■■■■ 4.36
SLC22A23-201ENST00000380298 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa42.3■■■■■ 4.36
SLC22A23-201ENST00000380298 KDM6BO15054 1643 aa42.3■■■■■ 4.36
SLC22A23-201ENST00000380298 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP42.29■■■■■ 4.36
SLC22A23-201ENST00000380298 PTPN23Q9H3S7 1636 aa42.26■■■■■ 4.36
SLC22A23-201ENST00000380298 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP42.24■■■■■ 4.35
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa42.24■■■■■ 4.35
SLC22A23-201ENST00000380298 SYCP2Q9BX26 1530 aa42.23■■■■■ 4.35
SLC22A23-201ENST00000380298 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP42.22■■■■■ 4.352e-6■■■■□ 22.4
SLC22A23-201ENST00000380298 POGZQ7Z3K3 1410 aa42.21■■■■■ 4.35
SLC22A23-201ENST00000380298 RAPGEF3O95398 923 aa42.2■■■■■ 4.35
SLC22A23-201ENST00000380298 RSPH4AQ5TD94 716 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 MBD5Q9P267 1494 aa42.19■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa42.17■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.16■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa42.15■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 RICTORQ6R327 1708 aa42.15■■■■■ 4.34
SLC22A23-201ENST00000380298 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.13■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 AFAP1Q8N556 730 aa42.13■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.12■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGEF5Q12774 1597 aa42.12■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa42.11■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 CCDC141Q6ZP82 1450 aa42.08■■■■■ 4.33
SLC22A23-201ENST00000380298 KDM5CP41229 1560 aa42.07■■■■■ 4.32
SLC22A23-201ENST00000380298 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa42.04■■■■■ 4.32
SLC22A23-201ENST00000380298 MAGI2Q86UL8 1455 aa42■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TSPY4P0CV99 314 aa42■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 TSPY10P0CW01 314 aa42■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP41.99■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 MLH3Q9UHC1 1453 aa41.99■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.98■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCC5O15440 1437 aa41.97■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 DAPK1P53355 1430 aa41.97■■■■■ 4.31
SLC22A23-201ENST00000380298 HECW2Q9P2P5 1572 aa41.93■■■■■ 4.3
SLC22A23-201ENST00000380298 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa41.92■■■■■ 4.3
SLC22A23-201ENST00000380298 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.91■■■■■ 4.3
SLC22A23-201ENST00000380298 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.9■■■■■ 4.3
SLC22A23-201ENST00000380298 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.87■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 C9orf84Q5VXU9 1444 aa41.87■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 ATP7AQ04656 1500 aa41.86■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa41.86■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.86■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa41.84■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.82■■■■■ 4.29
SLC22A23-201ENST00000380298 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa41.8■■■■■ 4.28
SLC22A23-201ENST00000380298 ITGAEP38570 1179 aa41.78■■■■■ 4.28
SLC22A23-201ENST00000380298 PTPRKQ15262 1439 aa41.76■■■■■ 4.28
SLC22A23-201ENST00000380298 ATP10AO60312 1499 aa41.74■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.74■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.73■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 ABCA6Q8N139 1617 aa41.72■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.71■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 ADGRL2O95490 1459 aa41.71■■■■■ 4.27
SLC22A23-201ENST00000380298 PLXNC1O60486 1568 aa41.69■■■■■ 4.26
SLC22A23-201ENST00000380298 NCOA1Q15788 1441 aa41.68■■■■■ 4.26
SLC22A23-201ENST00000380298 ROCK1Q13464 1354 aa41.68■■■■■ 4.26
SLC22A23-201ENST00000380298 ADGBQ8N7X0 1667 aa41.66■■■■■ 4.26
SLC22A23-201ENST00000380298 REREQ9P2R6 1566 aa41.63■■■■■ 4.26
SLC22A23-201ENST00000380298 A2MP01023 1474 aa41.62■■■■■ 4.25
SLC22A23-201ENST00000380298 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.61■■■■■ 4.25
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF15Q9NS87 1388 aa41.61■■■■■ 4.25
SLC22A23-201ENST00000380298 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.59■■■■■ 4.25
SLC22A23-201ENST00000380298 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.56■■■■■ 4.24
SLC22A23-201ENST00000380298 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
SLC22A23-201ENST00000380298 AGLP35573 1532 aa41.51■■■■■ 4.24
SLC22A23-201ENST00000380298 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP41.47■■■■■ 4.23
SLC22A23-201ENST00000380298 ERBINQ96RT1 1412 aa41.47■■■■■ 4.23
SLC22A23-201ENST00000380298 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa41.43■■■■■ 4.22
SLC22A23-201ENST00000380298 HFM1A2PYH4 1435 aa41.42■■■■■ 4.22
SLC22A23-201ENST00000380298 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.42■■■■■ 4.22
SLC22A23-201ENST00000380298 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.39■■■■■ 4.22
SLC22A23-201ENST00000380298 NAIPQ13075 1403 aa41.39■■■■■ 4.22
SLC22A23-201ENST00000380298 KIF3BO15066 747 aa41.37■■■■■ 4.21
SLC22A23-201ENST00000380298 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.36■■■■■ 4.21
SLC22A23-201ENST00000380298 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.33■■■■■ 4.21
SLC22A23-201ENST00000380298 MLECQ14165 292 aa41.27■■■■■ 4.2
SLC22A23-201ENST00000380298 GGT6Q6P531 493 aa41.26■■■■■ 4.2
SLC22A23-201ENST00000380298 PPP6R1Q9UPN7 881 aa41.25■■■■■ 4.19
SLC22A23-201ENST00000380298 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.23■■■■■ 4.19
SLC22A23-201ENST00000380298 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.23■■■■■ 4.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms