RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379915.4

AC009690.1-201, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene AC009690.1, Length 4,374 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009690.1-201ENST00000379915 TOPBP1Q92547 1522 aa18.5■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 FOXD1Q16676 465 aa18.5■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa18.49■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 FMN1Q68DA7 1419 aa18.48■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 GAPVD1Q14C86 1478 aa18.48■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP18.47■□□□□ 0.554e-7■■■■□ 22.1
AC009690.1-201ENST00000379915 NEUROD2Q15784 382 aa18.46■□□□□ 0.55
AC009690.1-201ENST00000379915 CCER2I3L3R5 266 aa18.45■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.44■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.44■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa18.43■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 FANCIQ9NVI1 1328 aa18.42■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
AC009690.1-201ENST00000379915 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 BRPF3Q9ULD4 1205 aa18.39■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 GSE1Q14687 1217 aa18.37■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.37■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.36■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 MSNP26038 577 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 RGL3Q3MIN7 710 aa18.35■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 DNMBPQ6XZF7 1577 aa18.34■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 PKNOX2Q96KN3 472 aa18.33■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 RSPH6AQ9H0K4 717 aa18.33■□□□□ 0.53
AC009690.1-201ENST00000379915 TSPY4P0CV99 314 aa18.32■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 TSPY10P0CW01 314 aa18.32■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 CHGAP10645 457 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.3■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa18.3■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 TIAM1Q13009 1591 aa18.29■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 MSH5O43196 834 aa18.29■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP18.29■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa18.28■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 FGD6Q6ZV73 1430 aa18.27■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 PDE4AP27815 886 aa18.27■□□□□ 0.52
AC009690.1-201ENST00000379915 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa18.26■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.25■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 RCAN3Q9UKA8 241 aa18.25■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 JPH4Q96JJ6 628 aa18.25■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP18.24■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.23■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.22■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 USP35Q9P2H5 1018 aa18.21■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 CCDC18Q5T9S5 1454 aa18.21■□□□□ 0.51
AC009690.1-201ENST00000379915 PLIN1O60240 522 aa18.21■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 FOXD4L1Q9NU39 408 aa18.2■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 NCOA2Q15596 1464 aa18.2■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 FYCO1Q9BQS8 1478 aa18.2■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 HSCBQ8IWL3 235 aa18.19■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 L3MBTL2Q969R5 705 aa18.19■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 EXOC6Q8TAG9 804 aa18.18■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.18■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 MYOM3Q5VTT5 1437 aa18.17■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 NUDCQ9Y266 331 aa18.16■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa18.15■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 FAM13BQ9NYF5 915 aa18.14■□□□□ 0.5
AC009690.1-201ENST00000379915 PKD2Q13563 968 aa18.14■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 NFKBIBQ15653 356 aa18.13■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.495e-7■■■■□ 22.7
AC009690.1-201ENST00000379915 GRIN2BQ13224 1484 aa18.12■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 TAOK2Q9UL54 1235 aa18.12■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 EFCAB5A4FU69 1503 aa18.12■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.12■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 MRC2Q9UBG0 1479 aa18.11■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa18.1■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.1■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
AC009690.1-201ENST00000379915 PRDM2Q13029 1718 aa18.07■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.05■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 CLUAP1Q96AJ1 413 aa18.05■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa18.04■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.04■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 WDR97A6NE52 1622 aa18.04■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 UACAQ9BZF9 1416 aa18.03■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 APBB1O00213 710 aa18.02■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 NUP155O75694 1391 aa18.02■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 CUL7Q14999 1698 aa18.02■□□□□ 0.48
AC009690.1-201ENST00000379915 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP18.01■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 PTPRKQ15262 1439 aa18■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 GBP4Q96PP9 640 aa18■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
AC009690.1-201ENST00000379915 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms